| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 2,873 |
| تعداد مقالات | 32,555 |
| تعداد مشاهده مقاله | 42,417,987 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 19,193,839 |
بررسی کاربرد توالییابی ناحیه کنترلی (D loop) DNA میتوکندریایی در مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیتهای تاسماهی ایرانی (Acipenser persicus, Borodin, 1897) دریای خزر | ||
| مجله علمی شیلات ایران | ||
| مقاله 6، دوره 29، شماره 1، فروردین و اردیبهشت 1399، صفحه 59-70 اصل مقاله (838.97 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/isfj.2020.120978 | ||
| نویسندگان | ||
| سجاد نظری؛ محمد پورکاظمی؛ مجیدرضا خوش خلق | ||
| چکیده | ||
| هدف از تحقیق حاضر بررسی تعیین ساختار ژنتیک جمعیت تاسماهی ایرانی (Acipenser persicus) دریای خزر با روش توالییابی قطعه ناحیه کنترلیDNA میتوکندریایی بود. برای این منظور، تعداد 45 نمونه باله تاسماهی ایرانی از آبهای ساحلی مناطق مختلف دریای خزر جمعآوری گردید. ناحیه کنترلی با استفاده از روش PCR تکثیر و توالییابی با استفاده از روش استاندارد انجام پذیرفت. تعداد 12هاپلوتیپ متفاوت در بین نمونههای بررسی شده، مشاهده گردید. تنوع هاپلوتایپی و نوکلئوتیدی در نمونهها بهترتیب برابر با 037/0 ± 795/0 و 0046/0 ± 0062/0 بدست آمد. بیشترین تعداد هاپلوتایپ (7 عدد) در بین نمونههای رودخانه سفیدرود بود که از این تعداد 3 هاپلوتایپ A، B و E اختصاصی بوده و در سایر مناطق مشاهده نشدند. نتایج تجزیه و تحلیل شاخص تثبیت (FST)بر اساس روش دوپارامتری و آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA) نشان داد که نمونههای رودخانه سفیدرود با نمونههای مناطق روسیه و آذربایجان اختلاف معنیداری دارند (001/0 > P) و در نهایت وجود سه جمعیت شناسایی گردید. با توجه به تنوع بالای موجود درناحیه کنترلی، توالی این ناحیه میتواند به عنوان یک نشانگر مناسب برای شناسایی و تعیین واحدهای حفاظتی و مدیریتی ذخایر جمعیتهای احتمالی تاسماهی ایرانی به کار گرفته شود و همچنین می تواند اطلاعات ارزشمندی از کاربرد روشهای مولکولی را به منظور ژنتیک حفاظت این گونه ارائه نماید. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| تاسماهی ایرانی؛ Acipenser persicus؛ توالی یابی؛ DNA میتوکندریایی؛ دریای خزر | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Application of mitochondrial DNA sequences of the control region in genetic variability of Persian sturgeon (Acipenser percicus) Populations from the Caspian Sea | ||
| نویسندگان [English] | ||
| S. Nazari؛ M. Pourkazemi؛ M. Khoshkholgh | ||
| چکیده [English] | ||
| Direct mitochondrial DNA (mtDNA) control region sequencing analysis was used to investigate population genetic structure of Persian sturgeon(Acipenser persicus) in the Caspian Sea. A total of 45 specimens were collected from different locations of the Caspian Sea. mtDNA control region was amplified using PCR. Direct sequencing was performed according to a standard method. The results showed that 12 haplotypes were observed among 45 samples in the method. The highest numbers of haplotypes were observed in the Sefidrud River in which 3 haplotypes A, B and E among them were specific for the river and were not observed in the other locations. The average haplotype diversity (h) and nucleotide diversity (π) were 0.795±0.037 and 0.0062±0.0046, for control region sequencing, respectively. The results of Fst based on kimura- 2 parameters method and analysis of molecular variance (AMOVA) demonstrated that most variations occurred among the samples, and between samples of the Sefidrud and Russia and Azerbaijan are statistically significant (P<0.0001). Therefore, three distinct populations including Sefidrud, Russia and Azerbaijan were identified. As mtDNA control region is a highly variable segment, it may be used as a potential marker for identifying populations and for determining their management and conservation units, leading to the useful application of molecular markers in investigating conservation genetics of the Persian sturgeon. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Acipenser persicus؛ mitochondrial DNA؛ genetic variation, Caspian Sea | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 211 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 129 |
||