| تعداد نشریات | 284 |
| تعداد نشریات سازمان | 82 |
| تعداد شماره‌ها | 2,784 |
| تعداد مقالات | 31,679 |
| تعداد مشاهده مقاله | 40,110,157 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 17,604,369 |
بررسی تنوع پروتئینی و میزان بیان پپتیدهای متفاوت در اکوتیپ‌های گیاه ناخنک (Astragalus hamosus L) با استفاده از روش SDS-PAGE | ||
| تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران | ||
| مقاله 3، دوره 27، شماره 2 - شماره پیاپی 54، اسفند 1398، صفحه 193-203 اصل مقاله (868.37 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله علمی - پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ijrfpbgr.2019.110684.1258 | ||
| نویسندگان | ||
| حسین زینلی* 1؛ مهدی هادی‌پور2؛ آذر آرتی3؛ مریم صادقی4؛ معصومه حسن بارانی5 | ||
| 1دانشیار، بخش تحقیقات منابع طبیعی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان اصفهان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، اصفهان، پست الکترونیک: hoszeinali@yahoo.com | ||
| 2کارشناس ارشد بیوتکنولوژی، دانشگاه صنعتی اصفهان | ||
| 3کارشناس ارشد بیوتکنولوژی، دانشگاه پیام نور | ||
| 4کارشناس ارشد سیستماتیک اکولوژی، دانشگاه اصفهان | ||
| 5دانش‌آموخته دکترای سیستماتیک گیاهی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران | ||
| چکیده | ||
| DOR: 98.1000/1735-0891.1398.27.193.54.2.1576.69 ناخنک (Astragalus hamosus) گیاهی یکساله، علفی متعلق به خانواده بقولات میباشد. شناخت الگوی تنوع گونه‌ها امری مهم در برنامه‌های به‌نژادی بوده و منجر به آگاهی از فرایندهای تکاملی می‌شود. این مطالعه به منظور بررسی تنوع پروتئینی اکوتیپ‌های این گیاه انجام شد. با توجه به آنالیز تنوع پروتئینی گیاه A.hamosus، محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) در این مطالعه برابر 49/0 محاسبه شد. نمودار خوشه‌ای با ضریب تشابه دایس و به‌روش UPGMA ترسیم شد. اکوتیپ‌های مورد مطالعه با استفاده از خط شاخص، در ضریب تشابه 88 درصد در سه زیرگروه قرار گرفتند. از 13 اکوتیپ مورد مطالعه، 11 مورد با تشابه نسبتاً بالایی در یک گروه قرار گرفتند. اکوتیپ1 کرمانشاه با تفاوت معنی‌داری از سایر اکوتیپ‌ها تفکیک شد. با توجه به نتایج حاصل از میزان بیان 7 پپتید بررسی شده در 13 اکوتیپ مورد مطالعه، از لحاظ تجمعی بیشترین و کمترین بیان پپتیدی، به ترتیب مربوط به پپتید6 با 24195 واحد و 7 با 4328 واحد نرم‌افزار PhoretixPro مشاهده گردید. بر اساس آنالیز نمودارها، در کل پپتیدهای بیان شده در اکوتیپ‌های مختلف، بیشترین بیان مربوط به پپتید4 از اکوتیپ2 کرمانشاه بود. پپتید7 در هیچ‌یک از اکوتیپ‌های مورد بررسی دیگر حتی به میزان بسیار اندک نیز بیان نشده بود. در واقع با ظهور این پپتید، پروتئین جدیدی به پروفایل پروتئینی گیاه A. hamosus موجود در اکوتیپ کرمانشاه اضافه گردید. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| بیان پروتئین؛ تنوع پروتئینی؛ ناخنک؛ اکوتیپ | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Evaluation of protein variation and different peptides expression content in Astragalus hamosus L. ecotypes using SDS-PAGE method | ||
| نویسندگان [English] | ||
| H. Zeinali1؛ M. Hadi Pour2؛ A. Arti3؛ M. Sadeghi4؛ M. Hasan Barani5 | ||
| 1Associ. Prof., Natural Science Department, Isfahan Agricultural and Natural Resources, Research and Education Center, AREEO, Isfahan, I.R. Iran, E-mail: hoszeinali@yahoo.com | ||
| 2M.Sc., Isfahan University of Technology, Isfahan, I.R. Iran. | ||
| 3M.Sc., Payam Nour University, I.R. Iran. | ||
| 4M.Sc., Ecology systematic of Isfahan university, Isfahan, I.R. Iran. | ||
| 5Ph.D. Graduate Plant systematic, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, I.R. Iran. | ||
| چکیده [English] | ||
| Astragalus hamosus L. is an annual, herbaceous belonged to Leguminosae family. Understanding the pattern of plant species diversity is important in breeding programs and leads to awareness of evolutionary processes. This study was conducted on protein diversity of the ecotypes of this plant species. According to the protein variation analysis of A.hamosus, the polymorphism index content (PIC) was calculated as 0.49. Cluster dendrogram was drawn using Dice similarity coefficient and UPGMA method. The ecotypes were classified into three subgroups with cophenetic correlation coefficient 0.88. Out of the 13 ecotypes, 11 were grouped together with relatively high similarity. Kermanshah ecotype no1 was significantly separated from other ecotypes. According to the results of the expression of seven peptides studied in 13 ecotypes, the highest and lowest cumulative expression levels belonged to peptides6 and 7 with 24195 and 4328 units by PhoretixPro software, respectively. Based on biplot analysis, the highest expression of peptides in all different ecotypes was related to peptide 4 of Kermanshah ecotype 2. Peptide 7 was not expressed in any other ecotypes, even at very low levels. It was concluded that a new protein was added to the protein profile of A. hamosus in the Kermanshah ecotype with the emergence of this peptide. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Protein expression, Protein variation, A. hamosus, PhoretixPro | ||
| مراجع | ||
|
- Acik, L., Ekici, M. and Celebi, A., 2004. Taxonomic relationships in Astragalus sections Hololeuce and Synochreati (Fabaceae): evidence from RAPD-PCR and SDS-PAGE of seed proteins. Annales Botanici Fennici, 41: 305-317. - Allpin, L., Brian, N. and Matheson, T., 2005. Reproductive success and genetic divergence among varieties of the rare and endangered Astragalus cremnophylax (Fabaceae) from Arizona, USA. Conservation Genetics, 6(5): 803-821. - Anand, K., Srivastava, R. and Chaudhary, L., 2010. Analysis of Genetic Diversity in Astragalus rhizanthus Benth. ssp. rhizanthus var. rhizanthus (Fabaceae) Using Molecular Markers from India. Journal of Botany, pp. 1-9. - Bagheri, A., Kochaki, A. Zand, A. 1996. Plant breeding in sustainable agriculture. Mashad Jahad Danshgahhi publication Mashad, Iran (In Persian). - Bradford, M., 1976. A rapid and sensitive method for the quantification of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding. Analytical Biochemistry, 72:248-254. - Bushman, B., Bhattarai, K. and Johnson, D., 2010. Population structures of Astragalus filipes collections from western North America. Botany, 88(6): 565-574. - Chavla, Ch., 2003. Introduction Biotechnology Plant. (Translated by Farsi, M. and Zolali M.), Mashad Jahad Daneshgahi publication, Mashad, Iran. (In Persian). - Dane, F., Aksoy, O. and Yilmaz, G., 2007. Karyological and palynological studies on Astragalus hamosus and A. glycyphyllos in Turkey. Phytological Balcanica, 13 (3): 387-391. - Huang, L., Chen, Zh., Zhang, Xi., Wang, Zh. and Liu, Ch., 2009. A Comparative Analysis of Molecular Diversity of Erect Milkvetch (Astragalus adsurgens) germplasm from North China Using RAPD and ISSR Markers. Biochemical Genetics, 47: 92-99. - Knaus, B., Cronn, R. and Liston, A., 2005. Genetic characterization of three varieties of Astragalus lentiginosus (Fabaceae). Brittonia, 57(4): 334-344. - Krasteva-Platikanov, S., Nikolav, S. and Kologa, M., 2007. Flavonoid from Astragalus hamosus. Natural Product Research, 21:392-395. - Luo, M., Hwu, K. and Huang, T., 2000. Taxonomic study of Taiwan Astragalus based on genetic variation. Taxon, 49: 35-46. - Masumi, A., 2003. Iranian Flora, Papilionaceae, Astragalus, Research institute of Forests and Rangelands. N0, 43. - Mohamadi Javidi, R., 2011. Medicinal plant and fruits, Aftab Ghoban publication, 389 Pp. (In Persian) - Patane, C. and Gresta, F., 2006. Germination of Astragalus hamosus and Medicago orbicularis as affected by seed-coat dormancy breaking techniques. Journal of Arid Environments, 67:165-173. - Pavokovi, D., Krinik, B., Amvam Zollo, P. and Mothur, S., 2012. Evaluation of Protein Extraction Methods for Proteomic Analysis of Non-Model Recalcitrant Plant Tissues. Croatica Chemica Acta, 85(2): 177-183. - Rahim Malek, M., Fazilati, M., Gharibi, SH. and Vahabi, M., 2011. Evaluation of Genetic Variation of Yellow and White Astragalus (Astragalus sp.) in Protected Regions of Isfahan Province Using ISSR Marker. Journal of Crop Production and Processing, 1(1):25-34. - Soltani, A., 2004 Traditional medicine (Medicinal plant), Arjmand publication, The first Vol A-B.(In Persian) - Stillman, J., 2003. Acclimation capacity underlies susceptibility to climate change. Science, 301(5629): 65-65. - Vicente, M., Segura, F., Aguado, M., Migliaro, D., Franco, J. and Martinez-Sanchez, J., 2011. Genetic diversity of Astragalus nitidiflorus, a critically endangered endemic of SE Spain, and implications for its conservation. Biochemical Systematics and Ecology, 39: 175-182. - Walker, G. and Metcalf, A., 2008. Genetic Variation in the Endangered Astragalus jaegerianus (Fabaceae, Papilionoideae): A Geographically Restricted Species. Bulletin, Southern California Academy of Sciences, 107(3): 158-177. - Xie, X., Hu, Y., Wang, L., Yang, J., Li, Y. and Peng, M., 2009. Genetic diversity in three morphological types of Astragalus membranaceus (Fisch.) Bge. var. mongholicus (Bge.) Hsiao as revealed by inter simple sequence repeat markers. African Journal of Biotechnology, 8(18): 4490-4494. - Zarre, Sh., Khodaei, Z., Karamali, Z., Niknam, V. and Mirmasoumi, M., 2007. Isolation variation pattern and species concept in Astragalus gossypinus and Astragalus persicus complexes (Fabaceae) in Iran. Biochemical Systematics and Ecology, 35:757-763. - Zhao, W., Zhang, J., Wangi, Y., Chen, T., Yin, Y., Huang, Y., Pan, Y. and Yang, Y., 2006. Analysis of genetic diversity in wild populations of mulberry from western part of Northeast China determined by ISSR Markers. Genetics and Molecular Biology, 17: 196-203. - Zoghlami, A. and Zouaghi, M., 2003. Morphological variation in Astragalus hamosus L. and Coronilla scorpioides L. populations of Tunisia. Euphytica, 134: 137-147. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 459 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 370 |
||