| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 2,873 |
| تعداد مقالات | 32,555 |
| تعداد مشاهده مقاله | 42,418,924 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 19,194,557 |
تجزیه ارتباطی بین صفات جوانه‌زنی و نشانگرهای AFLP در برنج (Oryza sativa L.) | ||
| علوم و فناوری بذر ایران | ||
| مقاله 8، دوره 9، شماره 3 - شماره پیاپی 19، آذر 1399، صفحه 113-130 اصل مقاله (925.32 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22034/ijsst.2019.110749.1096 | ||
| نویسندگان | ||
| حسین صبوری* 1؛ شریفه محمد الق1؛ عباس بیابانی2؛ احمدرضا دادرس3؛ عاطفه صبوری4؛ مهناز کاتوزی5؛ محبوبه نجار عجم6؛ ماهم پیراسته6؛ رسول خاتمی نژاد7 | ||
| 1گروه تولیدات گیاهی. دانشکده کشاورزی. دانشگاه گنبد کاووس | ||
| 2گروه تولیدات گیاهی. دانشگاه گنبد کاووس | ||
| 3گروه باغبانی. مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی زنجان | ||
| 4گروه زراعت و اصلاح نباتات. دانشگاه گیلان | ||
| 5گروه اصلاح نباتات. دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان | ||
| 6گروه تولیدات گیاهی دانشگاه گنبد کاووس | ||
| 7گروه علوم دامی-دانشگاه گیلان | ||
| چکیده | ||
| برنج غذای اصلی بیش از نیمی از جمعیت جهان را به خود اختصاص داده است. به طور کلی، برنج در 161 میلیون هکتار زمین کشت شده و سالانه 7/678 میلیون تن شلتوک تولید می‌شود. جوانه زنی از مهمترین مراحل رشد برنج محسوب می شود. به منظور بررسی روابط بین نشانگرهای AFLP و صفات جوانه‌زنی، 192 لاین برنج مورد بررسی قرار گرفتند. لاین‌های در قالب طرح اگمنت با 100 بذر در هر لاین استفاده شد. هدف این بررسی شناسایی نشانگرهای پیوسته به مکان‌های ژنی کنترل کننده طول ساقه‌چه، طول ریشه‌چه، طول کلئوپتیل و درصد جوانه‌زنی بود. 21 ترکیب آغازگری EcoRI و MseI در کل تعداد 376 نوار تولید نمودند که از این تعداد، 303 نوار چندشکل بودند و به طور متوسط 03/75 درصد چندشکلی داشتند. بیشترین تغییرات طول ساقه‌چه توسط نشانگرهای E080-M140-11 (55/19 درصد)، E060-M160-11 (92/17 درصد) و E080-M150-11 (87/17 درصد) تبیین شد. نشانگرهای E060-M160-11، E080-M150-11، E110-M150-8 و E120-M150-5 با هر دو صفت طول ساقه‌چه و طول ریشه‌چه مرتبط بودند. با توجه به درصد توجیه بالای نشانگرهای ذکر شده و پیوستگی معنی‌دار آن‌ها با صفات جوانه‌زنی، می‌توان از نشانگرهای حاوی اطلاعات بالای این تحقیق، در برنامه‌های انتخاب به کمک نشانگر جهت بهبود آن‌ها استفاده نمود | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| برنج؛ تجزیه ارتباطی؛ جوانه‌زنی؛ نشانگرهای AFLP | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Association analysis between germination traits and AFLP markers in rice (Oryza sativa L.) | ||
| نویسندگان [English] | ||
| hossein sabouri1؛ Sharifeh Mohammad Alegh1؛ Abbas Biabani2؛ Ahmad Reza Dadras3؛ Atefeh Sabouri4؛ Mahnaz Katouzi5؛ mahboubeh Najjar Ajam6؛ mahem pirasteh6؛ Rasoul Khataminejad7 | ||
| 1Department of plant production, collage of agriculture science, Gonbad Kavous University | ||
| 2department of plant production. Gonbad Kavous University | ||
| 3Horticulture Department, Agriculture science and natural resource of Zanjan | ||
| 4Agronomy and Plant Breeding Department, University of Guilan | ||
| 5Department of Plant breeding, Gorgan University | ||
| 6Gonbad Kavous University | ||
| 7Guilan University | ||
| چکیده [English] | ||
| Rice (Oryza sativa L.) is a staple food for more than half of the world's population. Globally, rice is grown on 161 million hectares, with an average annual production of 678.7 million tonnes. Germination is one of the important stage in rice life. In order to investigate the relationships among AFLP markers and germination traits in rice plants, 192 Rice lines were evaluated. Lines were used in the form of an augument design with 100 seeds per line. The purpose of this study was to identify linked markers for gene controlling plumule length, root length, coleoptile length and germination percentage. 21 primer combinations of EcoRI and MseI a total of 376 bands were produced, of which, 303 bands were polymorphic and had an average of 75.03 percent polymorphism. The most variation in plumule length were determined by E080-M140-11 (19.55%), E060-M160-11 (17.92%) and E080-M150-11 (17.87%).060-M160-11, E080-M150-11, E110-M150-8 and E120-M150-5 Markers were associated with both shoot and root length, which represents an extremely close association of the traits together, or possibly are affected multi-effect genes. Using linked markers with germination traits in this study, we can use markers to help them improve them. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| AFLP Markers, Association analysis, Germination, Rice | ||
| مراجع | ||
|
Agrama, H.A., G.C. Agrama, and W. Yan. 2007. Association mapping of yield and its components in rice Cultivars. Mol. Breed. 19: 341–356. Brar, D.S., and G.S. Khush. 2002. Transferring genes from wild species into rice. Pp: 197-217. In: Kang, M. S. (ed.) Quantitative Genetics, Genomics and Plant Breed. Cabi. Breseghello, F., and M.E. Sorrells. 2006. Association analysis as a strategy for improvement of quantitative traits in plants. Crop Sci. 46: 1323–1330. Dadras, A. R. 2012. Evaluation of genetic diversity of tobacco (Nicotiana tabacum L.) cultivars sing AFLP molecular marker. MSc. Thesis. Shahid Bahonar Univ.of Kerman, Iran. (In Persian, with English Abstract) Dadras, A.R., H. Sabouri, G. Mohammadi-Nejad, A. Sabouri, and M. Shoai-Deylami, 2014. Association analysis, genetic diversity and structure analysis of tobacco based on AFLP markers. Molecular Biology Reports, 41(5): 3317-3329. Delesalle, V., and S. Blum. 1994. Variation in germination and survival among families of Sagittarian latifolia in response to salinity and temperature. Int. J. Plant Sci. 155: 187-195. Evanno, G., E. Reganut, and J. Goudet. 2005. Detecting the number of clusters of individuals using the software STUCTURE: a simulation study. Mol. Ecol. 14: 2611-2620. Foti, S., S.L. Cosentino, C. Patane, and G.M.D. Agosta. 2002. Effects of osmoconditioning upon seed germination of sorghum (Sorghum bicolor L.) under low temperatures. Seed Sci. Technol. 30: 521-533. Hu, S.P., H. Yang, G.H. Zou, H.Y. Liu, G.L. Liu, H.W. Mei, C. Run, M.S. Li, and L.J. Luo. 2007. Relationship between coleoptile length and drought resistance and their QTL mapping in rice. Rice Sci. 14: 13-20. Ivandic, V., C.A. Hackett, E. Nevo, R. Keith, W.T.B. Thomas, and B.P. Forster. 2002. Analysis of simple seque.nce repeats (SSRs) in wild barley from the Fertile Crescent: associations with ecology, geography and flowering time. Plant Mol. Biol. 48: 511–527. Liu, G., Z. Zhang, H. Zhu, F. Zhao, X. Ding, R. Zeng, W. Li, and G. Zhang. 2008. Detection of QTLs with additive effects and additive by environment interaction effects on panicle number in rice (Oryza sativa L.) with single-segment substitution lines. Theor. Appl. Genet. 116: 923–931. Mardani, Z., B. Rabiei, H, Sabouri, and A. Sabouri. 2013. Mapping of QTLs for germination characteristics under non-stress and drought stress in rice. Rice Sci. 20(6): 391-399. Naghavi M. R., B. Gharehyazi, and Gh. Hossein, 2009. Molecular Markers. Tehran University Pree. 340 pp. (In Persian) Pritchard, J. K., M. Stephens, N.A. Rosenberg, and P. Donnelly. 2000. Association mapping in structured populations. Am. J. Hum. Genet. 67: 170-181. Rabiei, B., Z. Mardani, Kh. Ghomi, H. Sabouri, and A. Sabouri. 2017. The Effect of Rice Chromosome 1 on Traits Associated with Drought and Salinity Tolerance at Germinating and Seedling Stage. Seed and Plant Improv. 1 (30): 1-16. (In Persian, with English Abstract) Raiesi, T., and A. Sabouri. 2015. Validation and association analysis of microsatellite markers related to drought and salinity tolerance in aerobic and Iranian rice under osmotic stress. Crop Biotech. 10: 57-72. (In Persian, with English Abstract) Rashidi Monfared, S., M. Mardi, A. H. Hossinzade, and M. R. Naghavi. 2011. Communication breakdown between important agronomic traits and retrotransposon SSAP markers in samples of durum wheat. Genet. novin. 3 (2): 29-35. (In Persian, with English Abstract) SaghaiMaroof, M. A., R. M. Biyashev, G. P. Yang, Q. Zhang, and R. W. Allard. 1994. Extraordinarily polymorphic microsatellite DNA in barely: species diversity, chromosomal locations, and population dynamics. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S. Am. 91: 5466-5570. Sayyed Tabatabaei B.A., and A.A. Shahnejat-Boshehri, 2003. Barlet genetic linkage map based on AFLP. Iranian J. Crop Sci. 34(1): 9-18. (In Persian, with English Abstract) Shalini, K.V., S. Manjuathan, P. Lebrun, A. Berger, L. Baudouin, N. Pirany, R.M. Ranganatha, and D. Theertha Prasad. 2007. Identification of molecular markers associated with mite resistance in coconut (Cocos nucifera L.). Genome. 50: 35-42. Spataro, G., B. Tiranti, P. Arcaleni, E. Bellucci, G. Attene, R. Papa, P. Spagnoletti Zeuli, and V. Negri, 2011. Genetic diversity and stucture of a worldwide collection of Phaseolus coccineus L. Theor. Appl. Genet. 122: 1281-1291. Vos, P., R. Hogers, M. Bleeker, M. Reijans, T.V.D. Lee, M. Hornes, A. Frijters, J. Pot, J. Peleman, M. Kuiper, and M. Zabeau. 1995. AFLP: a new technique for DNA fingerprinting. Nucleic Acids Res. 23: 4407-4414. Zeng, D.L., L.B. Guo, Y.B. Xu, K. Yasukumi, L.H. Zhu, and Q. Qian. 2006. QTL analysis of seed storability in rice. Plant Breed. 125: 57-60. Zhang, Z.H., S.B. Yu, T. Yu, Z. Huang, and Y.G. Zhu. 2005. Mapping quantitative trait loci (QTLs) for seedling Vigor using recombinant inbred lines of rice (Oryza sativa L.). Field Crop Res. 91: 161-170. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 357 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 226 |
||