- همه نشریات
- علوم آب و خاک
- علوم اقتصاد و ترویج کشاورزی
- علوم جنگل, مرتع و آبخیزداری
- علوم دامی و شیلات
- علوم زراعی و باغی
- علوم گیاهپزشکی
- علوم مهندسی و مکانیزاسیون کشاورزی
- مجلات ترویجی کشاورزی
- نشریات انجمن ها
- نشریات با زبان انگلیسی
- نشریات با زبان فارسی
- نشریات دانشگاه آزاد اسلامی
- نشریات علمی
- نشریات علمی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویچ کشاورزی
آمار
| تعداد نشریات | 274 |
| تعداد نشریات سازمان | 73 |
| تعداد شماره‌ها | 1,880 |
| تعداد مقالات | 21,608 |
| تعداد مشاهده مقاله | 11,532,576 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 9,273,631 |
Transcriptomic Changes in the Rumen Epithelium in Beef Cattle after Induction of Acidosis | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 15 بهمن 1398 | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2019.125930.1326 | ||
| نویسندگان | ||
Jamal Fayazi  1؛ maryam Gholizadeh2؛ Hakimeh Zali3؛ Yazdan Asgari4
| ||
| 1Department of Animal Sciences, Agricultural and Natural Resources University of khuzestan, Iran | ||
| 2PhD Candidate of Animal Genetics and Breeding, Khuzestan Ramin Agriculture and Natural Resources University, Mollasani, Ahvaz, Iran. | ||
| 3School of Advanced Technologies in Medicine Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran | ||
| 4School of Advanced Technologies in Medicine Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran | ||
| چکیده | ||
| The transition from normal forage to a highly fermentable diet in beef cattle industry to achieve rapid weight gain can induce ruminal acidosis. The molecular host mechanisms occur in acidosis and as a response to acidosis are largely unknown. Therefore, we assayed histology and transcriptome profiling of rumen epithelium in normal and acidosis animals to understand the molecular mechanisms involved in the disease. The rumen epithelial transcriptome from acidosis (n = 3) and control (n = 3) Holstein steers were obtained using RNA-sequencing. The average of clean reads was 70,975,460 ± 984,046 reads in the normal sample and 71,142,189 ± 834,526 reads in the acidosis samples. We identified 1,074 differentially expressed genes between the two groups (p < 0.05), of which 624 were up- regulated and 450 down-regulated in the acidosis samples. Functional analysis indicated most of the up-regulated genes have a function in filament organization, positive regulation of epithelial and muscle fibre concentration, biomineral tissue development, negative regulation of fat cell differential, regulation of ion transmembrane transport, regulation of cell adhesion and butyrate and short-chain fatty acids absorption that are metabolized as an energy source. Functional analysis of the down-regulated genes revealed effects in immune response, positive regulation of T-cell migration, regulation of metabolic processes and localization. Our results furthermore show differential expression of genes involved in the Map Kinase and Toll-like receptor signalling pathways: IL1B, CXCL5, IL36A and IL36B were significantly downregulated in acidosis rumen tissue samples. Our results suggest rapid shifts to rich fermentable carbohydrates diets cause an increase concentration of ruminal volatile fatty acids and tissue damage and significant changes in transcriptome profiles of rumen epithelial. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Transcriptome؛ Ruminal epithelia tissue؛ Acidosis؛ Beef cattle | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| تغییرات ترنسکریپتوم اپیتلیال شکمبه گاو گوشتی پس از القا اسیدوز | ||
| چکیده [English] | ||
| تغییر ناگهانی جیره نرمال به جیره با قابلیت تخمیر بالا به منظور دستیابی افزایش وزن سریع در صنعت گاو گوشتی می‌تواند منجر به اسیدوز شود. مکانیسم‌های مولکولی میزبان که در طی اسیدوز رخ می‌دهد به طور عمده ناشناخته هستند. بنابراین ما بافت و پروفایل ترنسکریپتوم اپیتلویم شکمبه گاو نرمال و اسیدوزی را به منظور درک مکانیزم‌های مولکولی درگیر در این بیماری مورد بررسی قرار دادیم. داده‌های ترنسکریپتوم از بافت شکمبه 3 گوساله نر اسیدوزی و 3 گوساله نر سالم نژاد هلشتاین با استفاده از توالی‌یابی RNA به دست آمد. میانگین خوانش‌های بافت نرمال 984046 ± 70975460 و بافت اسیدوزی 834526 ± 71142189 بود. نتایج ما 1074 ژن با بیان متفاوت بین دو گروه سالم و اسیدوزی را نشان داد (05/0 P <) که 624 ژن در بافت اسیدوزی نسبت به بافت سالم بیش بیان و 450 ژن کم بیان بودند. تجزیه و تحلیل عملکردی ژن‌های با بیان متفاوت نشان داد بیشتر ژن‌های بیش بیان در فرایندهای ساماندهی فیلامنت‌ها، تنظیم مثبت مقادیر فیبر اپی تلیال و عضله، توسعه بافت بیومینال انتقال از طریق غشا، مکانیسم اسیدهای چرب کوتاه زنجیر که به عنوان منبع انرژی متابولیزه می‌شوند، نقش دارند. آنالیز عملکردی ژن‌های کم بیان نشان داد این ژن‌ها در مکانیسم‌های پاسخ ایمنی، تنظیم مثبت مهاجرت سلول T، تنظیم فرآیندهای متابولیک و محلی‌سازی دخیل هستند. نتایج ما علاوه بر این نشان می دهد که بیان ژن های دخیل در مسیرهای سیگنالینگ گیرنده های نقشه کیناز و Toll مانند: IL1B، CXCL5، IL36A و IL36B به طور قابل توجهی در نمونه های بافتاسیدوزی کاهش یافته است. نتایج ما نشان می‌دهد که تغییر سریع در جیره غذایی به سمت جیره با کربوهیدرات قابل تخمیر باعث افزایش غلظت اسیدهای چرب فرار کوتاه زنجیر، آسیب بافت و تغییرات قابل توجهی در ترانسکتوموم اپیتلیال بافت شکمبه می‌شود. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| ترنسکریپتوم, بافت اپیتلیال شکمبه, اسیدوز, گاو گوشتی | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 7 |
||
