پسرکلو, اقدس, باقریه¬نجار, محمدباقر, میان¬آبادی, منیژه, ستاریان, علی, باقی¬زاده, امین. (1392). بررسی تنوع ژنتیکی برخی از جمعیت¬های کلپوره
(Teucrium polium) ایران با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD. سامانه مدیریت نشریات علمی, 21(1), 24-32. doi: 10.22092/ijrfpbgr.2013.3090
اقدس پسرکلو; محمدباقر باقریه¬نجار; منیژه میان¬آبادی; علی ستاریان; امین باقی¬زاده. "بررسی تنوع ژنتیکی برخی از جمعیت¬های کلپوره
(Teucrium polium) ایران با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD". سامانه مدیریت نشریات علمی, 21, 1, 1392, 24-32. doi: 10.22092/ijrfpbgr.2013.3090
پسرکلو, اقدس, باقریه¬نجار, محمدباقر, میان¬آبادی, منیژه, ستاریان, علی, باقی¬زاده, امین. (1392). 'بررسی تنوع ژنتیکی برخی از جمعیت¬های کلپوره
(Teucrium polium) ایران با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD', سامانه مدیریت نشریات علمی, 21(1), pp. 24-32. doi: 10.22092/ijrfpbgr.2013.3090
پسرکلو, اقدس, باقریه¬نجار, محمدباقر, میان¬آبادی, منیژه, ستاریان, علی, باقی¬زاده, امین. بررسی تنوع ژنتیکی برخی از جمعیت¬های کلپوره
(Teucrium polium) ایران با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1392; 21(1): 24-32. doi: 10.22092/ijrfpbgr.2013.3090
بررسی تنوع ژنتیکی برخی از جمعیت¬های کلپوره
(Teucrium polium) ایران با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD
1کارشناسارشد، فیزیولوژی گیاهی، دانشگاه گلستان، گرگان
2استادیار، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه گلستان گرگان
3استادیار، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه گلستان
4استادیار، گروه منابع طبیعی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبد کاووس، گنبد
5دانشیار، بخش بیوتکنولوژی، پژوهشکده علوم محیطی، مرکز بینالمللی علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی کرمان
چکیده
در این مطالعه تنوع ژنتیکی 6 جمعیت کلپوره(Teucrium polium)جمعآوری شده از استانهای گلستان، خراسانشمالی و سمنان با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD مورد بررسی قرار گرفت. به این منظور از برگهای جوان، DNA ژنومی استخراج شد و واکنش PCR با استفاده از 8 آغازگر RAPD بر روی DNA ژنومی جمعیتهای مورد مطالعه انجام گردید. براساس نتایج، در مجموع 68 نوار تشکیل شد که 61 نوار (71/89 درصد) چندشکلی نشان دادند. پس از تهیه ماتریس صفر و یک از نوارها با استفاده از نرمافزار NTSYS-pc و ضریب تشابه جاکارد، ماتریس تشابه محاسبه و تجزیه خوشهای به روش UPGMA انجام شد. محدوده تشابه ژنتیکی ژنوتیپها بین 33/0 تا 58/0 بدست آمد. جمعیت رامیان بیشترین تفاوت را با سایر جمعیتها نشان داد و در گروهی مجزا قرار گرفت. بیشترین شباهت نیز بین جمعیت مراوهتپه و گرماب مشاهده شد. نتایج این مطالعه اطلاعات لازم را برای برآورد سطح تنوع ژنتیکی در مجموعههای ژرمپلاسمی جمعیتهای کلپوره مورد بررسی برای استفاده در مطالعات ژنتیکی و اصلاح نباتات فراهم نمود. همچنین نتایج حاصل بیانگر آن است که RAPD روش مناسبی برای ارزیابی تنوع ژنتیکی در میان جمعیت کلپوره میباشد.
Genetic diversity of different populations of Iranian Teucrium polium L.
using RAPD markers
نویسندگان [English]
A. Pesaraklu1؛ M.B. Bagherieh Najjar2؛ M.i Mianabadi3؛ A. Sattarian4؛ A. Baghizadeh5
1M.Sc., Department of Biology, Faculty of Science, Golestan University, Gorgan
2Assist. Prof., Department of Biology, Faculty of Science, Golestan University, Gorgan
3Assist. Prof., Department of Biology, Faculty of Science, Golestan University, Gorgan
4Assist. Prof., Department of Natural Resources, Faculty of Agriculture and Natural Resources, Gonbad University, Gonbad Kabus,
5Assoc. Prof., Department of Biotechnology, Institute for Environmental Sciences, International Center Science High Technology
and Environmental Sciences, Kerman
چکیده [English]
Genetic diversity of 6 populations of Teucrium poliumL., collected from different locations of Iran, was evaluated using random amplified polymorphic DNA (RAPD) data. Total genomic DNA was extracted from young leaves of plants and polymerase chain reaction (PCR) was performed using 8 RAPD primers. Sixty eight bands were obtained of which, 61 bands (89.71%) were polymorphic. All amplified fragments in each sample were scored based on presence (1) or absence (0). Matrix of genetic similarity was calculated by Jaccard's similarity coefficient. Cluster analysis was carried out according to UPGMA algorithm using NTSYS-pc software. The genetic similarity between genotypes ranged from 0.33 to 0.58. Results showed the population Ramian had maximum difference with other populations and classified in a separate group. Maximum similarity was observed between populations Garmab and Maraveh-Tappeh. Our results showed an appropriate level of genetic diversity among the investigated populations. Moreover, our data indicated that the RAPD method is a suitable approach for assessing genetic diversity of T. poliumpopulations with high accuracy.