1Department of Microbiology, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran
2Department of Microbiology, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran.
3Department of Parasitology and Mycology, School of Medicine Infectious Diseases and Tropical Medicine Research Center, Research Institute of Cellular and Molecular Sciences in Infectious Diseases Zahedan University of Medical Sciences.
4Department of Anaerobic Bacterial Vaccine Production and Research, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran.
چکیده
Tuberculosis is one of the oldest zoonotic diseases, with a high prevalence in many low-income countries. Specific and sensitive tuberculosis diagnostic methods in the early stages play a significant role in the life-saving of patients. There is little data available in Zahedan on the prevalence of the Mycobacterium species, so this study aimed to identify the Mycobacterium species in patients with pulmonary tuberculosis in Zahedan. This study included 500 samples collected from sputum from Zahedan. The samples were cultured on LJ, and simultaneously stained with cold ZN. After growth, DNA was extracted and used for molecular identification of the Mycobacterium species from samples. RD typing was used to differentiate members of the Mycobacterium tuberculosis complex. Finally, the PCR-RFLP method was used as a comparison method. The typical 543 bp band was observed in all isolates via amplicon PCR-16S rRNA, emphasizing that all isolates belong to the genus Mycobacterium. Sixty isolates were identified as belonging to the MTBC and were classified as M. tuberculosis species. The PCR-RFLP analysis using Alu I on the oxyR gene confirmed that all 60 isolates were M. tuberculosis. Three samples (4.7%) were also positive for NTM. One isolate was categorized in the M. terrae complex group (MTC), and two isolates belonged to M. simiae group. Our results indicated that M. tuberculosis has a high prevalence in the human population of this city. Therefore, screening these individuals plays a significant role in reducing the disease prevalence in Zahedan. It is suggested further studies on the human population to find Mycobacterium strains in the future.
شناسایی جدایههای گونههای مایکوباکتریوم از بیماران مشکوک به سل با استفاده از روش مولکولی در زاهدان، ایران
چکیده [English]
سل یکی از قدیمیترین بیماریهای مشترک بین انسان و دام است که شیوع بالایی در بسیاری از کشورهای کمدرآمد دارد. روشهای تشخیصی اختصاصی سل در مراحل اولیه نقش مهمی در نجات جان بیماران دارند. دادههای کمی در زاهدان در مورد شیوع گونههای مایکوباکتریوم موجود است، بنابراین این مطالعه با هدف شناسایی گونههای مایکوباکتریوم در بیماران مبتلا به سل ریوی در زاهدان انجام شد. این مطالعه شامل ۵۰۰ نمونه جمعآوریشده از خلط زاهدان بود. نمونهها بر روی محیط کشت LJ کشت داده شدند و همزمان با ZN سرد رنگآمیزی شدند. پس از رشد، DNA استخراج و برای شناسایی مولکولی گونههای مایکوباکتریوم از نمونهها استفاده شد. از تایپینگ RD برای تمایز اعضای کمپلکس مایکوباکتریوم توبرکلوزیس استفاده شد. در نهایت، از روش PCR-RFLP به عنوان روش مقایسهای استفاده شد. باند معمول ۵۴۳ جفت بازی در همه ایزولهها از طریق آمپلیکون PCR-16S rRNA مشاهده شد که تأکید میکند همه ایزولهها متعلق به جنس مایکوباکتریوم هستند. شصت ایزوله متعلق به MTBC شناسایی و به عنوان گونههای M. tuberculosis طبقهبندی شدند. آنالیز PCR-RFLP با استفاده از Alu I روی ژن oxyR تایید کرد که هر 60 جدایه، مایکوباکتریوم توبرکلوزیس بودند. سه نمونه (4.7%) نیز برای NTM مثبت بودند. یک جدایه در گروه کمپلکس M. terrae (MTC) طبقهبندی شد و دو جدایه متعلق به گروه M. simiae بودند. نتایج ما نشان داد که مایکوباکتریوم توبرکلوزیس شیوع بالایی در جمعیت انسانی این شهر دارد. بنابراین، غربالگری این افراد نقش مهمی در کاهش شیوع بیماری در زاهدان ایفا می کند. پیشنهاد میشود مطالعات بیشتری روی جمعیت انسانی برای یافتن سویههای مایکوباکتریوم در آینده انجام شود.