| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 2,873 |
| تعداد مقالات | 32,555 |
| تعداد مشاهده مقاله | 42,418,947 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 19,194,599 |
شناسایی مولکولی جنس توس (Betula) براساس توالییابی ناحیه ITS و ساختار ثانویه آن در ایران | ||
| تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران | ||
| مقاله 3، دوره 22، شماره 2، اسفند 1393، صفحه 168-180 اصل مقاله (620.42 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله علمی - پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ijrfpbgr.2015.12208 | ||
| نویسندگان | ||
| حمید بینا1؛ حامد یوسف زاده* 2؛ محمد اسماعیل پور3؛ امید اسماعیل زاده4 | ||
| 1دانشجوی کارشناسی ارشد، رشته جنگل‌داری، دانشگاه تربیت مدرس، نور | ||
| 2نویسنده مسئول مکاتبات، استادیار دانشکده منابع طبیعی دانشگاه تربیت مدرس، نور پست الکترونیک:h.yousefzadeh@ modares.ac.ir | ||
| 3عضو هیئت علمی پژوهشگاه علوم و تکنولوژی پیشرفته و علوم محیطی، کرمان | ||
| 4استادیار دانشکده منابع طبیعی دانشگاه تربیت مدرس، نور | ||
| چکیده | ||
| در این تحقیق فیلوژنی و جایگاه تاکسونومیکی توسهای ایران بر اساس توالییابی ناحیه فاصله‌انداز رونویسی شونده داخلی (ITS) مورد بررسی قرار گرفت. برای این منظور نمونه برگ از چهار جمعیت باقیمانده از توس در ایران جمعآوری و پس از استخراج DNA ناحیه ITS آن تکثیر و توالییابی شد. نتایج نشان داد که طول کل ناحیه ITS برای زیرجنسهای مختلف توس 610 تا 611 جفت باز و برای نمونههای توس ایران 611 جفت باز بود. نمونههای توس ایران از لحاظ درصد نوکلئوتیدهای تشکیل‌دهنده بیشترین میزان شباهت و کمترین فاصله ژنتیکی را با گونه B. pendula نشان دادند. بر اساس تحلیل جایگاههای نوکلئوتیدی، توسهای ایران بهدلیل داشتن نوکلئوتید انحصاری T در جایگاه 209 از سایر توسهای مورد مطالعه متمایز بود. همچنین چهار نوع ساختار ثانویه ITS2 متمایز، برای کل گونههای مورد بررسی از جنس توس شناسایی شد. رسم درخت فیلوژنی حکایت از تک نیایی جنس توس داشت. بر این اساس گونههای مختلف جنس توس در سه گروه اصلی قرار گرفتند. توسهای ایران بههمراه گونه B. pendula در اولین شاخه گروه اوّل قرار گرفتند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| فیلوژنی؛ توس؛ ITS؛ DNA بارکدینگ؛ تنوع ژنتیکی | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Molecular identification of the genus Betula based on ITS sequence data and its secondary structure in Iran | ||
| نویسندگان [English] | ||
| hamid bina1؛ hamed yousefzadeh2؛ mohammad esmaeelpour3؛ omid esmaeelzadeh4 | ||
| چکیده [English] | ||
| Nucleotide sequences of internal transcribed spacer (ITS) of nuclear ribosomal DNA were used to infer the phylogeny and molecular taxonomy status of Betula species. Three remnant populations of Betula from Hyrcanian forests and one population from Zagros forest were selected. Leaf DNA were extracted and ITS regions were amplified on the selected samples. Entire lengths of the ITS1-5.8S-ITS2 region were 610-611 bp for all of the studied Betula samples and 611 bp for Iranian samples. Maximum similarity in nucleotide composition and minimum genetic distance of Iranian Betula were observed with Betula pendula from subgenus of Betula. According to character based method, Iranian Betula was distinguished from other Betula species due to having unique nucleotide at position 209. Four secondary structure ITS2 type were recognized for all of the studied Betula species. Construction of the phylogenetic trees of ITS data supported monophyly of the genus Betula and divided into three major groups with more than 73% bootstrap support. The first Group comprises four minor groups by which Iranian Betual with B. pendula was located in Clade I. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Betula, DNA barcoding, Genetic diversity, ITS, phylogeny | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2,221 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,171 |
||