| تعداد نشریات | 284 |
| تعداد نشریات سازمان | 82 |
| تعداد شماره‌ها | 3,063 |
| تعداد مقالات | 34,185 |
| تعداد مشاهده مقاله | 46,818,642 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 77,806,196 |
بررسی تنوع ژنتیکی گیاه دارویی پنج‌انگشت (Vitex agnus-castus L) بر اساس نشانگر مولکولی ISSR | ||
| تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران | ||
| مقاله 2، دوره 27، شماره 2 - شماره پیاپی 54، اسفند 1398، صفحه 179-192 اصل مقاله (1.45 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله علمی - پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ijrfpbgr.2019.125467.1337 | ||
| نویسندگان | ||
| عبدالجبار سعیدیانی1؛ زهرا بقایی فر2؛ محسن فرشادفر* 3؛ پویا پورنقی2؛ هومن شیروانی4 | ||
| 1دانشجوی کارشناسی ارشد رشته زیست‌شناسی، دانشگاه پیام نور ، واحد کرمانشاه | ||
| 2استادیار، گروه زیست‌شناسی، دانشگاه پیام نور، واحد کرمانشاه | ||
| 3دانشیار، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، واحد کرمانشاه (farshadfarmohsen@yahoo.com) | ||
| 4کارشناس ارشد گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، واحد کرمانشاه | ||
| چکیده | ||
| DOR: 98.1000/1735-0891.1398.27.179.54.2.1576.82 گیاه پنج‌انگشت یکی از مهمترین گیاهان دارویی است که نقش مهمی در سلامت زنان دارد. با توجه به تنوع بالا بین نمونه‌های این گیاه، تنوع ژنتیکی تعداد 19 ژنوتیپ با استفاده از 13 آغازگر ISSR بررسی شد. آغازگرهای ISSR درمجموع توانستند 74 باند تولید کنند که از این تعداد، 4 باند یک‌شکل و مابقی چند شکل بودند. میانگین درصد چندشکلی در بین ژنوتیپهای مورد بررسی برابر 95% بود که درصد چندشکلی برای آغازگرهای UBC824 (80%)، IS14 (83%)، UBC851 (83%) و IS11 (89%) و برای سایر آغازگرها برابر با 100% بود. در مجموع بر اساس کلیه شاخص‌ها، مناسب‌ترین آغازگرها برای بررسی تنوع ژنتیکی پنج‌انگشت، آغازگرهای IS16، IS5 و UBC807 معرفی شدند. فاصله ژنتیکی ژنوتیپهای مورد بررسی با استفاده از ضریب دایس از 195/0 تا 593/0 متغیر بود. نتایج حاصل از دندروگرام تجزیه خوشهای به روش UPGMA بر اساس ضرایب فاصله دایس، ژنوتیپها را در 3 گروه قرار داد. ژنوتیپها بر اساس روش تجزیه به مختصات اصلی اول و دوم پراکنش داده شدند که این دیاگرام با نتایج تجزیه خوشهای کاملاً مطابقت داشت. همچنین نتایج حاصل از گروهبندی‌ها، با استفاده از تجزیه واریانس مولکولی تأیید شد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| تنوع ژنتیکی؛ نشانگر ISSR؛ گیاه دارویی؛ Vitex | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Genetic Diversity Evaluation of (i)Vitex agnus -castus based on ISSR Molecular Marker | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Abdul-Jabbar Saedyani1؛ Zahra Baghaee Far2؛ Mohsen Farshadfar3؛ Pouya Pournaghi2؛ hooman shirvani4 | ||
| 1Ms.C., Department of Biology, Payame Noor University, Kermanshah, I.R. Iran. | ||
| 2Assist. Prof., Department of Biology, Payame Noor University, Kermanshah, I.R. Iran. | ||
| 3Assoc. Prof., Department of Agriculture, Payame Noor University, Kermanshah, I.R. Iran. Email: farshadfarmohsen@yahoo.com) | ||
| 4Department of Agriculture, Payame Noor University, Kermanshah, I.R. Iran. | ||
| چکیده [English] | ||
| Chaste tree (Vitex agnus-castus) is one of important medicinal plant that plays a key role in the women health. Due to high variation within the specimens of this plant, genetic diversity between 19 genotypes was investigated using 13 ISSR primers. The ISSR primers were able to produce a total of 74 bands, of which four were single bundle, and the rest were polymorphic. The mean of polymorphism percentage among the genotypes was 95%. The polymorphism rate observed for primers of UBC824 (80%), IS14 (83%), UBC851 (83%) and IS11 (89%) and for other primers were 100%. In total, based on all the indices, the most suitable primers for assessment of genetic diversity of Vitex agnus-castus were IS16, IS5, and UBC807. Genetic distance of the genotypes ranged from 0.195 to 0.593 using Dice coefficient. The results of cluster analysis using UPGMA method based on Dice coefficient, the genotypes classified into three groups. Based on the first and second coordinates, the distribution diagram of the genotypes were in agreement with the results of cluster analysis. The results of grouping was also confirmed the analysis of molecular variance. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Genetic Diversity, ISSR, Medicinal plant, Vitex | ||
| مراجع | ||
|
- Ahmadi, M., S., M., Kaffi, M., Whitecane, F., Melkzadeh Shahareti, S. 2016. Valuation of genetic diversity in several populations of medicinal plant Nowruzak (Salvia leriifolia) using ISSR markers. Iranian Journal of Rangelands and Forests Plant Breeding and Genetic Research 23(1): 1-12. - Altıntas, S., Toklu, F., Kafkas, S., Kilian, B., Brandolini, A. and zkan, H.O. 2008. Estimating Genetic Diversity in Durum and Bread Wheat Cultivars from Turkey Using AFLP and SAMPL Markers. Plant Breeding, 127: 9-14. - Biabani, Kh. 2016, A study on the genetic diversity of thyme populations in the Boyer Ahmad cold region using the ISSR molecular marker and features of appearance, Yasouj University, Iran (In Persiam). - Donald, J. and Brown, N.D., 1994. Vitex agnus castus, Clinical Monograph. Experimental Gerontology. 29 (3-4): 319-321. - Farshadfar, M., Kissimon, T. and Sutka. J. 1995. Genetic distance between Triticum timopheery zhuk, T. araraticum Jakubz, Plant Breeding, 114: 401-405. - Gravand, T. 2012. Investigation of intrinsic and interspecific genetic variation in Iranian pepper masses using ISSR molecular marker, Master's thesis, Plant Breeding, Isfahan University of Technology, Faculty of Agriculture. - Gupta, P.K. 1996. Cytogenetic. Rastogi publication. Shvaji Road. Meerut-250002, India - Hou, Y., Yan, Z. and Wei, Y., 2005. Genetic diversity in barely from west China based on RAPD and ISSR analysis Barely. Genetics Newsletter, 35:9-22. - Kayis, S. A., Hakki, E. E., and Pinarkara, E. 2010. Comparison of effectiveness of ISSR and RAPD markers in genetic characterization of seized marijuana (Cannabis sativa L.) in Turkey. African Journal of Agricultural Research, 5 (21): 2925-2933. - Kumar, M., Mishra, G P., Singh, R., Kumar, J., Naik, P K. and Singh, Sh B., 2009. correspondence of ISSR and RAPD markers for comparative analysis of genetic diversity among different apricot genotypes from cold arid deserts of Trans-Himalayas. physiology and Molecular Biology of Plants, 15(3): 225-236. - Milbourne, D., Meyer, R., Bradshaw, J. E., Baird, E., Bonar, N., Provan, J., Powell, W. and Waugh, R. 1997. Comparison of PCR-based marker systems for the analysis of genetic relationships in cultivated potato. Molecular Breeding, 3: 127–136. - Mohammadi, S A. and Prasanna, B M., 2003. Analysis of genetic diversity in crop plant: Salient statistical tools and considerations. Crop Science, 43: 1235-1248. - Nikkerdar, F., Farshadfar, M., Ebrahimi, M., Shirvani, H., 2015. Evaluation of the efficiency of SCOT molecular marker in assessing the genetic diversity of fennel herb. Journal of Crop Breeding. 24(4): 95-102 - Palmer, E. and Pitman, N. 1972. Tree of Southern Africa, Covering all known indigenous species in the Republic of South Africa, South- West Africa - Peters, J.P. and Martinelli، J.A. 1989. Hierarchical cluster analysis as a tool manages variation in germplasm collection. Theoretical and Applied Genetics 78: 42-48 - Powell, W., Morgante, M., Andre, C., Hanafey, M., Vogel, J., Tingey, S. and Rafalski, A., 1996. The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis. Molecular Breeding, 2: 225-238. - Rahim Malek, M., 2011. Study of genetic relationships of some species of mint using the R_ISSR marker. Journal of Biotechnology in Agriculture. 10(1): 11-17 - Thimmappaiah, W., Santhosh, G., Shobha, D., and Melwyn, GS. 2008. Assessment of genetic diversity in cashew germplasm using RAPD and ISSR markers. Sciatica Horticulture, 118: 1-7. - Torres, AM., Weeden, NF. and Martin, A., 1993. Linkage among isozyme, RFLP and RAPD markers in Vicia faba. Theoretical and Applied Genetics, 85: 935–945. - Zanganeh, K., Fakheri, B., Aruji, F., Afzali Far, A., Makhdoomi, M., A. 2017. Study of genetic diversity of ecotypes of Forniculum Gulgare Mill in Iran using Molecular ISSR. Journal of Biotechnology of Medicinal Plants, 2(4):10-19 - Ziaee, A., Mesgarpour, B., Shabestari, A. 2008. The Caution of Drug Use and Drug Interactions Based on Evidence and Documentation. Publications Taimorzadeh, Tehran, 466 pages. - Sarla, N., Mallikarjuna Swamy, BP., Sudhakar, T., Prasad Babu, A., Kaladhar, K., Surendhar Reddy, C., Ashok Reddy, G., Ramesha, MS., Shobha Rani, N. & Viraktamath .(2009. High yielding rice lines from elite × wild crosses. Directorate of Rice Research, Newsletter, 7(2):15-21. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 690 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 484 |
||