اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات284
تعداد نشریات سازمان83
تعداد شماره‌ها2,604
تعداد مقالات29,895
تعداد مشاهده مقاله18,750,039
تعداد دریافت فایل اصل مقاله14,168,672
Ezzati Ghadi, Fereshteh, Roudbari, Zahra, Razavi, Rrazieh. (1402). Designing an Efficient Poly-Epitope Vaccine Based on Immunogenic Outer Membrane Proteins of Salmonella enterica Typhi. سامانه مدیریت نشریات علمی, (), -. doi: 10.22092/ari.2023.362354.2740
Fereshteh Ezzati Ghadi; Zahra Roudbari; Rrazieh Razavi. "Designing an Efficient Poly-Epitope Vaccine Based on Immunogenic Outer Membrane Proteins of Salmonella enterica Typhi". سامانه مدیریت نشریات علمی, , , 1402, -. doi: 10.22092/ari.2023.362354.2740
Ezzati Ghadi, Fereshteh, Roudbari, Zahra, Razavi, Rrazieh. (1402). 'Designing an Efficient Poly-Epitope Vaccine Based on Immunogenic Outer Membrane Proteins of Salmonella enterica Typhi', سامانه مدیریت نشریات علمی, (), pp. -. doi: 10.22092/ari.2023.362354.2740
Ezzati Ghadi, Fereshteh, Roudbari, Zahra, Razavi, Rrazieh. Designing an Efficient Poly-Epitope Vaccine Based on Immunogenic Outer Membrane Proteins of Salmonella enterica Typhi. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1402; (): -. doi: 10.22092/ari.2023.362354.2740

Designing an Efficient Poly-Epitope Vaccine Based on Immunogenic Outer Membrane Proteins of Salmonella enterica Typhi

Archives of Razi Institute
مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 28 شهریور 1402
نوع مقاله: Original Articles
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2023.362354.2740
نویسندگان
Fereshteh Ezzati Ghadi* 1؛ Zahra Roudbari2؛ Rrazieh Razavi3
1Department of Biology, Faculty of Science, University of Jiroft, Jiroft, Iran
2Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Jiroft. Jiroft, Iran.
3Department of Chemistry, Faculty of Science, University of Jiroft, Jiroft, Iran
چکیده
Consumption of contaminated water and foods by Salmonella Typhi cause the most common enteric disease known as Typhoid fever in both humans and animals. Despite the existence of various vaccines but infectious diseases remain a major cause of mortality worldwide. Nowadays, in-silico tools design a reliable and stable vaccine to combat such infections. Data based on microorganism genomes can help to predict the epitopes that can interact with the host immune system. However, mapping epitopes in immunogenic proteins is critical in peptide vaccine development. The study aimed to design and evaluate a multi-epitope vaccine based on the outer-membrane proteins of Salmonella Typhi. B-cells and T-cells epitopes were predicted. Predicted epitopes were connected by AAY, KK, and GPGPG linkers. Heparin-Binding Hemagglutinin Adhesin (HBHA) has been attached to the N-terminal of the final vaccine as a potent immune adjuvant. Epitope’s antigenicity, allergenicity, immunogenicity, and physicochemical characteristics were defined using in-silico tools. Molecular docking of vaccine-TLR4 was done. The RMSD of all atoms in the ligand-receptor complex gradually increases over time, and it continues until 20 ns. The RMSD graph of all atoms means that the ligand-receptor complex mostly remained stable, and the RMSD value converged within ~0.1 nm. ∆G of vaccine-TLR4 is -3.91×104 Kcal mol-1 with 1.93 RMSD. The results indicated protein was stable and non-allergen and Z-scores of multi-epitope vaccines are within the range of native proteins with similar sizes. In conclusion, the multi-epitope vaccine base on outer membrane proteins of the Salmonella Typhi bacterium might be considered to combat typhoid fever.
کلیدواژه‌ها
In-Silico؛ Typhoid؛ Multi-epitope؛ Vaccine
عنوان مقاله [English]
طراحی واکسن پلی اپی توپ کارآمد بر اساس پروتئین های غشای خارجی ایمونوژنیک سالمونلا انتریکا تیفی
چکیده [English]
مصرف آب و مواد غذایی آلوده به سالمونلا تیفی باعث شایع ترین بیماری روده ای به نام تب تیفوئید در انسان و حیوان می شود. علیرغم وجود واکسن‌های مختلف، بیماری‌های عفونی همچنان یکی از عوامل اصلی مرگ و میر در سراسر جهان هستند. امروزه ابزارهای درون سیلیکونی واکسنی قابل اعتماد و پایدار برای مبارزه با چنین عفونت هایی طراحی می کنند. داده‌های مبتنی بر ژنوم میکروارگانیسم‌ها می‌توانند به پیش‌بینی اپی توپ‌هایی که می‌توانند با سیستم ایمنی میزبان تعامل داشته باشند، کمک کنند. با این حال، نقشه برداری اپی توپ ها در پروتئین های ایمنی زا در توسعه واکسن پپتیدی حیاتی است. این مطالعه با هدف طراحی و ارزیابی یک واکسن چند اپی توپی بر اساس پروتئین های غشای خارجی سالمونلا تیفی انجام شد. سلول های B و اپی توپ سلول های T پیش بینی شدند. اپی توپ های پیش بینی شده توسط پیوندهای AAY، KK و GPGPG به هم متصل شدند. هماگلوتینین اتصال دهنده به هپارین (HBHA) به عنوان یک ادجوانت ایمنی قوی به N-ترمینال واکسن نهایی متصل شده است. آنتی ژنی، حساسیت زایی، ایمنی زایی و ویژگی های فیزیکوشیمیایی اپی توپ با استفاده از ابزارهای درون سیلیکو تعریف شد. اتصال مولکولی واکسن-TLR4 انجام شد. RMSD تمام اتم ها در مجموعه لیگاند-گیرنده به تدریج در طول زمان افزایش می یابد و تاns 20 ادامه می یابد. نمودار RMSD همه اتم‌ها به این معنی است که کمپلکس لیگاند-گیرنده عمدتاً ثابت مانده است، و مقدار RMSD همگرا در 0.1~ نانومترG∆ واکسن-TLR4 برابر باKcal mol-1 3.91×104 با 1.93 RMSD است. نتایج نشان داد پروتئین پایدار است و غیر حساسیت‌زا و Z-score واکسن‌های چند اپی توپی در محدوده پروتئین‌های بومی با اندازه‌های مشابه است. در نتیجه، پایه واکسن چند اپی توپی بر روی پروتئین های غشای خارجی باکتری سالمونلا تیفی ممکن است برای مبارزه با تب حصبه در نظر گرفته شود.
کلیدواژه‌ها [English]
in-silico, تیفوئید, مولتی اپیتوپ, واکسن
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 17


counter
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب