- همه نشریات
- نشریات علمی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویچ کشاورزی
- مجلات ترویجی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- سایر نشریات سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- نشریات علمی انجمن ها
- علوم آب و خاک
- علوم اقتصاد و ترویج کشاورزی
- علوم جنگل, مرتع و آبخیزداری
- علوم دامی و شیلات
- علوم زراعی و باغی
- علوم گیاه‌پزشکی
- علوم مهندسی و مکانیزاسیون کشاورزی
- نشریات با زبان انگلیسی
- نشریات با زبان فارسی
- نشریات دانشگاه آزاد اسلامی
- نشریات علمی
پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 283 |
| تعداد نشریات سازمان | 81 |
| تعداد شماره‌ها | 2,729 |
| تعداد مقالات | 31,077 |
| تعداد مشاهده مقاله | 28,906,914 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 16,323,942 |
New records of fungi from rhizosphere of oak trees for Iran fungal flora | ||
| Rostaniha | ||
| مقاله 3، دوره 21، شماره 1 - شماره پیاپی 59، آذر 2020، صفحه 27-37 اصل مقاله (550.51 K) | ||
| نوع مقاله: Systematics and Biodiversity of Fungi | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/botany.2020.128673.1182 | ||
| نویسندگان | ||
| Amin Alidadi1؛ Mojegan Kowsari2؛ Gholamreza Salehi Jozani3؛ Ebrahim Karimi4؛ Mohammad Javan Nikkhah* 5؛ Saadi Karami1 | ||
| 1MSc Graduate in Plant Pathology, Department of Plant Protection, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran | ||
| 2Assistant Prof. of Microbial Biotechnology Department, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research, Education & Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran | ||
| 3Prof. of Microbial Biotechnology Department, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research, Education & Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran | ||
| 4Instructor of Microbial Biotechnology Department, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research, Education & Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran | ||
| 5Prof. of Mycology and Plant Pathology, Department of Plant Protection, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj 31587-77871, Iran | ||
| چکیده | ||
| The objective of the present study was to isolate and characterize of fungal species from Persian oak trees rhizosphere in Zagros forests, Ilam province (Iran). For this purpose, sampling was performed from different regions of the above-mentioned forests during 2014–15. The serial dilutions of soil suspensions were cultured on Water agar (WA 2%), Potato dextrose agar (PDA), and Malt extract agar (MEA) media. Fungi were purified by transferring single hyphal tips on PDA medium. At the first, the fungal isolates were identified using their morphological features. To confirm the morphological identification and taxonomic position of the isolates, molecular studied and phylogenetic analyses were then carried out using amplification and sequencing of ITS region of ribosomal DNA. Finally, the species Mortierella alpina, Penicillago nodositata,and Trichocladium jilongensis were identified based on morphological characters and molecular studies. These species were described and reported as new records for the mycobiota of Iran. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Morphology؛ Mortierella alpina؛ Penicillago nodositata؛ taxonomy؛ Trichocladium jilongensis | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| معرفی گونه‌های جدید قارچی از ریزوسفر درختان بلوط برای فلور قارچی ایران | ||
| نویسندگان [English] | ||
| امین علیدادی1؛ مژگان کوثری2؛ غلامرضا صالحی جوزانی3؛ ابراهیم کریمی4؛ محمد جوان نیکخواه5؛ سعدی کرمی1 | ||
| 1دانش‌آموخته کارشناسی ارشد بیماری‌شناسی گیاهی، گروه گیاه‌پزشکی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| 2استادیار بخش بیوتکنولوژی میکروبی، پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، ترویج و آموزش کشاورزی، کرج، ایران | ||
| 3استاد بخش بیوتکنولوژی میکروبی، پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، ترویج و آموزش کشاورزی، کرج، ایران | ||
| 4مربی بخش بیوتکنولوژی میکروبی، پژوهشگاه بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، ترویج و آموزش کشاورزی، کرج، ایران | ||
| 5استاد گروه گیاه‌پزشکی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| چکیده [English] | ||
| تحقیق حاضر با هدف جداسازی و شناسایی گونه‌های قارچی موجود در ریزوسفر درختان بلوط در جنگل‌های زاگرس استان ایلام انجام شد. برای این منظور، نمونه‌برداری از خاک ریزوسفر درختان بلوط در مناطق مختلف جنگل‌های زاگرس در استان ایلام طی سال‌های 94-1393 صورت پذیرفت. رقت‌های مختلفی از سوسپانسیون خاک تهیه و روی محیطکشتهای عصاره مالت-آگار (MEA)، سیب‌زمینی-دکستروز-آگار (PDA) و عصاره آب-آگار (WA 2%) پخش گردید. خالص‌سازی جدایه‌ها با استفاده از روش نوک ریسه روی محیط‌کشت غذایی PDA انجام شد. ابتدا جدایه‌ها با استفاده از ویژگی‌های ریخت‌شناختی شناسایی شدند. سپس، به منظور تایید شناسایی ریخت‌شناختی و تعیین جایگاه تاکسونومیکی جدایه‌ها، شناسایی مولکولی و آنالیزهای فیلوژنتیکی با استفاده از ترادف‌های نوکلئوتیدی ناحیه ITS-rDNA صورت پذیرفت. در نهایت، براساس مطالعات ریخت‌شناختی و مولکولی، سه گونه شامل Mortierella alpina،Penicillago nodositataو Trichocladium jilongensis شناسایی شدند که در تحقیق حاضر به عنوان آرایه‌های جدید برای فلور قارچی ایران توصیف می‌شوند. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| تاکسونومی, ریختشناسی, Mortierella alpina, Penicillago nodositata, Trichocladium jilongensis | ||
| مراجع | ||
|
Akilli, S., Ulubaş Serçe, Ç., Katırcıoğlu, Y.Z. & Maden, S. 2013. Does Pythium anandrum contribute to the dieback of sessile oak (Quircus petraea) in Turkey?. Forest Pathology 43: 505–508.
Al-Hatmi, A.M., Hagen, F., Menken, S.B., Meis, J.F. & De Hoog, G.S. 2016. Global molecular epidemiology and genetic diversity of Fusarium, a significant emerging group of human opportunists from 1958 to 2015. Emerging Microbes & Infections 5: 1–11.
Alidadi, A., Javan-Nikkhah, M., Kowsari, M., Karami, S. & Ebrahimi Rastaghi, M. 2018. Some species of fungi associated with declined Persian oak trees in Ilam province with emphasis on new records to mycobiota of Iran. Rostaniha 19(2): 75–91.
Al-Shammari, T.A., Bahkali, A.H., Elgorban, A.M., El-Kahky, M.T. & Al-Sum, B.A. 2013. The use of Trichoderma longibrachiatum and Mortierella alpina against root-knot nematode, Meloidogyne javanica on tomato. Journal of Pure and Applied Algebra Microbiology 7: 199–207.
Balci, Y. & Halmschlager, E. 2003. Phytophthora species in oak ecosystems in Turkey and their association with declining oak trees. Plant Pathology 52: 694–702.
Balci, Y., Long, R.P., Mansfield, M., Balser, D. & MacDonald, W.L. 2010. Involvement of Phytophthora species in white oak (Quercus alba) decline in southern Ohio. Forest Pathology 40: 430–442.
Cabañas, R., Castellá, G., Abarca, M.L., Bragulat, M.R. & Cabañes, F.J. 2009. Thiabendazole resistance and mutations in the β-tubulin gene of Penicillium expansum strains isolated from apples and pears with blue mold decay. FEMS Microbiology Letters 297: 189–195.
Comby, M., Lacoste, S., Baillieul, F., Profizi, C. & Dupont, J. 2016. Spatial and temporal variation of cultivable communities of co-occurring endophytes and pathogens in wheat. Frontiers in Microbiology 7: 403.
Edgington, S., Thompson, E., Moore, D., Hughes, K.A. & Bridge, P. 2014. Investigating the insecticidal potential of Geomyces (Myxotrichaceae: Helotiales) and Mortierella (Mortierellacea: Mortierellales) isolated from Antarctica. Springer Plus 3: 289.
Ehrmann, J. & Ritz, K. 2014. Plant: soil interactions in temperate multi-cropping production systems. Plant and Soil 376: 1–29.
Ellis, M.B. 1976. More Dematiaceous Hyphomycetes. Kew, London: Commonwealth Mycological Institute 507 pp.
Felsenstein, J. 1985. Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap. Evolution 39: 783–791.
Gan, H., Churchill, A.C. & Wickings, K. 2017. Invisible but consequential: root endophytic fungi have variable effects on belowground plant-insect interactions. Ecosphere 8: e01710.
Gray, T.R.G. & Baxby, P. 1968. Chitin decomposition in soil: II. The ecology of chitinoclastic micro-organisms in forest soil. Transactions of the British Mycological Society 51: 293–309.
Guevara-Suarez, M., García, D., Cano-Lira, J.F., Guarro, J. & Gené, J. 2019. Species diversity in Penicillium and Talaromyces from herbivore dung, and the proposal of two new genera of penicillium-like fungi in Aspergillaceae. Fungal Systematics and Evolution 5: 39–75.
Hannula, S.E., De Boer, W. & Van Veen, J.A. 2010. In situ dynamics of soil fungal communities under different genotypes of potato, including a genetically modified cultivar. Soil Biology and Biochemistry 42: 2211–2223.
Houbraken, J., Frisvad, J.C. & Samson, R.A. 2010. Sex in Penicillium series roqueforti. IMA fungus 1: 171–180.
Kirk, J.L., Beaudette, L.A., Hart, M., Moutoglis, P., Klironomos, J.N., Lee, H. & Trevors, J.T. 2004. Methods of studying soil microbial diversity. Journal of Microbiological Methods 58: 169–188.
Kwaśna, H. 2001. Fungi in the rhizosphere of common oak and its stumps and their possible effect on infection by Armillaria. Applied Soil Ecology 17: 215–227.
Kwaśna, H. 2004. Natural shifts in communities of rhizosphere fungi of common oak after felling. Plant and soil 264: 209–218.
Kozdrój, J. & van Elsas, J.D. 2000. Application of polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis for comparison of direct and indirect extraction methods of soil DNA used for microbial community fingerprinting. Biology and Fertility of Soils 31: 372–378.
Linaldeddu, B.T., Scanu, B., Maddau, L. & Franceschini, A. 2014. Diplodia corticola and Phytophthora cinnamomi: the main pathogens involved in holm oak decline on Caprera Island (Italy). Forest Pathology 44: 191–200.
Melo, I.S., Santos, S.N., Rosa, L.H., Parma, M.M., Silva, L.J., Queiroz, S.C. & Pellizari, V.H. 2014. Isolation and biological activities of an endophytic Mortierella alpina strain from the Antarctic moss Schistidium antarctici. Extremophiles 18: 15–23.
Prescott, L.M., Harley, J.P. & Klein, D.A. 2005. The epidemiology of infectious disease. Pp. 821–843. In: Prescott, L.M., Harley, J.P. & Klein, D.A. (eds). Microbiology, 6th edn, McGraw-Hill, New York.
Raaijmakers, J.M., Paulitz, T.C., Steinberg, C., Alabouvette, C. & Moënne-Loccoz, Y. 2009. The rhizosphere: a playground and battlefield for soilborne pathogens and beneficial microorganisms. Plant and Soil: 341–361.
Rapilly, F. 1968. Les techniques de mycologie en pathologie végétale. INR,Paris, 102 pp.
Schoch, C.L., Seifert, K.A., Huhndorf, S., Robert, V., Spouge, J.L., Levesque, C.A., Chen, W. & Fungal Barcoding Consortium. 2012. Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for Fungi. Proceedings of the National Academy of Sciences 109: 6241–6246.
Seifert, K.A. & Gams, W. 2011. The genera of Hyphomycetes-2011 update. Persoonia. Molecular Phylogeny andEvolution of Fungi 27: 119.
Swer, H., Dkhar, M.S. & Kayang, H. 2011. Fungal population and diversity in organically amended agricultural soils of Meghalaya, India. Journal of Organic Systems 6: 3–12.
Valla, G., Capellano, A., Hugueney, R. & Moiroud, A. 1989. Penicillium nodositatum Valla, a new species inducing myconodules on Alnus roots. Plant and Soil 114: 142–146.
Visagie, C.M., Houbraken, J., Frisvad, J.C., Hong, S.B., Klaassen, C.H.W., Perrone, G., Seifert, K.A., Varga, J., Yaguchi, T. & Samson, R.A. 2014. Identification and nomenclature of the genus Penicillium. Studies in Mycology 78: 343–371.
Visagie, C.M., Houbraken, J., Rodriques, C., Pereira, C.S., Dijksterhuis, J., Seifert, K.A., Jacobs, K. & Samson, R.A. 2013. Five new Penicillium species in section Sclerotiora: a tribute to the Dutch Royal family. Persoonia 31: 42.
Vu, D., Groenewald, M., De Vries, M., Gehrmann, T., Stielow, B., Eberhardt, U., Al-Hatmi, A., Groenewald, J.Z., Cardinali, G., Houbraken, J. & Boekhout, T. 2019. Large-scale generation and analysis of filamentous fungal DNA barcodes boosts coverage for kingdom fungi and reveals thresholds for fungal species and higher taxon delimitation. Studies in Mycology 92: 135–154.
Wang, X.W., Yang, F.Y., Meijer, M., Kraak, B., Sun, B.D., Jiang, Y.L., Wu, Y.M., Bai, F.Y., Seifert, K.A., Crous, P.W. & Samson, R.A. 2019. Redefining Humicola sensu stricto and related genera in the Chaetomiaceae. Studies in Mycology 93: 65–153.
Wang, X.W., Houbraken, J., Groenewald, J.Z., Meijer, M., Andersen, B., Nielsen, K.F., Crous, P.W. & Samson, R.A. 2016. Diversity and taxonomy of Chaetomium and chaetomium-like fungi from indoor environments. Studies in Mycology 84: 145–224.
Watanabe, T. 2002. Soil and Seed Fungi and Key to Species, Lewis Publishers, Florida, Boca Raton, 487 pp.
Wu, Y.M. & Zhang, T.Y. 2013. New species of Humicola and Endophragmiella from China. Mycotaxon 121: 147–151. Yadav, D.R., Kim, S.W., Babu, A.G., Adhikari, M., Kim, C., Lee, H.B. & Lee, Y.S. 2014. First report of Mortierella alpina (Mortierellaceae, Zygomycota) isolated from crop field soil in Korea. Mycobiology 42: 401–404.
Zhong, S. & Steffenson, B.J. 2001. Virulence and molecular diversity in Cochliobolus sativus. Phytopathology 91: 469–476. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,181 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 839 |
||
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب