1دانش آموخته کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران
2نویسنده مسئول مکاتبات، استادیار، دکترای تخصصی اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران پست الکترونیک: gh.mirzaghaderi@uok.ac.ir
3استادیار، دکترای تخصصی اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران
چکیده
مونوترپنها یکی از مهمترین گروههای تشکیلدهنده ترپنها میباشند که به صورت موادی مانند لیمونن، کارواکرول و تایموکینون در بذر گیاه سیاهدانه وجود دارند. از ژنهای مهم اثرگذار در مسیر بیوسنتزی مونوترپنها ژن ژرانیل دیفسفاتسنتاز (GPPS) است که تولیدکننده پیشساز مونوترپنها میباشد. هدف از این تحقیق بررسی بیان رونویسی این ژن در ژنوتیپهای گیاه دارویی سیاهدانه بود، بنابراین استخراج RNA، سنتز cDNA، جداسازی و تعیین توالی این ژن از گیاه دارویی سیاهدانه انجام شد. در ادامه بیان GPPS از طریق RT-PCR نیمهکمی، با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژنهای GPPS و GAPDH انجام شد. نتایج حاصل از RT-PCR نیمهکمی نشان داد که بیان رونویسی ژن ژرانیل دیفسفاتسنتاز در بافتهای ساقه و برگ به طور معنیداری بیشتر از بافتهای ریشه، کپسول و بذر میباشد. قطعه توالییابی شده مربوط به ژن GPPS در پایگاه دادههای ژنومی (NCBI) به شماره دسترسی KF614970.1 وجود دارد.
Transcript expression analysis of geranyl diphosphate synthase gene
in different tissues of black cumin (Nigella sativa L.)
نویسندگان [English]
mohammad hasan shamsifard1؛ ghader mirzaghaderi2؛ mohammad majdi3
چکیده [English]
Monoterpenes are one of the major groups of terpenes which are present in black cumin (Nigella sativa L.) as limonene, carvacrol, thymoquinone etc. One of the key genes in monoterpene biosynthesis is geranyl diphosphate synthase (GPPS) that produces a monoterpene precursor. The aim of this study was to investigate the expression of the genes in black cumin. RNA was extracted, cDNA was synthesized and a partial sequence of GPPS gene was isolated using degenerate primers and sequenced. Moreover, RNA was extracted from different tissues of the species and semi-quantitative RT-PCR using specific primers of GPPS gene and GAPDH as housekeeping gene in order to study the pattern of GPPS gene expression. Results showed that transcript expression of geranyl diphosphate synthase in stem and leaf is significantly higher than that of root, capsule and seed.
کلیدواژهها [English]
Black cumin, geranyl diphosphate synthase gene, transcript expression