1انستیتو تحقیقات بین المللی ماهیان خاویاری، مؤسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، رشت، ایران
2گروه شیلات، دانشکده منابع طبیعی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
چکیده
در صنعت آبزی پروری، انتخاب بر مبنای اطلاعات ژنومیک از پتانسیل بالایی جهت ارتقای برنامههای ژنتیکی وسیستمهای تولید برخوردار است. انتخاب ژنومیک از روابط ژنومی واقعی بین افراد و همچنین اطلاعات حاصل از نشانگرهای ژنومی در LD قوی با ژنهای مهم اقتصادی و بیولوژیکی بهرهبرداری میکند. در این مقاله، پیشرفتهای تکنیکی، نیازهای عملی و کاربردهای اقتصادی که انتخاب ژنومیک را در بسیاری از صنایع آبزیپروری عملی کرده است، مورد بحث قرار میگیرد. استفاده از توالییابی مقرون به صرفه ژنوم امکان تعیین ژنوتیپ تعداد زیادی گونه بخصوص گونه های فاقد اطلاعات پیشین ژنومی را فراهم آورده است. کاربرد انتخاب ژنومیک مزیتهای قابل توجهی را از طریق پیش بینی دقیق صفات چند ژنی پیچیده از جمله مقاومت به بیماری، افزایش نرخ منفعت ژنتیکی، حداقل رسانی آمیزش خویشاوندی و خنثی نمودن اثرات بالقوه محدود کننده ناشی از فعل و انفعالات بین ژنوتیپ و محیط در مقایسه با آبزی پروری سنتی ارائه میدهد. بر اساس مطالعات صورت گرفته اجرای برنامههای انتخاب ژنومیک میتواند میزان آمیزش خویشاوندی را تا 81 درصد کاهش دهد. در حال حاضر انتخاب ژنومیک در مرحله ای از تکامل خود قرار داشته که در آن برنامههای اقتصادی میتوانند پذیرفته شده و راه حلهای طولانی مدت و یا کوتاه مدت برای نیل به آبزیپروری پایدار اقتصادی ارایه گردد.
1Department of genetics and Biotechnology, International Sturgeon Research Institute, Rasht, Iran.
2University of Tehran
چکیده [English]
In aquaculture industry, genomic selection has a profound potential to improve the genetic programs and production systems. Genomic selection benefits from both the actual relationship between animals and information from genomic markers in strong LD with commercially and biologically important genes. In this paper, technical progresses, practical requirements and commercial applications of genomic selection in aquaculture will be discussed. Using cost-effective genome sequencing, the genotyping capability in all type of organisms even those with no previous genetic knowledge has been provided. Usage of genomic selection proposes advantages more than traditional aquaculture through accurate estimation of polygenic complex traits such as disease resistance, increase the genetic gain, minimizing the inbreeding and negating the limiting effects of genotype by environment interactions. Based on the performed studies, implementation of a genomic selection program can reduce the rates inbreeding up to 81%. At the moment, the genomic selection is now at the position which can be involved in commercial breeding programs to suggest long and/or short term solutions towards reaching the commercial sustainable aquaculture.
کلیدواژهها [English]
Genotyping by sequencing, Inbreeding, Selection, Single nucleotide polymorphism, QTL