- همه نشریات
- نشریات علمی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویچ کشاورزی
- مجلات ترویجی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- سایر نشریات سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- نشریات علمی انجمن ها
- علوم آب و خاک
- علوم اقتصاد و ترویج کشاورزی
- علوم جنگل, مرتع و آبخیزداری
- علوم دامی و شیلات
- علوم زراعی و باغی
- علوم گیاهپزشکی
- علوم مهندسی و مکانیزاسیون کشاورزی
- نشریات با زبان انگلیسی
- نشریات با زبان فارسی
- نشریات دانشگاه آزاد اسلامی
- نشریات علمی
آمار
| تعداد نشریات | 280 |
| تعداد نشریات سازمان | 79 |
| تعداد شماره‌ها | 2,346 |
| تعداد مقالات | 27,162 |
| تعداد مشاهده مقاله | 14,951,707 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 11,945,291 |
diagnostic of Canine Parvovirus type2 by designed multiple method and genetic characterization in Iran | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 19 خرداد 1401 | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2022.358646.2273 | ||
| نویسندگان | ||
Hadi Keyvanfar  1؛ Abbas Morovvati1؛ taghi zahraei salehi2؛ Seyed Dawood Mousavi Nasab3؛ mohsen zargar4
| ||
| 1Department of Pathobiology, Faculty of Veterinary Medicine, Science and Research Branch, Islamic Azad University | ||
| 2Department of Microbiology and Immunology, Faculty of Veterinary Medicine, University of Tehran | ||
| 3Department of Viral Vaccine Research center, Pasteur Institute of Iran. | ||
| 4Department of microbiology, Qom Branch, Islamic Azad University | ||
| چکیده | ||
| Canine parvovirus infection is the most highly infectious in dogs younger than six months. Our study aimed to design, and optimize of In-house PCR Assay for Rapid Detection of parvovirus type 2 and compares it with REAL-TIME PCR and LAMP Assay and phylogenetic analysis. The virulence gene selected for the categories was vp2 for CPV-2. PCR products were cloned in pTZ57R/T plasmid for preparation of positive control. Determination of the specificity of primers was done with the negative control virus genomes, and the limit of detection was determined for the Homemade PCR, REAL-TIME PCR, LAMP, and to perform phylogenetic study using partial vp2 gene sequences. Added analysis of PCR products using agarose gel electrophoresis for the vp2 gene showed 485bp and GAPDH 900 bp bands respectively amplification using negative control genomes as template was negative. The least detectable copy number for vp2 gene in a 25 µl PCR reaction equals 19 copies by homemade PCR, LAMP, and REAL-TIME PCR 25 and 21 copies, respectively. The phylogenetic analysis for the five field sequences formed three distinct clusters. The in-house PCR, having advantages such as high specificity, sensitivity, and the ability to detect major CPV-2 pathogen. This assay may replace the previous methods used in laboratories and work as an essential supplement to the more time-consuming assays. Phylogenetic analysis is necessary for epidemiological studies for the control and prevention of disease. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Polymerase chain Reaction؛ CPV؛ Molecular diagnostic؛ vp2؛ Phylogenetic Analysis | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| تشخیص پاروویروس تیپ 2 با طراحی روش های مختلف و ژنتیکی برای اولین بار در ایران | ||
| چکیده [English] | ||
| پاروویروس های سگ یکی از مهمترین عوامل ایجاد عفونت در سگ های کمتر از 6 ماه می باشد. در این مطالعه هدف بر طراحی تکنیک و بهینه کردن تکنیکPCR برای تشخیص سریع پاروویروس تیپ 2 سگ و مقایسه با تکنیک های Real Time PCR و LAMP و آنالیز فیلوژنتیک می باشد. ژن vp2 برای شناسایی CPV2 انتخاب گردید. محصولات PCR در پلاسمید pTZ57R/T برای تهیه کنترل مثبت کلون شدند. تعیین ویژگی پرایمرها با ژنومهای ویروس کنترل منفی انجام شد همچنین کمترین میزان تشخیص برای PCR ، Real Time PCR ، LAMP با استفاده از توالی ژن vp2 تعیین شد. تجزیه و تحلیل محصولات PCR با استفاده از الکتروفورز ژل آگارز برای ژن vp2 باند 485bp و GAPDH 900 جفت باز انجام گردید و برای نمونه های کنترل منفی فاقد باند مورد نظر بود. حداقل تعداد کپی قابل تشخیص برای ژن vp2 در واکنش PCR 19 کپی ، LAMP ،25 و Real Time PCR 21 کپی بود. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک برای پنج توالی ثبت شده ، سه خوشه مجزا را تشکیل داد. تکنیکPCR ، دارای مزایایی مانند ویژگی بالا، حساسیت و توانایی تشخیص پاتوژن CPV 2 است. این تکنیک ممکن است جایگزین روش های سنتی مورد استفاده در آزمایشگاه ها شود. تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک برای مطالعات اپیدمیولوژیک برای کنترل و پیشگیری از بیماری ضروری است. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| PCR, CPV, تشخیص مولکولی, vp2, آنالیز فیلوژنتیکی | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 7 |
||
