| تعداد نشریات | 284 |
| تعداد نشریات سازمان | 82 |
| تعداد شماره‌ها | 3,081 |
| تعداد مقالات | 34,377 |
| تعداد مشاهده مقاله | 47,995,371 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 78,920,361 |
Molecular characterization of canine parvovirus in Iran, 2023 | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 25 فروردین 1404 اصل مقاله (380.1 K) | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2024.367128.3354 | ||
| نویسندگان | ||
| Zahra Ziafati Kafi1؛ Soroush Sarmadi1؛ Shabnam Babazadeh2؛ Fahimeh Jamiri1؛ Alireza Bakhshi1؛ Aryan Abbassioun3؛ Omid Eghbali1؛ Arash Ghalyanchilangeroudi* 4 | ||
| 1Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran | ||
| 2Department of Clinical Pathology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran, Tehran, Iran | ||
| 3Department of Virology, Faculty of Veterinary Medicine, Tehran University, Tehran, Iran | ||
| 469 Azadi Ave | ||
| چکیده | ||
| Canine parvo virus 2 causes severe and often fatal gastroenteritis and myocarditis in dogs and puppies. Based on the VP2 gene, this virus is classified into 3 variants: CPV-2a, CPV-2b, and CPV-2c. In present study 35 rectal swab samples were collected from dogs with clinical signs, including vomiting and diarrhea, and cases with positive results from the rapid test kit. Samples were screened with PCR assay to screen for the presence of the virus genome. According to the PCR results, all samples were positive. Out of 35 cases, about 34% received at least one dose of vaccine, and almost 66% were not vaccinated at all. A rapid test was also performed for 34 cases. Rapid test was positive for 91% (31 cases) and negative for 9% (3 cases). Phylogenetic analysis of seven samples, which were submitted for sequencing, revealed that 6 of the present isolates (UT-CPV14 to UT-CPV18 and UT-CPV20) were clustered with CPV-2c isolates and one (UT-CPV19) was clustered with CPV-2b sequences. Homology analysis indicated high similarity (100%) between isolates (UT-CPV14 to UT-CPV18 and UT-CPV20) and isolates K20172c-1, 12B, IZSSI_2021PA43108idAki, BJ001, and CPV-2c/Sull6/2017. UT-CPV19 showed 100% similarity with isolates 19R113-2, YANJI-2, and 15D184. In the present study, we also analyzed a commercial vaccine phylogenetically. Although the homology results indicated almost 98% similarity between current isolates and vaccine, the vaccine sequence was not clustered with any groups in the phylogenetic tree. These results highlight the importance of constantly monitoring circulating strain antigenic changes and the efficacy of vaccines against them. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Canine parvovirus؛ Dog؛ Vaccine؛ Phylogeny؛ Iran | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| تعیین هویت مولکولی پاروویروس سگ سانان در ایران، 2023 | ||
| چکیده [English] | ||
| پاروویروس 2 سگ سانان، سبب گاستروانتریت و مایوکاردیت شدید و کشنده در بین سگ‌ها و توله سگ‌ها می‌‌شود. این ویروس بر اساس ژن VP2 به سه واریانت: CPV-2a, CPV-2b و CPV-2c طبقه بندی می‌‌گردد. در مطالعه‌ی حاضر تعداد 35 عدد نمونه سواب مقعدی از سگ‌های دارای علایم بالینی از جمله استفراغ و اسهال و موارد بالینی با نتیجه مثبت تست سریع جمع آوری شد. نمونه‌های جمع آوری شده از نظر وجود آلودگی با پاروویروس 2 سگ سانان با استفاده از تست PCR مورد بررسی قرار گرفتند. بر اساس نتایج تست PCR تمامی نمونه‌ها مثبت بودند. از بین 35 سگ واجد شرایط نمونه برداری 34% حداقل یک دز واکسن دریافت کرده و حدود 66% واکسینه نشده بودند. نتایج تست سریع 91% از موارد (31 مورد) مثبت و 9% موارد (3 مورد) منفی بودند. تجزیه و تحلیل فیلوژنی هفت نمونه که تعیین توالی شده بودند نشان داد که 6 نمونه (UT-CPV14 تا UT-CPV-18 و UT-CPV-20) در زیرگروه 2c قرار گرفته و یک نمونه (UT-CPV-19) در زیرگروه 2b قرار گرفت. تجزیه و تحلیل همولوژی شباهت بالایی (100%) بین جدایه‌های (UT-CPV14 تا UT-CPV18 و UT-CPV20) و جدایه‌های K20172c-1، 12B، IZSSI_2021PA43108idAki، BJ001 و CPV-2c/Sull6/2017 و جدایه UT-CPV19 با جدایه‌های 19R113-2، YANJI-2 و 15D184 شباهت 100% نشان داد. در مطالعه‌ی حاضر یک واکسن تجاری نیز مورد بررسی فیلوژنی قرار گرفت. اگرچه نتایج همولوژی بیانگر شباهتی معادل 98% بین توالی واکسن و جدایه‌های مطالعه‌ی حاضر بود، واکسن مورد مطالعه در هیچ دسته‌ای در درخت فیلوژنی قرار نگرفت. نتایج این مطالعه بیانگر اهمیت پایش مداوم تغییرات آنتی‌ژنی سویه‌های در گردش و تاثیر واکسن‌ها در برابر آن‌ها می‌باشد. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| پاروویروس سگ سانان, سگ, واکسن, فیلوژنی, ایران | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 274 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 306 |
||