اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات285
تعداد نشریات سازمان83
تعداد شماره‌ها3,139
تعداد مقالات34,918
تعداد مشاهده مقاله50,383,086
تعداد دریافت فایل اصل مقاله90,276,499
Salari, Zahra, Moghbeli, Majid, Farzin, Hamidreza, Jamshidian mojaver, Majid. (1404). Phylogenetic grouping and probiotics antibacterial studies on Escherichia coli isolates obtained from calves' excrement in an Industrial slaughterhouse of Mashhad city. سامانه مدیریت نشریات علمی, (), -. doi: 10.22092/ari.2025.368000.3462
Zahra Salari; Majid Moghbeli; Hamidreza Farzin; Majid Jamshidian mojaver. "Phylogenetic grouping and probiotics antibacterial studies on Escherichia coli isolates obtained from calves' excrement in an Industrial slaughterhouse of Mashhad city". سامانه مدیریت نشریات علمی, , , 1404, -. doi: 10.22092/ari.2025.368000.3462
Salari, Zahra, Moghbeli, Majid, Farzin, Hamidreza, Jamshidian mojaver, Majid. (1404). 'Phylogenetic grouping and probiotics antibacterial studies on Escherichia coli isolates obtained from calves' excrement in an Industrial slaughterhouse of Mashhad city', سامانه مدیریت نشریات علمی, (), pp. -. doi: 10.22092/ari.2025.368000.3462
Salari, Zahra, Moghbeli, Majid, Farzin, Hamidreza, Jamshidian mojaver, Majid. Phylogenetic grouping and probiotics antibacterial studies on Escherichia coli isolates obtained from calves' excrement in an Industrial slaughterhouse of Mashhad city. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1404; (): -. doi: 10.22092/ari.2025.368000.3462

Phylogenetic grouping and probiotics antibacterial studies on Escherichia coli isolates obtained from calves' excrement in an Industrial slaughterhouse of Mashhad city

Archives of Razi Institute
مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 22 دی 1404    اصل مقاله (1.15 M)
نوع مقاله: Original Articles
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2025.368000.3462
نویسندگان
Zahra Salari1؛ Majid Moghbeli1؛ Hamidreza Farzin2؛ Majid Jamshidian mojaver* 2
1Department of Microbiology, Damghan branch, Islamic Azad University, Damghan, Iran.
2Mashhad Branch, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Mashhad, Iran
چکیده
Background: Diarrhea in calves caused by Escherichia Coli (E. Coli) poses an economic risk to livestock farms. Classifying new pathogen strains through genetic recombination aids in infection prevention and treatment. This study aims to identify E. Coli strains in calf feces and examine the antibacterial effects of probiotics on them.
Methods: 85 samples were prepared from healthy and diarrheal calves' excrement at Mashhad industrial slaughterhouse to isolate E. Coli strains. Then, they were phylogenetically grouped using multiplex polymerase chain reaction (PCR) on yjaA, chuA, arpA, and TspE4.C2 genes, based on the new Claremont method, and were classified using the ERIC-PCR method based on genetic diversity. Also, double-layer culture and plate-well methods investigated Lactobacilli's antibacterial and anti-adhesion effects (L.) Casei and Plantarum and their aggregation effects with isolates were done using the Coaggregation method.
Results: Based on the PCR results of 70 E. Coli strains, the phylogenetic grouping was classified as A( 40%), B1 (17.14%), B2 (14.3%), E (7.14%), F (5.71%), D (4.29%), C (0%), and unknown (11.42%). Their genetic diversity consisted 3 main clusters including subclusters: G1 (2 isolates), G2 (4 isolates), G3 (6 isolates), G4 (3 isolates), G5 (18 isolates), G6 (3 isolates). Probiotics' antibacterial and anti-adhesion effects were confirmed against pathogenic and non-pathogenic E. Coli strains, and these effects were more impressive about L. Casei than L. Plantarum.
Conclusion: To effectively prevent diarrhea in calves, it is essential to understand the phylogenetic grouping and genetic diversity of the bacterial causes. Additionally, probiotics can expedite the treatment of diarrhea.
کلیدواژه‌ها
Probiotic؛ Diarrhea؛ Calf؛ Phylogenetic Grouping؛ ERIC
عنوان مقاله [English]
گروه بندی فیلوژنتیک و مطالعات آنتی باکتریال پروبیوتیک بر روی جدایه های اشریشیا کلی به دست آمده از فضولات گوساله ها در کشتارگاه صنعتی شهر مشهد
چکیده [English]
سابقه و هدف: اسهال در گوساله های ناشی از اشریشیا کلی (E.Coli) یک خطر اقتصادی برای دامداری ها به همراه دارد. طبقه بندی سویه های پاتوژن جدید از طریق نوترکیبی ژنتیکی به پیشگیری و درمان عفونت کمک می کند. این مطالعه با هدف شناسایی سویه های E. Coli در مدفوع گوساله ها و بررسی اثرات ضد باکتریایی پروبیوتیک ها بر روی آنها انجام شد.
روش کار: 85 نمونه از فضولات گوساله های سالم و اسهالی در کشتارگاه صنعتی مشهد برای جداسازی سویه های اشریشیا کلی تهیه شد. سپس با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز مالتی پلکس (PCR) بر روی ژن های yjaA، chuA، arpA و TspE4.C2 بر اساس روش جدید Claremont به صورت فیلوژنتیکی گروه بندی و با استفاده از روش ERIC-PCR بر اساس تنوع ژنتیکی طبقه بندی شدند. همچنین با روش‌های کشت دولایه و چاه پلیت، اثرات ضدباکتریایی و ضد چسبندگی لاکتوباسیل‌ها (L.) Casei و Plantarum و اثرات تجمع آنها با جدایه‌ها به روش Coaggregation بررسی شد.
یافته‌ها: بر اساس نتایج PCR 70 سویه E.Coli، گروه‌بندی فیلوژنتیک به‌عنوان A(40%)، B1(17.14%)، B2(14.3%)، E(7.14%)، F(5.71%) طبقه‌بندی شد. D (4.29٪)، C (0٪)، و ناشناخته (11.42٪). تنوع ژنتیکی آنها شامل 3 خوشه اصلی شامل زیرخوشه های G1 (2 جدایه)، G2 (4 ایزوله)، G3 (6 ایزوله)، G4 (3 جدایه)، G5 (18 ایزوله)، G6 (3 جدایه). اثرات ضد باکتریایی و ضد چسبندگی پروبیوتیک ها در برابر سویه های بیماری زا و غیر بیماری زا E. Coli تایید شد و این اثرات در مورد L. Casei نسبت به L. Plantarum چشمگیرتر بود.
نتیجه‌گیری: برای پیشگیری مؤثر از اسهال در گوساله‌ها، شناخت گروه‌بندی فیلوژنتیک و تنوع ژنتیکی علل باکتریایی ضروری است. علاوه بر این، پروبیوتیک ها می توانند درمان اسهال را تسریع کنند.
کلیدواژه‌ها [English]
پروبیوتیک, اسهال, گوساله, گروه بندی فیلوژنتیک, ERIC
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 31
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 27


counter
سامانه مدیریت نشریات علمی. طراحی و پیاده سازی از سیناوب