| تعداد نشریات | 285 |
| تعداد نشریات سازمان | 83 |
| تعداد شمارهها | 3,103 |
| تعداد مقالات | 34,621 |
| تعداد مشاهده مقاله | 49,648,608 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 80,086,747 |
تنوع ژنتیکی اکوتیپهای مختلف سه گونهگلختمی (Althaea) با استفاده از نشانگرهای فیتوشیمیایی و مولکولی SCoT | ||
| تحقیقات گیاهان دارویی و معطر ایران | ||
| مقاله 9، دوره 39، شماره 4، دی 1402، صفحه 622-637 اصل مقاله (1.09 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ijmapr.2023.361341.3283 | ||
| نویسندگان | ||
| امین ارجمند1؛ محسن ابراهیمی* 2؛ نرگس مرادی3 | ||
| 1دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه آموزشی علوم زراعی و اصلاح نباتات، دانشکده فناوری کشاورزی ابوریحان، دانشگاه تهران، تهران، ایران | ||
| 2دانشیار گروه آموزشی علوم زراعی و اصلاح نباتات، دانشکده فناوری کشاورزی ابوریحان، دانشگاه تهران، تهران | ||
| 3دانشجوی دکتری ، گروه آموزشی علوم زراعی و اصلاح نباتات، دانشکده فناوری کشاورزی ابوریحان، دانشگاه تهران، تهران، ایران | ||
| چکیده | ||
| سابقه و هدف: گلختمی متعلق به جنس Althaea و خانواده Malvaceae است. مهمترین گونه گلختمی که دارای کاربرد دارویی است گونه Althaea officinalis میباشد. سایر گونهها مانند A. rosea و A. ficifolia نیز دارای کاربردهای دارویی هستند. اندامهای مختلف گونههای گلختمی (گل، میوه، دانه، ریشه و برگ) به دلیل وجود موسیلاژ بالا، ترکیبات فنولی و خواص آنتیاکسیدانی کاربرد دارویی فراوانی دارند. هدف از انجام این تحقیق، یافتن بهترین اکوتیپها از نظر صفات فیتوشیمیایی مورد بررسی و تعیین فاصله و تشابه ژنتیکی بین اکوتیپهای گلختمی مورد مطالعه به منظور استفاده در پروژههای بهنژادی است. مواد و روشها: اجرای پژوهش در سال 1401 در گلخانه تحقیقاتی، آزمایشگاه زراعت و گیاهان دارویی و آزمایشگاه ژنومیکس در دانشکده فناوری کشاورزی ابوریحان (دانشگاه تهران) واقع در شهرستان پاکدشت با طول جغرافیایی ۵۱ درجه شرقی و عرض جغرافیایی ۳۳ درجه شمالی و ارتفاع ۱۰۱۳ متری از سطح دریا و در فاصله ۳۶ کیلومتری جنوبشرقی تهران انجام شد. در این تحقیق تنوع مولکولی و صفات فیتوشیمایی میزان فنول کل، میزان موسیلاژ و ظرفیت آنتیاکسیدانی در ۹ اکوتیپ از سه گونه گلختمی بررسی شد. در ارزیابی فیتوشیمیایی عصارهگیری از ریشه، به روش سوکسله انجام گردید. ارزیابی تنوع مولکولی پس از استخراج DNA از برگ به روش CTAB با استفاده از ۱۰ پرایمر SCoT انجام شد. کمّیت و کیفیت DNA استخراج شده با استفاده از دو روش اسپکتروفتومتری و الکتروفورز افقی روی ژل آگارز ۱% بررسی گردید. نتایج: در ارزیابی فیتوشیمیایی، مشخص شد که از نظر فنول کل اکوتیپ کرمانشاه با 10.67 میلیگرم اسیدگالیک در گرم عصاره دارای بالاترین مقدار از نظر آماری بود. از نظر میزان موسیلاژ اکوتیپهای کرمانشاه و کرمان هر دو در یک گروه و بهترتیب با 2.86 و2.77 میلیگرم در گرم وزن خشک نسبت به سایر اکوتیپها در جایگاه اول قرار گرفتند. ضریب همبستگی پیرسون بین صفات فیتوشیمیایی محاسبه و مشخص شد. رابطه مثبت و قوی بین صفات ارزیابی شده در آزمایش وجود دارد. ارزیابی تنوع مولکولی پس از استخراج DNA از برگ به روش CTAB با استفاده از ۱۰ پرایمر SCoT انجام شد و در مجموع 111 باند تشکیل و 76 باند چندشکل بود. مقدار PIC بین 0.22% تا 0.34% متغیر بود. درصد چندشکلی در این تحقیق بین 0.5 تا 0.87 متغیر و میانگین آن 0.67 بدست آمد. میانگین شاخصهای MI و RP بهترتیب 1.55 و 5.48 بدست آمد. در تجزیه خوشهای دادههای مولکولی، اکوتیپها در سطح تشابه 70% در سه گروه قرار گرفتند. دندروگرام حاصل از تجزیه خوشهای اکوتیپها نشاندهنده وجود تشابه ژنتیکی بین اکوتیپهای متعلق به یک گونه و وجود فاصله ژنتیکی بین اکوتیپهای مربوط به گونههای مختلف بود. نتایج تجزیه به مختصات اصلی نیز نتایج حاصل از تجزیه خوشهای دادههای مولکولی را تأیید کرد. در تجزیه واریانس مولکولی مشخص شد ۲۷% از تنوع مربوط به درون و ۶۳% از تنوع مربوط به بین گونهها میباشد. نتیجهگیری: در نهایت مشخص شد که نشانگرهای فیتوشیمیایی و مولکولی SCoT دارای کارایی لازم برای تمایز اکوتیپهای مختلف گلختمی هستند و با توجه به وجود تنوع ژنتیکی، بهمنظور اصلاح این گیاه از اکوتیپهای بررسی شده در این تحقیق میتوان بهعنوان جمعیت اولیه و والدین تلاقی بهمنظور بهرهمندی از هتروزیس استفاده کرد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| ظرفیتآنتیاکسیدانی؛ همبستگی؛ تنوعمولکولی؛ هتروزیس | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Genetic diversity of different ecotypes from three Althaea species using SCoT phytochemical and molecular markers | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Amin Arjmand1؛ Mohsen Ebrahimi2؛ narges moradi3 | ||
| 1MSc, Department of Agronomy and Plant Breeding Sciences, Faculty of Agricultural Technology, University of Tehran, Tehran, Iran | ||
| 2Associate Professor, Department of Agronomy and Plant Breeding, Abureyhan School of Agricultural Technology, University of Tehran, Tehran | ||
| 3Ph.D. Student, Department of Agronomy and Plant Breeding Sciences, Abureyhan School of Agricultural Technology, University of Tehran, Tehran, Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| Background and objectives: Althaea genus belongs to the Malvaceae family. Althaea officinalis is the most important species of this genus for medicinal use. Other species, such as A. rosea and A. ficifolia, also have medicinal uses. Different flower organs (flower, fruit, seed, root, and leaf) of Altheae species have many medicinal uses due to high mucilage, phenolic compounds, and antioxidant properties. This research aims to find the best ecotypes for the investigated phytochemical traits. It also aims to determine the distance and genetic similarity between the studied Altheae species ecotypes. It is intended to be used in various projects. Methodology: The research was carried out in 1401 in the research greenhouse, the agriculture and medicinal plants laboratory, and the genomics laboratory in the Aburihan Faculty of Agricultural Technology (Tehran University) located in Pakdasht city at 51 degrees east longitude and 33 degrees north latitude. It was conducted at 1013 meters above sea level and 36 kilometers southeast of Tehran. In this research, the molecular diversity and phytochemical traits of total phenol content, mucilage content, and antioxidant capacity were investigated in 9 ecotypes of three species of Altheae species. In the phytochemical evaluation, extracts were obtained from the roots by the Soxhlet method. Evaluation of molecular diversity was done after extracting DNA from leaves by the CTAB method using 10 SCoT primers. The quality and quantity of the extracted DNA were evaluated using two methods: a spectrophotometer and horizontal electrophoresis on 1% agarose gel. Results: In the phytochemical evaluation, it was found that in terms of total phenol, the Kermanshah ecotype had the highest value statistically, with 10.67 mg of gallic acid per gram of extract. Regarding the amount of mucilage, the Kermanshah and Kerman ecotypes were ranked first in the same group with 2.86 and 2.77 mg per gram of dry weight, respectively, compared to other ecotypes. Pearson's correlation coefficient was calculated between phytochemical traits. It was determined that there was a positive and strong relationship between the traits evaluated in the experiment. Evaluation of molecular diversity was done after extracting DNA from leaves by the CTAB method using 10 SCoT primers. A total of 111 bands were formed, and 76 were polymorphic bands. PIC values varied between 0/22 and 34%. The percentage of polymorphism in this research varied between 0/5 and 0/87, and its average was 0/67. The average MI and RP indices were 1/55 and 5/48, respectively. In cluster analysis of molecular data, ecotypes were divided into three groups with 70% similarity. The dendrogram obtained from cluster analysis of ecotypes shows genetic similarity between ecotypes belonging to the same species. It also shows the genetic distance between ecotypes related to different species. The results of decomposition into principal coordinates also confirmed cluster analysis results. In the analysis of molecular variance, it was found that 27% of the variation was within species, and 63% was between species. Conclusion: In the end, it was found that SCoT phytochemical and molecular markers have the necessary efficiency to differentiate different ecotypes of Altheae species. Due to genetic diversity, to improve this plant, the ecotypes examined in this research can be crossed as the initial population and parents. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| antioxidant capacity, correlation, molecular diversity, heterosis | ||
| مراجع | ||
|
- Hamilton, A.C., 2004. Medicinal plants, conservation and livelihoods. Biodiversity and Conservation, - Al-Qurainy, F., Khan, S., Nadeem, M. and Tarroum, M., 2015. SCoT marker for the assessment of genetic diversity in Saudi Arabian date palm cultivars. Pakistan Journal of Botany, 47(2): - Ali Shah, S.M., Akhtar, N., Akram, M., Shah, P.A., Saeed, T., Ahmed, K. and Asif, H.M., 2011. Pharmacological activity of Althaea officinalis L. Journal of Medicinal Plant Research, 5(24): 5662-5666. Moalemi, R., Aghdasi, M. and Ghanati, F., 2012. Induction of Phenolic Compounds is Affected by Boron Supply in Marshmallow (Althaea officinalis L. ) Cells, Progress in Biological Sciences, 2(1); 68-75. - Collard, B.C.Y. and Mackill, D.J., 2009. Start Codon Targeted (SCoT) Polymorphism: A Simple, Novel DNA Marker Technique for Generating - Dastmalchi, T., Omidi, M., Torabi, S., Madah Arefi, H., Etminan, A.R, Hassani, M.H. and Behzadi Rad, M., 2012. Evaluation of genetic variation in marsh mallow and hollyhock accessions (Althaea & Alcea spp L.) using AFLP markers, Journal of Genetics, 6(3): 79. magiran.com/p954664 - Dehghan, E., Dashti, H. and Baghizadeh, A., 2013. Antibacterial Effect of Ethanol Extract (Althaea Officinalis) on Streptococcus Pyogenes Compared with Prevalent Antibiotics In-Vitro. Journal of Rafsanjan University of Medical Sciences; 12(6): 461-74. - Delnavaz Hashemlouyan, B., Shabani, S. and Ataee Azimi, O., 2012, Extraction and determination of content terpene phenol mucilage leaf stem - Ghahfarokhi, S.Z.A., Saeedi, K. and Lori Naieni, Z., 2017. Evaluation of total phenolic composition and antioxidant capacity of Alcea koelzii ecotypes. The second Conference on Agriculture, Genetic Engineering and Plant Protection of Iran, Kerman, 3 June, https://civilica.com/doc/688839 - Golshani, Y., Zarei, M. and Mohammadi, S., 2015. Acute/Chronic Pain Relief: Is Althaea officinalis Essential Oil Effective. Avicenna Journal of Neuro Psych Physiology, 2(4): 100-105. - Hajimehdipoor, H., Amanzadeh, Y., Hasanloo, T., Shekarchi, M., Abedi, Z. and Pirali Hamedani, M., 2008. Investigating On the Quality of Wild Licorice Roots Collected from Different Regions of Iran. Journal of Medicinal Plants, 7(27): 106-114. - Heidari, A. and Kashefi, B., 2014. Evaluation of mucilage and phenol content in different - Kianitalaei, A., Feyzabadi, Z., Hamedi, S. and Qaraaty, M., 2019. Althaea Officinalis in Traditional Medicine and modern phytotherapy. Journal of Advanced Pharmacy Education & Research, 9(s2): 154-161. www.japer.in - Krishnaiah, D., Sarbatly, R. and Nithyanandam, R., 2012. Microencapsulation of Morinda citrifolia L. extract by spray-drying. Chemical Engineering Research and Design, 90(5): 622-632. - Lee, S.E., Hwang, H.J., Ha, J.-S., Jeong, H.-S. and Kim, J.H., 2003. Screening of medicinal plant extracts for antioxidant activity. Life Sciences, 73(2): 167-179. - Majdanesiri, B., 2013. Phytochemical study of different ecotypes of marshmallow (Alcea Koelzii L.) in Chaharmahal and Bakhtiari Province. The first regional congress of medicinal plants in the north of the country, Gorgan, 19 July, https://civilica.com/doc/247155 - Mirzaie, S. and Salari, H., 2021 Study on the genetic diversity of tomato’s cultivars via SCoT marker. Agricultural Biotechnology Journal, 13(4): 101-120. - Nezhadi, F., Karami, E., Fayyaz, F., Safari, H. and Rahimi, A., 2022. The evaluation of between and within species genetic diversity in seven different species of Achillea Accessions using SSR molecular markers. MGj 2022; 17(3): 307-322. - Shabani, M., Ahmadi Golsefidi, M. and Mazandarani, M., 2017. Phytochemical, antioxidant, antimicrobial and essential oil study of various organs of Althaea officinalis. L. southeastern region of Gorgan. 1st National Conference on Phytochemistry of Medicinal Plants, Health Promotion and Trade, Gorgan, https://civilica.com/doc/913649 - Soltani, L., Ebrahimi, F. and Mohammadi Nezhad, Q., 2020. Marker association and genetic - Tripathi, L. and Tripathi, J.N., 2005. Role of biotechnology in medicinal plants. Tropical Journal of Pharmaceutical Research, 2(2): 243-253. https://doi.org/10.4314/tjpr.v2i2.14607 - Uzunhisarcikli, M.E. and Vural, M., 2012. The taxonomic revision of Alcea and Althaea (Malvaceae) in Turkey. Turkish Journal of Botany, 36(6): 603-636. https://doi.org/10.3906/bot-1108-11 -Valiei, M., 2011. Chemical composition and antimicrobial activity of the flower and root hexane extracts of Althaea officinalis in Northwest Iran. Journal of Medicinal Plants Research, 5(32): 6972-6976. https://doi.org/10.5897/jmpr11.963 - Yadav, G.D. and Kamble, S.B., 2009. Synthesis of carvacrol by Friedel-Crafts alkylation of
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 572 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 500 |
||