| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 2,829 |
| تعداد مقالات | 32,098 |
| تعداد مشاهده مقاله | 40,864,082 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 18,113,700 |
Identification of Non-Tuberculosis Mycobacteria by Line Probe Assay and Determination of Drug Resistance Patterns of Isolates in Iranian Patients | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقاله 7، دوره 74، شماره 4، اسفند 2019، صفحه 375-384 اصل مقاله (318.65 K) | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2019.127144.1372 | ||
| نویسندگان | ||
| Morteza Karami-Zarandi1؛ A. Bahador2؛ S. Gizaw Feysia3؛ J. Kardan-Yamchi2؛ M. Hasan-nejad3؛ H. Vosough4؛ N. Mosavari5؛ M. M. Feizabadi* 2، 6 | ||
| 1Departemant of Microbiology, School of Medicin, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran | ||
| 2Department of Microbiology, School of medicine, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran | ||
| 3Department of infectious Disease, Imam Khomeini Hospital Complex, Tehran University of Medical Sciences | ||
| 4MD Pathologist, Nikan General Hospital, Tehran, Iran | ||
| 5RReference Laboratory for Bovine Tuberculosis, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran | ||
| 6Thoracic Research Center, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran | ||
| چکیده | ||
| The potentially pathogenic Non-Tuberculosis Mycobacteria (NTM) are emerging nowadays which result in pulmonary and non-pulmonary infections in human. This group of bacteria consists of at least 200 different species. While the pulmonary disease is the most common form of NTM infections, NTM can cause diffused infections as well as extrapulmonary infections in every organ, such as bone marrow, skin, eye, and brain. The NTM cause tuberculosis-like infections, therefore, correct identification of these Mycobacteria is necessary to avoid faulty treatment. Different species of NTM isolates were identified from clinical specimens using phenotypic methods and Line Probe Assay. Minimum Inhibitory Concentration for selected antibiotics was obtained by the broth micro-dilution method. Totally, 42 NTM isolates were identified in this study. Moreover, the frequency of NTM between all positive mycobacterium cultures was estimated at 12%. The most common Rapidly Growing Mycobacteria included Mycolicibacterium fortuitum (30.9%), Mycobacterium abscessus (7.1%), and Mycobacterium chelonae (2.3%), whereas Mycobacterium simiae (40.4%), Mycobacterium kansasii (16.6%), and Mycobacterium avium complex (2.3%) were the most recurring among the Slowly Growing Mycobacteria. Amikacin, clarithromycin, and ciprofloxacin were the most effective antibiotics against isolated NTM. The NTM isolates are frequently being separated from Iranian patients, and are mostly resistant to the wide spectrum of antibiotics. Correct identification and determination of antibiotic susceptibility can be helpful in the healing process of the patients who suffer from non-tuberculosis mycobacterial infections. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Drug Resistance Patterns؛ Line Probe Assay؛ Non-Tuberculosis Mycobacteria | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| شناسایی گونههای مایکوباکتریوم غیر سلی با روش Line Probe Assay و تعیین الگوی مقاومت دارویی جدایه‌ها در بیماران ایرانی | ||
| چکیده [English] | ||
| مایکوباکتریومهای غیر سلی بیماریزای بالقوه و در حال گسترش هستند. این باکتریها موجب عفونتهای ریوی و غیر ریوی شبه سل در انسان میشوند. این گروه از باکتری ها شامل بیش از 200 گونه مختلف مایکوباکتریوم میشوند. از این رو تشخیص صحیح عفونت های این گروه از باکتری ها برای اجتناب از شکستهای درمانی الزامی است. در حالی که عفونت های تنفسی شایعترین عفونت ایجاد شده با NTM ها میباشند، این باکتریها سبب عفونت های خارج ریوی در مغز استخوان، خون، چشم و سایر اندام ها میشوند. با استفاده از روشهای فنوتایپی و همچنین روش Line Probe Assay، گونه های مختلف مایکوباکتریومهای غیر سلی از نمونههای مختلف بیماران جداسازی و شناسایی شد. حداقل غلظت مهاری برای آنتی بیوتیکهای انتخاب شده با روش میکروبراث دایلوشن بدست آمد. در کل 42 گونه مایکوباکتریوم غیرسلی شناسایی شدند. نرخ شیوع مایکوباکتریوم های غیر سلی در میان تعداد کل نمونه های مایکوباکتریوم جدا شده از بیماران 12 درصد بود. شایع ترین گونههای تند رشد مایکوباکتریوم شامل مایکوباکتریوم فورچیتوم (30.9%)، مایکوباکتریوم آبسه سوس (7.1%) و مایکوباکتریوم چلونه (2.3%) بودند. در حالیکه در میان گونههای کند رشد، مایکوباکتریوم سیمیه (40.4%)، مایکوباکتریوم کانزاسی (%16.6%) و مایکوباکتریوم آویوم کمپلکس (2.3%) بیشترین فراوانی را داشتند. آمیکاسین، کلاریترومایسین و سیپروفلوکساسین موثرترین آنتی بیوتیک ها علیه گونه های جدا شده بودند. گونه های مایکوباکتریومهای غیر سلی با فراوانی قابل توجهی از بیماران ایرانی جداسازی میشوند و اکثر این گونه ها به بسیاری از آنتی بیوتیک ها مقاوم هستند. شناسایی صحیح این گونه ها و تعیین الگوی حساسیت آنتی بیوتیکی میتواند در امر تشخیص و درمان بیماران ایرانی بسیار کمک کننده باشد. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| مایکوباکتریوم غیرسلی, Line Probe Assay, الگوی مقاومت دارویی | ||
| مراجع | ||
|
Azadi, D., Motallebirad, T., Ghaffari, K., Shojaei, H., 2018. Mycobacteriosis and Tuberculosis: Laboratory Diagnosis. Open Microbiol J 12, 41-58.
Bakula, Z., Modrzejewska, M., Pennings, L., Proboszcz, M., Safianowska, A., Bielecki, J., et al., 2018. Drug Susceptibility Profiling and Genetic Determinants of Drug Resistance in Mycobacterium kansasii. Antimicrob Agents Chemother 62, 01788-17.
Busatto, C., Vianna, J.S., da Silva, L.V., Ramis, I.B., da Silva, P.E.A., 2019. Mycobacterium avium: an overview. Tuberculosis 114, 127-134.
Chavarro-Portillo, B., Soto, C.Y., Guerrero, M.I., 2019. Mycobacterium leprae’s evolution and environmental adaptation. Acta Tropica 197, 105041.
CLSI, 2011. Susceptibility testing of mycobacteria, Nocardiae, and other aerobic actinomycetes, M24-A2. Wayne, PA: Clinica and Laboratory Standards Institute.
Collins, L.F., Clement, M.E., Stout, J.E., 2017. Incidence, Long-Term Outcomes, and Healthcare Utilization of Patients With Human Immunodeficiency Virus/Acquired Immune Deficiency Syndrome and Disseminated Mycobacterium avium Complex From 1992–2015. Open Forum Infect Dis 4.
Cowman, S., Burns, K., Benson, S., Wilson, R., Loebinger, M.R., 2016. The antimicrobial susceptibility of non-tuberculous mycobacteria. Jo Infect 72, 324-331.
Cowman, S.A., James, P., Wilson, R., Cookson, W.O.C., Moffatt, M.F., Loebinger, M.R., 2018. Profiling mycobacterial communities in pulmonary nontuberculous mycobacterial disease. PLoS One 13, e0208018.
Fedrizzi, T., Meehan, C.J., Grottola, A., Giacobazzi, E., Fregni Serpini, G., Tagliazucchi, S., et al., 2017. Genomic characterization of Nontuberculous Mycobacteria. Sci Rep 7, 45258.
Heidarieh, P., Mirsaeidi, M., Hashemzadeh, M., Feizabadi, M.M., Bostanabad, S.Z., Nobar, M.G., et al., 2016. In Vitro Antimicrobial Susceptibility of Nontuberculous Mycobacteria in Iran. Microb Drug Resist 22, 172-178.
Khosravi, A.D., Mirsaeidi, M., Farahani, A., Tabandeh, M.R., Mohajeri, P., Shoja, S., et al., 2018. Prevalence of nontuberculous mycobacteria and high efficacy of d-cycloserine and its synergistic effect with clarithromycin against Mycobacterium fortuitum and Mycobacterium abscessus. Infect Drug Resist 11, 2521-2532.
Mahon, C.R., Lehman, D.C., Manuselis, G., 2011. Text book of diagnostic microbiology, Suenders Elsevier, Missouri.
Mäkinen, J., Marttila, H.J., Marjamäki, M., Viljanen, M.K., Soini, H., 2006. Comparison of Two Commercially Available DNA Line Probe Assays for Detection of Multidrug-Resistant Mycobacterium tuberculosis. J Clin Microbiol 44, 350-352.
Moghim, S., Sarikhani, E., Nasr Esfahani, B., Faghri, J., 2012. Identification of Nontuberculous Mycobacteria Species Isolated from Water Samples Using Phenotypic and Molecular Methods and Determination of their Antibiotic Resistance Patterns by E- Test Method, in Isfahan, Iran. Iran J Basic Med Sci 15, 1076-1082.
Nasiri, M.J., Dabiri, H., Fooladi, A.A.I., Amini, S., Hamzehloo, G., Feizabadi, M.M., 2018. High rates of nontuberculous mycobacteria isolation from patients with presumptive tuberculosis in Iran. New Microbes New Infect 21, 12-17.
Schiff, H.F., Jones, S., Achaiah, A., Pereira, A., Stait, G., Green, B., 2019. Clinical relevance of non-tuberculous mycobacteria isolated from respiratory specimens: seven year experience in a UK hospital. Sci Rep 9, 1730.
Shafipour, M., Ghane, M., Rahimi, S., Livani, S., Javid, N., Shakeri, F., et al., 2013. Non tuberculosis Mycobacteria isolated from tuberculosis patients in Golestan province, North of IRAN. Ann Biol Res 4, 133-137.
Shahraki, A.H., Heidarieh, P., Bostanabad, S.Z., Khosravi, A.D., Hashemzadeh, M., Khandan, S., et al., 2015. “Multidrug-resistant tuberculosis” may be nontuberculous mycobacteria. Eur J Intern Med 26, 279-284.
Spaulding, A.B., Lai, Y.L., Zelazny, A.M., Olivier, K.N., Kadri, S.S., Prevots, D.R., et al., 2017. Geographic Distribution of Nontuberculous Mycobacterial Species Identified among Clinical Isolates in the United States, 2009–2013. Ann Am Thorac Soc 14, 1655-1661.
Swenson, C., Zerbe, C.S., Fennelly, K., 2018. Host Variability in NTM Disease: Implications for Research Needs. Fron Microbiol 9, 2901.
van Ingen, J., van der Laan, T., Dekhuijzen, R., Boeree, M., van Soolingen, D., 2010. In vitro drug susceptibility of 2275 clinical non-tuberculous Mycobacterium isolates of 49 species in The Netherlands. Int J Antimicrob Agents 35, 169-173.
Velayati, A.A., Farnia, P., Mozafari, M., Malekshahian, D., Seif, S., Rahideh, S., et al., 2014. Molecular epidemiology of nontuberculous mycobacteria isolates from clinical and environmental sources of a metropolitan city. PLoS One 9, e114428.
Waak, M.B., LaPara, T.M., Hallé, C., Hozalski, R.M., 2019. Nontuberculous Mycobacteria in Two Drinking Water Distribution Systems and the Role of Residual Disinfection. Environ Sci Technol 53, 8563-8573.
Welch, K., Morse, A., 2002. The clinical profile of end-stage AIDS in the era of highly active antiretroviral therapy. AIDS Patient Care STDS 16, 75-81.
WHO, 2018. Global tuberculosis report 2018. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 14,865 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,204 |
||