| تعداد نشریات | 284 |
| تعداد نشریات سازمان | 82 |
| تعداد شماره‌ها | 3,080 |
| تعداد مقالات | 34,355 |
| تعداد مشاهده مقاله | 47,681,354 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 78,709,801 |
Molecular Phylogeny of Theileria equi in horses of Khuzestan province based on 18S ribosomal RNA | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 22 شهریور 1404 اصل مقاله (633.64 K) | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2025.370020.3736 | ||
| نویسندگان | ||
| Alireza Rocky1؛ Abbas Jolodar* 2 | ||
| 1PhD student in the Faculty of Veterinary Medicine at the Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran | ||
| 2Department of Basic Sciences, Biochemistry and Molecular Biology Section, Faculty of Veterinary Medicine, Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran. | ||
| چکیده | ||
| Equine piroplasmosis is a tick-borne disease caused by two protozoan parasites, Babesia caballi and Theileria equi (formerly Babesia equi), transmitted by Ixodid ticks. In this study, a 435 bp fragment of the 18S ribosomal RNA (rRNA) gene was amplified from horse blood samples collected in Khuzestan Province, Iran, to assess the parasite's molecular phylogeny and predicted RNA secondary structure. Taxonomic analysis of the amplified sequence designated TeKh, yielded 108 matches within the phylum Apicomplexa. Of these, 104 hits belonged to the family Theileriidae, and 86 were affiliated with the genus Theileria. Comparative analysis revealed that TeKh is identical to the only reported T. equi sequence from Fars Province, Iran (MK615933). Further multiple sequence alignment showed high similarity: 98.71% to a T. equi isolate from Russia (OM475523) and 99.74% to one from Turkmenistan (OL638195). Structural predictions using the RNAfold algorithm indicated a thermodynamic free energy of −121.98 kcal/mol, suggesting a stable RNA secondary structure. The phylogenetic tree revealed that sequences in Cluster A, which included isolates from diverse countries, showed minimal divergence, indicating high genetic conservation of T. equi across geographic regions. In contrast, Cluster B exhibited greater genetic variability, including T. bicornis (AF499604) from South Africa and Theileria sp. (KF597078) from Kenya, while T. cervi (KT959227) from China formed a separate branch with moderate bootstrap support (44%). In conclusion, the T. equi sequences isolated from Khuzestan and Fars provinces in Iran showed no detectable genetic differences, highlighting strong intraspecific similarity that may reflect animal movement between these regions. Although the sample size in this phylogenetic analysis was limited, the consistently high sequence identity among T. equi isolates from various geographic regions suggests that further investigation is warranted before the 18S rRNA gene can be confidently employed as a species-specific molecular marker for diagnosing T. equi in equine hosts. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| 18S ribosomal RNA؛ Babesia؛ Horse؛ Phylogeny؛ Theileria equi | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| فیلوژنی مولکولی Theileria equi در اسب‌های استان خوزستان براساس ژن 18S RNA ریبوزومی | ||
| چکیده [English] | ||
| پیروپلاسموز اسبی یک بیماری منتقله از کنه است که توسط دو گونه انگل تک یاخته‌ای، به نام های Babesia caballi و Theileria equi (قبلاً Babesia equi نامیده می‌شد) ایجاد می‌شود. این بیماری توسط کنه‌های ایکسودید منتقل می‌گردد. در این مطالعه، بمنظور مطالعه فیلوژنی ملکولی و تعیین ساختار ثانویه، یک قطعه ژن 435 نوکلئوتیدی از ژن 18S RNA ریبوزومی از اسب‌های استان خوزستان، ایران تکثیر گردید. آنالیز تاکسونومی توالی افزوده سازی شده، که به عنوان TeKh نامگذاری شد، نشان داد که این قطعه ژن در 108 مورد در شاخه Apicomplexa مشابهت داشت. از این تعداد، 104 مورد مربوط به خانواده Theileriidae و 86 مورد به جنس Theileria است. نتایج مقایسه این ژن با بانک ژن نشان داد که TeKh با تنها توالی موجود از استان فارس (MK615933) کاملا مشابه است. همترازی چندگانه این توالی به ترتیب 71/98٪ و 74/99٪ با T. equi از روسیه (OM475523) و ترکمنستان (OL638195) مشابهت نشان داد. با استفاده از برنامه RNAfold انرژی آزاد ترمودینامیکی TeKh به میزان 98/121- کیلوکالری بر مول پیش‌بینی گردید، که این نشان می دهد که RNA به شکل پایداری تا خورده است. درخت فیلوژنتیکی نشان داد که توالی‌های خوشه A که از کشورهای مختلف منشأ گرفته‌اند، حداقل واگرایی را نشان می‌دهند، که نشان‌دهنده حفاظت ژنتیکی بالای این ژن در بین سویه‌های متنوع جغرافیایی است. در خوشه B تنوع بیشتری را دیده شد، بدینصورت که توالی‌های T. bicornis (AF499604)و (KF597078) Theileria Sp. به ترتیب، از آفریقای جنوبی و کنیا قرار دارند. توالی. T cervi (KT959227) جدا شده از چین با بوت‌استرپ متوسط (۴۴٪) از بقیه اعضای شاخه B جدا افتاده است. نتیجه گیری کلی اینکه، هیچ تفاوت قابل توجهی بین دو توالی جدا شده از استان‌های خوزستان و فارس در ایران وجود نداشت، که نشان دهنده شباهت درون گروهی است که احتمالاً به دلیل جابجایی حیوانات بین این دو منطقه بوجود آمده است. شباهت بالای مشاهده شده بین توالی‌های T. equi از نقاط مختلف جهان نشان می‌دهد که قبل از اینکه بتوان از این قطعه ژن به عنوان یک نشانگر ملکولی اختصاصی گونه T. equi در اسب‌ها استفاده کرد، به تحقیقات بیشتری نیاز است. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| 18SRNAریبوزومی, Babesia, اسب, فیلوژنی, Theileria | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 70 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 36 |
||