یاوری, علیرضا, ناظری, وحیده, سفیدکن, فاطمه, زمانی, ذبیحاله, حسنی, محمداسماعیل. (1391). بررسی تنوع ژنتیکی در بین و درون برخی از جمعیتهای آویشن آذربایجانی
(Thymus migricus Klokov & Desj.-Shost) با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD. سامانه مدیریت نشریات علمی, 28(1), 35-47. doi: 10.22092/ijmapr.2012.3065
علیرضا یاوری; وحیده ناظری; فاطمه سفیدکن; ذبیحاله زمانی; محمداسماعیل حسنی. "بررسی تنوع ژنتیکی در بین و درون برخی از جمعیتهای آویشن آذربایجانی
(Thymus migricus Klokov & Desj.-Shost) با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD". سامانه مدیریت نشریات علمی, 28, 1, 1391, 35-47. doi: 10.22092/ijmapr.2012.3065
یاوری, علیرضا, ناظری, وحیده, سفیدکن, فاطمه, زمانی, ذبیحاله, حسنی, محمداسماعیل. (1391). 'بررسی تنوع ژنتیکی در بین و درون برخی از جمعیتهای آویشن آذربایجانی
(Thymus migricus Klokov & Desj.-Shost) با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD', سامانه مدیریت نشریات علمی, 28(1), pp. 35-47. doi: 10.22092/ijmapr.2012.3065
یاوری, علیرضا, ناظری, وحیده, سفیدکن, فاطمه, زمانی, ذبیحاله, حسنی, محمداسماعیل. بررسی تنوع ژنتیکی در بین و درون برخی از جمعیتهای آویشن آذربایجانی
(Thymus migricus Klokov & Desj.-Shost) با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1391; 28(1): 35-47. doi: 10.22092/ijmapr.2012.3065
بررسی تنوع ژنتیکی در بین و درون برخی از جمعیتهای آویشن آذربایجانی
(Thymus migricus Klokov & Desj.-Shost) با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD
1دانشجوی کارشناسیارشد، گروه علوم باغبانی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
2دانشیار، گروه علوم باغبانی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
3استاد، بخش تحقیقات گیاهان دارویی و محصولات فرعی، مؤسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور
4استادیار، گروه علوم باغبانی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
چکیده
در مطالعه حاضر نشانگرهای مولکولی RAPD جهت بررسی تنوع ژنتیکی ژرمپلاسم برخی از جمعیتهای وحشی آویشن آذربایجانی (Thymus migricus Klokov & Desj.-Shost) در ایران بکار برده شد. از تعداد 21 آغازگر ده نوکلئوتیدی بکار برده شده، در مجموع 310 نوار با وضوح بالا تولید شد که از این تعداد، 14 نوار مونومورفیک و 296 نوار دارای چند شکلی (پلیمورفیسم) بودند. بهطور میانگین تعداد 76/14 نوار بهازای هر آغازگر بدست آمد که تعداد 09/14 نوار از آنها چند شکل بودند. ماتریس فاصله جمعیتها توسط روش نی محاسبه شد و براساس تجزیه خوشهای حاصل از این ماتریس، دندروگرام به روش UPGMA ترسیم گردید. تجزیه واریانس دادههای مولکولی (AMOVA) انجام شد. تجزیه خوشهای نشان داد که در بین جمعیتهای آویشن آذربایجانی، جمعیتهای بند (استان آذربایجان غربی) و جلفا (استان آذربایجانشرقی) با میزان فاصله 130/0 بیشترین تفاوت را نشان دادند. جمعیتهای نازلو و بند (هر دو جمعیت آویشن آذربایجانی) از استان آذربایجانغربی با میزان فاصله 081/0 بیشترین شباهت را در بین جمعیتهای مورد مطالعه داشتند. میانگین تنوع ژنتیکی نی (h) و شاخص اطلاعاتی شانون (I) نشان دادند که بیشترین تنوع در درون جمعیت جلفا (294/0 =I و 196/0 =h) و کمترین تنوع ژنتیکی در جمعیت قوشچی (209/0 =I و 139/0 =h) دیده میشود. میانگین شاخصهای Fst و Nm که میزان جریان ژنی بین جمعیتها را نشان میدهند، بهترتیب 30/0 و 14/1 بدست آمد که بیانگر بالا بودن تبادل ژنی بین پنج رویشگاه آویشن آذربایجانی مورد مطالعه در این بررسی میباشد. نتایج این تحقیق بیانگر وجود تنوع قابل توجه برای جمعیتهای آویشن آذربایجانی در ایران میباشد که میتواند در برنامههای اصلاحی مورد استفاده قرار گیرد.
Evaluation of genetic diversity among and within some endemic populations of Thymus migricus Klokov & Desj.-Shost using RAPD molecular markers
نویسندگان [English]
A.R. Yavari1؛ V. Nazeri2؛ F. Sefidkon3؛ Z. Zamani2؛ M.E. Hassani4
1MSc. Student, University College Agriculture & Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran
2Horticultural department, University College Agriculture & Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran
3Research Institute of Forests and Rangelands, Tehran, Iran
4Horticultural department, University College Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran
چکیده [English]
In the present study, the genetic variation within and among some populations of Thymus migricus Klokov & Desj.-Shost was investigated using the RAPD markers. Twenty-one decamer RAPD primers produced 310 unique bands. RAPD analysis showed 14 monomorphic and 296 polymorphic bands in different genotypes. The number of polymorphic bands per primer varied from 5 to 20 with a mean of 14.09. Genetic distance was measured by Nei’s coefficient and cluster analysis was carried out. A dendrogram was drawn based on genetic distance data, applying the UPGMA clustering method. Analysis of molecular variance (AMOVA) was performed. According to the dendrogram, among T. migricus populations, Band and Jolfa populations had maximum differences with a distance of 0.130. Evaluation of genetic diversity within populations with an average of Nei’s gene diversity analysis and Shannon’s information index, showed that diversity within population of Jolfa (h = 0.196 & I = 0.294) was more than other populations while genetic diversity within population of Ghushchi (h = 0.139 & I = 0.209) was less than other populations. Mean of Fst and Nm indexes which show gene flow among populations, were 0.30 and 1.14, indicating a greater gene flow among five populations of T. migricus. The results of the present study showed that there was a greater level of genetic variation in the Iranian natural populations of T. migricus which could be applied for future breeding programs.