Molecular phylogeny of the genus Sanguisorba from Iran: Evidence based on cpDNA and nrDNA sequencing analysis

Faghir, Marzieh Beygom; Deylami Moezi, Adeleh; Shahi Shavvon, Robabeh

doi:10.22092/botany.2022.359495.1318

تعداد نشریات	281
تعداد نشریات سازمان	80
تعداد شماره‌ها	2,395
تعداد مقالات	27,748
تعداد مشاهده مقاله	15,456,630
تعداد دریافت فایل اصل مقاله	12,243,846

	Molecular phylogeny of the genus Sanguisorba from Iran: Evidence based on cpDNA and nrDNA sequencing analysis
Rostaniha
مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 15 اسفند 1401
نوع مقاله: Systematics and Biodiversity of Plants
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/botany.2022.359495.1318
نویسندگان
Marzieh Beygom Faghir ¹؛ Adeleh Deylami Moezi²؛ Robabeh Shahi Shavvon ³
¹دانشگاه گیلان
²Department of Biology, Faculty of Science, University of Guilan, Rasht,
³Faculty of ., Department of Biology, Faculty of Science, Yasouj University, Yasouj, science, university of Yazouj, Yasouj Iran
چکیده
In this research, the molecular phylogeny of the genus Sanguisorba (including two species (S. officinalis and S. minor), and the three subspecies (S. minor subsp. muricata, S. minor subsp. lasiocarpa, and S. minor subsp. minor) from Iran were studied using nrDNA ITS and cpDNA rpl32-trnL(UAG). A total of 26 taxa, comprising four Iranian samples plus 22 previously sequenced data received from Genbank were analyzed. In the present research, the phylogenetic relationships was reconstructed within Sanguisorba using maximum parsimony and Bayesian analyses. The results of nuclear sequence analysis showed separation of two subfamilies (Agrimoniinae and Sanguisorbinae), monophyly of Sanguisorba, complete separation of S. officinalis (in Sanguisorba clade) from S. minor and the three subspecies (in Poterium clade). Although, the intraspecific relationship remained unresolved, it was found that the use of micro-macro morphological criteria could be used as an important tool in different taxonomic ranks, especially in intraspecific identification. In addition, average sequence divergence, genetic differentiation, morphological and micro morphological evidence are discussed
کلیدواژه‌ها
Bayesian؛ maximum parsimony؛ micro-macro morphology: relationship؛ sequences divergence؛ taxonomic delimitation
عنوان مقاله [English]
مطالعه فیلوژنی جنس Sanguisorba در ایران: شواهدی مبتنی برتجزیه و تحلیل توالی DNA کلروپلاستی و هسته ای
نویسندگان [English]
مرضیه بیگم فقیر¹؛ عادله دیلمی معزی²؛ ربابه شاهی شاوون³
¹University of Guilan
²گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه گیلان
³استادیار گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه یاسوج، کد پستی 75918-74934، یاسوج، ایران
چکیده [English]
در بررسی حاضر، فیلوژنی مولکولی جنس Sanguisorba متعلق به گل‌سرخیان (شامل دو گونه S. officinalis و S. minor) و سه زیرگونه (S. minor subsp. muricata, S. minor subsp. lasiocarpa. و S. minor subsp. minor) از ایران با استفاده از nrDNA ITS و rpl32-trnL(UAG) مورد مطالعه قرار گرفت. در مجموع، 26 آرایه، شامل چهار نمونه از ایران به همراه 22 توالی از بانک ژن مورد آنالیز قرار گرفت. روابط فیلوژنتیکی گونه‌های Sanguisorba با استفاده از آنالیزهای ماکزیمم پارسیمونی و بایزین بازسازی شدند. نتایج آنالیز توالی هسته‌ای منجر به جدایی دو زیرطایفه (Agrimoniinae و Sanguisorbinae)، تک‌تباری جنس Sanguisorba و جدایی کامل S. officinalis (روی شاخه Sanguisorba) از S. minor و سه زیرگونه آن را (روی شاخه Poterium) شد. باوجودی که روابط فرو گونه حل نشده باقی ماند، اما معلوم شد، استفاده از معیارهای ‌ریخت‌شناسی و ریزریخت شناسی می تواند به عنوان ابزار مهمی برای تفکیک سطوح مختلف تاکسونومیک به ویژه، شناسایی فروگونه‌ایی استفاده شود. به علاوه، در این بررسی، میانگین درصد واگرایی نوکلئوتیدی، تفاوت توالی‌ها، شواهد ریخت‌شناسی و ریزریخت‌شناسی مورد بحث قرار گرفته است.
کلیدواژه‌ها [English]
بایزین, ‌ ریخت‌شناسی و ریزریخت‌شناسی, فیلوژنتیکی, ماکزیمم پارسیمونی, واگرایی نوکلئوتیدها, حد و مرز تاکسونومیک

آمار تعداد مشاهده مقاله: 13

Journal Management System. Designed by sinaweb.

آمار

Molecular phylogeny of the genus Sanguisorba from Iran: Evidence based on cpDNA and nrDNA sequencing analysis