- همه نشریات
- علوم آب و خاک
- علوم اقتصاد و ترویج کشاورزی
- علوم جنگل, مرتع و آبخیزداری
- علوم دامی و شیلات
- علوم زراعی و باغی
- علوم گیاهپزشکی
- علوم مهندسی و مکانیزاسیون کشاورزی
- مجلات ترویجی کشاورزی
- نشریات انجمن ها
- نشریات با زبان انگلیسی
- نشریات با زبان فارسی
- نشریات دانشگاه آزاد اسلامی
- نشریات علمی
- نشریات علمی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویچ کشاورزی
آمار
| تعداد نشریات | 277 |
| تعداد نشریات سازمان | 76 |
| تعداد شماره‌ها | 2,023 |
| تعداد مقالات | 23,295 |
| تعداد مشاهده مقاله | 12,411,121 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 10,086,108 |
Optimized DNA extraction and purification method from Alchemilla species using polyethylene glycol. | ||
| Rostaniha | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 10 دی 1399 | ||
| نوع مقاله: Research Paper | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/botany.2020.343501.1211 | ||
| نویسندگان | ||
Samira Shokatyari   1؛ Marzieh Beigom Faghir 2؛ Shahrokh Kazempour Osaloo 3؛ Mohammad Mahdi Sohani 4
| ||
| 1Department of Biology, Faculty of Science, University of Guilan, Rasht- Iran, | ||
| 2Associate Prof, Department of Biology, Faculty of Science, University of Guilan, Rasht- Iran | ||
| 3Department of Plant Biology, Faculty of Biological Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran | ||
| 4Faculty of agriculture, University of Guilan,,Rasht- Iran | ||
| چکیده | ||
| The extraction of DNA from plants producing large amounts of secondary metabolites is a significant challenge. Pure DNA is essential in various techniques of molecular biology. Genus Alchemilla is known to synthesize a large number of secondary metabolites which reduce the quality of the extracted DNA. This study aimed to set up a method for high-quality DNA isolation from Alchemilla leaf. We examined three extraction methods. Furthermore, a comparison concerning price, simplicity, and security is carried out. We optimized a CTAB-based method using increasing the volume and concentration of CTAB buffer, lysis time, and cold incubation period, performing six times dilutions, and three times precipitations, adding polyethylene glycol, and removing toxic or expensive materials. The results showed that 260/280 and 260/230 ratios of extracted DNA by the optimized method were 1.75-1.82 and 1.56-1.68 respectively, also concentration was 595-387 ng/µL. The quality of extracted DNA by this method was significantly higher (p ˂ 0.0001) than that of other ways, so that all samples were positive for DNA, as assessed by electrophoresis and PCR. The optimized method was simple, effective, reproducible, relatively non-toxic, and inexpensive. The results revealed that the optimized method was successful in producing large amounts of high-quality amplifiable DNA. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Nucleic acid purity؛ phenolic compounds؛ polysaccharide compounds؛ secondary metabolites؛ spectrophotometry | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| روش بهینه سازی شده جداسازی و تخلیص DNA از جنس Alchemilla با استفاده از پلی اتیلن گلیکول. | ||
| نویسندگان [English] | ||
| سمیرا شوکت یاری1؛ مرضیه بیگم فقیر2؛ شاهرخ کاظم پور اصالو3؛ محمد مهدی سوهانی4 | ||
| 1گروه زیست شناسی ، دانشکده علوم ، دانشگاه گیلان- رشت- ایران | ||
| 2گروه زیست شناسی ، دانشکده علوم ، دانشگاه گیلان - رشت ایران | ||
| 3گروه زیست شناسی گیاهی ، دانشکده علوم زیست شناسی ، دانشگاه تربیت مدرس -تهران-ایران | ||
| 4دانشکده کشاورزی ، دانشگاه گیلان -رشت-ایران | ||
| چکیده [English] | ||
| استخراج DNA از گیاهان با مقادیر زیاد متابولیت‌های ثانویه بسیار مشکل است. اﺳﺘﺨﺮاجDNA ﺧﺎﻟﺺ جهت مطالعات مولکولی ضروری می‌باشد. جنس Alchemiila متابولیت‌های ثانویه متنوعی تولید میکند، که باعث کاهش کیفیت DNA استخراجی می‌شوند. این مطالعه با هدف استخراج آسان و ارزان DNA با کمیت و کیفیت بالا از نمونه‌های برگ این جنس انجام شد. در این مطالعه سه روش استخراج DNA مقایسه شد. در انتخاب روش بهینه چند نکته اساسی مد نظر بود که شامل هزینه، سادگی و حدف مواد شیمیایی خطرناک می‌باشد. این مطالعه با ایجاد تغییرات قابل توجهی در روش CTAB از قبیل تغییر حجم و غلطت بافر استخراج، مدت زمان انکوباسیون‌ها، انجام شش مرحله شست و شو و سه مرحله رسوب، افزودن پلی اتیلن گلیکول، وﻫﻤﭽﻨﻴﻦ ﺣﺬف مواد ﭘﺮﻫﺰﻳﻨﻪ و خطرناک مانند نیتروژن مایع و بتا مرکاپتواتانول، قادر به جداسازی ایمن و ارزان مقدار زیادی DNA با کیفیت مطلوب شد. کمیت و کیفیت DNA های استخراجی توسط روش نانومتری، الکتروفورز ژل آگارز و واکنش زنجیره‌ای پلیمرازمشخص شد. طبق نتایج نسبت ۲۸۰/۲۶۰ DNAاستخراجی به روش بهینه سازی شده در این مطالعه بین 75/1 تا 82/1و نسبت ۲۳۰/۲۶۰ بین 56/1 تا 68/1 اندازه گیری شد و همچنین غلظت ۳۸۷ تا 595 نانوگرم در میکرولیتر بود که این اعداد به طرز قابل توجهی (P ˂ 0.0001)از اعداد مربوط به DNA حاصل از سایر روش‌ها بیشتر بود. پروتوکل بهینه سازی شده ساده، موثر، قابل تکرار، نسبتا غیرسمی و ارزان بود. نتایج نشان داد این پروتکل در تولید مقادیر کافی از DNA با کیفیت قابل قبو ل برای سنجش‌های ژنتیکی موفق بود. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| اسپکتروفتومتری, ترکیبات پلی ساکارید, ترکیبات فنلی, خلوص اسید نوکلیک, متابولیت‌های ثانویه | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 5 |
||
