1کارشناسارشد، جنگلشناسی و اکولوژی جنگل، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه کردستان
2نویسنده مسئول مکاتبات، کارشناسارشد، بیوتکنولوژی گیاهی، آزمایشگاه بیولوژی جنگل، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه کردستان پست الکترونیک: rahmanihama@gmail.com
3استادیار، گروه جنگلداری، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه کردستان
4استادیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
چکیده
در این مطالعه با استفاده از دادههای ژنتیکی حاصل از 18 آغازگر توالیهای تکراری ساده میانی (ISSR) و 10 آغازگر چندشکلی تکثیرشده بینرتروترانسپوزونها (IRAP)، تنوع ژنتیکی بهترتیب 150 و 109 پایه مازودار (Quercus infectoria) و ویول (Q. libani) از جنگلهای زاگرس شمالی بررسی شد. در جمعیتهای Q. infectoria ازآغازگرهای ISSR و IRAP بهترتیب 202 و 136 نوار تکثیر شد که از این تعداد 194 و 135 نوار چندشکل بودند. این آغازگرها در ژنوتیپهای Q. libani بهترتیب 179 و 134 نوار چندشکل را از مجموع 187 و 137 نوار تکثیرشده تولید کردند. در سطح گونه، تنوع ژنتیکی بالایی در هر دو گونه آشکار شد. تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) نشان داد که سهم عمده تنوع ژنتیکی کل در گونههای مازودار و ویول مربوط به تنوع ژنتیکی درون جمعیتهاست. در هر دو گونه، شاخص تنوع ژنی نی برآورد شده براساس آغازگرهای ISSR بیشتر از IRAP بود. همبستگی بین فواصل جغرافیایی جمعیتها و فواصل ژنتیکی برآورد شده آنها از دو نشانگر مورد مطالعه معنیدار نبود. که نشاندهنده وجود ارتباط ژنتیکی بین جمعیتهای جدا از هم این دو گونه از طریق جریان ژنی است. در دندروگرام UPGMA حاصل از تجزیه خوشهای جمعیتهای مورد بررسی هر دو گونه در خوشههایی مجزا گروهبندی شدند که بیانگر کارایی مطلوب این نشانگرها در مطالعه تنوع ژنتیکی بلوطهاست.
Genetic diversity assessment of Quercus infectoria and Q. libani populations
in North-Zagros forests based on ISSR and IRAP markers
نویسندگان [English]
leila alikhani1؛ mohammad shafee rahmani2؛ naghi shabaniyan3؛ hedyeh badakhshan4
چکیده [English]
Eighteen inter-simple sequence repeats (ISSR) and 10 inter-retrotransposal amplified polymorphism (IRAP) markers were applied to investigate the genetic diversity of 150 natural gall oak (Quercus infectoria) and 109 Lebanon oak (Q. libani) individuals in North-Zagros forests. Among the Q. infectoria populations, ISSR and IRAP primers amplified 202 and 136 bands, respectively, of which 194 and 135 bands were polymorphic. While, the primers amplified 178 and 134 polymorphic bands from a total of 187 and 137 amplicones in Q. libani genotypes, respectively. High level of genetic diversity at the specific level was revealed in both species. Analysis of molecular variance shawed that a major proportion of total genetic diversity belonged to within populations. In both species, the Nie’s gene diversity index (h) was higher for ISSR than IRAP primers. No significant genetic relationship was detected among genetic distance of the populations and their geographical distribution, demonstrating the genetic relationships among isolated Q. infectoria and Q. libani populations via gene flow. Cluster analysis grouped the populations of both species into distinct groups, showing efficiency of studied markers to assessment of genetic polymorphism of oaks natural populations.