| تعداد نشریات | 283 |
| تعداد نشریات سازمان | 81 |
| تعداد شماره‌ها | 2,729 |
| تعداد مقالات | 31,083 |
| تعداد مشاهده مقاله | 29,336,179 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 16,370,617 |
مطالعه تنگنا و تنوع ژنتیکی در جمعیت بز رائینی بوسیله نشانگرهای ریزماهواره | ||
| علوم دامی | ||
| مقاله 7، دوره 27، شماره 103، شهریور 1393، صفحه 61-70 اصل مقاله (1017.32 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/asj.2014.100461 | ||
| نویسندگان | ||
| بیژن محمودی* 1؛ مرتضی دلیری2؛ رامین حبیبی3 | ||
| 1دانشجوی دکترای تخصصی، دانشگاه دولتی باکو | ||
| 2استادیار، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فن آوری | ||
| 3دانشجوی دکترای تخصصی، دانشگاه زابل | ||
| چکیده | ||
| مطالعه حاضر به منظور تجزیه و تحلیل ژنتیکی در جمعیت بزهای رائینی کرمان جهت حفاظت، برنامه ریزی پایدار و بهره برداری، که نهایتا میتواند منجر به بهبود وضعیت امرار معاش پروش دهندگان شود، انجام شده است. جمعیتهای بز ایران به عنوان یکی از ذخایر ارزشمند منابع بزهای جهان شناخته شدهاند. مطالعه تنوع ژنتیکی در جمعیت بز رائینی با استفاده از سیزده نشانگر ریزماهواره انجام شد. در 60 بز نمونهبرداری شده، تعداد کل آللهای مشاهده شده 92 آلل با میانگین 08/7 آلل در هر جایگاه و دامنه بین 4 آلل در ریزماهواره MAF64 و 10 آلل در ریزماهواره BM121 برآورد گردید. مقادیر هتروزایگوتی مشاهده شده، محتوای اطلاعات چندشکلی، شاخص شانون و هتروزیگوتی مورد انتظار به ترتیب 808/0، 76/0، 72/1و 796/0 برآورد گردید که نشان دهنده وجود تنوع ژنتیکی بالا در این جمعیت میباشد. پنج جایگاه از سیزده جایگاه مورد مطالعه در تعادل هاردی واینبرگ بود. میانگین همخونی (Fis) برابر 016/0- بود و از 13 جایگاه فقط چهار جایگاه دارای Fis مثبت و بقیه منفی بودند. فرضیه وجود تنگنای ژنتیکی مورد آزمون قرار گرفت که نتیجه نشان از عدم وجود تنگنای ژنتیکی برای جمعیت مذکور در سالهای اخیر را تایید کرد. | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Genetic variability and bottleneck analysis in Raeini goat population by microsatellite markers | ||
| نویسندگان [English] | ||
| bizhan mahmoudi1؛ Morteza Daliri2؛ ramin Habibi3 | ||
| چکیده [English] | ||
| Assessing genetic biodiversity and population structure of minor populations through the information provided by neutral molecular markers, allows determination of their extinction risk and to design strategies for their management and conservation. Analysis of microsatellite loci is known to be highly informative in the reconstruction of the historical processes underlying the evolution and differentiation of animal populations. Iranian goat populations are recognized as an invaluable component of the world’s goat genetic resources. The aim of this work is to study the genetic status of Raeini goat population through the analysis of molecular data from 13 microsatellites markers. The mean expected heterozygosity across loci within populations ranged from 0.716 to 0.852. Genetic diversity measures revealed a good status of biodiversity in the Raeini goat population. The observed number of alleles ranged from 4 (ILSTS022) to 10 (BM121) with a total of 92 alleles and mean of 7.08 alleles across loci. The overall heterozygosity, PIC and Shannon index values were 0.808, 0.76 and 1.719 indicating high genetic diversity. Only 5 out of 13 loci were in Hardy-Weinberg equilibrium. The mean Fis was -0.016. Only 4 loci had positive Fis values and 9 loci had negative values. Genetic bottleneck hypotheses were also explored. Our data suggest that the Raeini goats have not experienced a genetic bottleneck in the recent past. | ||
| مراجع | ||
|
1- جوانروح علی آباد، ع.، اسماعیل خانیان، س.، دین پرست، ن. و واعظ ترشیزی، ر. 1383. تنوع ژنتیکی شش توده بز بومی ایران با استفاده از نشانگرهای RAPD. پژوهش و سازندگی در امور دام وآبزیان. 64: 12-17. 2- عسکری، ن.، محمد آبادی، م.، بیگی نصیر، م. ت.، باقی زاده، الف. و فیاضی، ج.1388. مطالعه تنوع ژنتیکی بز کرکی رایینی بر اساس نشانگر های ریز ماهواره. مجله کشاورزی. 4 (18): 155-161. 3- Aggarwal, R., Dixit, S.P., Verma, N.K., Ahlawat, S., Kumar, Y., Kumar, S., Chander, R. and Singh, K.P. (2007). Population genetics analysis of Mehsana goat based on microsatellite markers. Current science. 92:1133-1137.
4- Agha, S.H., Pilla, F., Galal, S., Shaat, I., D'Andrea, M., Reale, S., Abdelsalman, A.Z. and Li, M.H. (2008). Genetic diversity in Egyptian and Italian goat breeds measured with microsatellite polymorphism. Journal of Animal Breeding and Genetics. 125:194-200.
5- Barker, J.S.F. (1994). A global protocol for determining genetic distances among domestic livestock breeds. Proceedings of the 5th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production. University of Guelph , Guelph canada , 21:501-508.
6- Barker, J.S.F., Tan, S.G., Moore, S.S., Mukherjee, T.K., Matheson, J.L., Selvaraj, O.S. (2001). Genetic variation within and relationships among populations of Asian goats (Capra hircus). Journal of Animal Breeding and Genetics. 118:213-234.
7- Botstein, D., White, R.L., Skolnick, M. (1980). Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. American Journal of Human Genetic. 32:314-331.
8- Bruno-de-Sousa, C., Martinez, A.M., Ginja, C., Santos-Silva, F., Carolino, M.I., Delgado, J.V. and Gama, L.T. (2011). Genetic diversity and population structure in Portuguese goat breeds, Livestock Science. 135:131-139.
9- Canon, J., Garcia, D., Garcia-Atance, M.A., Obexer- Ruff, G., Lenstra, J.A., Ajmone-Marsan, P., Dunner, S. and Econogene Consortium. (2006). Geographical partitioning of goat diversity in Europe and the Middle East. Animal Genetics. 37:327-334.
10- Cornuet, J.M. and Luikart, G. (1996). Description and power analysis of two tests for detecting recent population bottlenecks from allele frequency data. Genetics. 144:2001-2014.
11- Fatima, S., Bhong, C.D., Rank, D.N. and Joshi, C.G. (2008). Genetic variability and bottleneck studies in Zalawadi Gohilwadi and Surti goat breeds of Gujarat (India) using microsatellites. Small Ruminant Research. 77:58-64.
12- Frankham, R. (1994). Conservation of genetic diversity for animals 5th world Congress on Genetics Applied to Livestock Production. University of Guelph, Guelph, Ontario, Canada. 21:385 -392.
13- Frankham, R., Ballou, J.D. and Briscoe, D.A., (2002). Introduction to Conservation Genetics.Cambridge University Press, Cambridge, UK.
14- Glowatzki-Mullis, M.L., Muntwyler, J., Baumle, E. and Gaillard, C. (2008). Genetic diversity measures of Swiss goat breeds as decision-making support for conservation policy. Small Ruminant Research.74:202-211.
15- Goudet, J. (1995). FSTAT (version 1.2). A computer program to calculate F-statistics. Journal of Heredity. 86:485-486.
16- Iamartino, D., Bruzzone, A., Lanza, A, Blasi, M. and Pilla, F. (2005). Genetic diversity of southern Italian goat population assessed by microsatellite markers. Small Ruminant Research. 57:249-255.
17- Kemp, S.J., Hishida, O.J., Wambugu, A. and Longeri, M.L. (1995). A panel of polymorphic bovine, ovine and caprine microsatellite markers. Animal Genetics. 26:299-306.
18- Kotze, A., Swart, H., Grobler, J. P. and Nemaangani, A. (2004). A genetic profile of the Kalahari Red goat breed, from Southern Africa. South African. Journal of Animal Science. 34(suppl.1):120-124.
19- Li, J.Y., Chen, H., Lan, X.Y., Kong, X.J. and Min, L.J. (2008). Genetic diversity of five Chinese goat breeds assessed by microsatellite markers. Czech Journal of Animal Science. 53:315–319.
20- Luikart, G. and Cornuet, J.M. (1997). Empirical evaluation of a test for identifying recently bottlenecked populations from allele frequency data. Conservation Biology. 12:228-237.
21- Luikart, G.L., Allendorf, F.W., Cornuet, J.M. and Sherwin, W.B. (1998). Distortion of allele frequency distributions provides a test for recent population bottlenecks. Journal of Heredity. 89:238–247.
22- Miller, S.A., Dykes, D.D. and Polesky, H.F. (1988). A simple salting out procedure for extracting DNA from human nucleated cells. Nucleic Acids Research. 16:1215.
23- Notter, D. R. (1998). The importance of diversity in livestock populations of the future. Journal of Animal Science. 77:61-69.
24- Ott, J. (2001). Program Het version 1.8. Utility programs for analysis of genetic linkage. Rockefeller University. New York, NY, USA.
25- Peakall, R. and Smouse, P.E. (2006). GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes. 6:288-295.
26- Piry, S., Luikart, G. and Cornuet, J.M. (1999). BOTTLENECK: A computer program for detecting recent reductions in the effective population size using allele frequency data. Journal of Heredity. 90:502-503.
27- Ramlijak J., Mioc, B., Curkovic, M., Pavic, V., Ivankovic, A. and Medugorac, I. (2011). Genetic Diversity measures of the Croatian Spotted goat. Acta Veterinaria (Beograd). 61:373-382.
28- Toro, M. and Mäki-Tanila A. (2007). Genomics reveals domestication history and facilitates breed development. Edited by: Oldenbroek K. Utilization and Conservation of Farm Animal Genetic Resources. Wageningen, the Netherlands.
29- Traore, A., Álvarez, I., Tambourá, H.H., Fernández, I., Kaboré, A., Royo Gutierrez, J.P., Sangare, M., Ouedraogo-Sanou, G., Toguyeni, A., Sawadogo, L. and Goyache, F. (2009). Genetic characterisation of Burkina Faso goats using microsatellite polymorphism. Livestock Science. 123:322-28.
30- Visser, C., Hefer, C.A., Van Marle-Koster, E. and Kotze, A. (2004). Genetic variation of three commercial and three indigenous goat populations in South Africa. Journal of Animal Science. 34(suppl.1):145-153. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,479 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 608 |
||