| تعداد نشریات | 285 |
| تعداد نشریات سازمان | 83 |
| تعداد شمارهها | 3,110 |
| تعداد مقالات | 34,666 |
| تعداد مشاهده مقاله | 49,825,878 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 80,171,316 |
بررسی خصوصیات مورفولوژیکی و روابط ژنتیکی بین دو جمعیت از گونه Ferula pseudalliacea در استان یزد | ||
| تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران | ||
| مقاله 7، دوره 26، شماره 2 - شماره پیاپی 52، دی 1397، صفحه 221-232 اصل مقاله (255.85 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله علمی - پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ijrfpbgr.2018.117961 | ||
| نویسندگان | ||
| سمیرا حسین جعفری* 1؛ عادل سپهری2؛ حسن سلطانلو3؛ علی اکبر کریمیان4 | ||
| 1نویسنده مسئول، دانشجوی دکتری، علوم مرتع، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان پست الکترونیک: Samirahosseinjafari@yahoo.com | ||
| 2استاد، گروه مدیریت مرتع، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان | ||
| 3دانشیار، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده تولید گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان | ||
| 4دانشیار، گروه مرتع و آبخیزداری، دانشکده منابع طبیعی و کویرشناسی، دانشگاه یزد، یزد | ||
| چکیده | ||
| DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.221.52.26.1576.32 گونهFerula pseudalliacea (آنغوزه تلخ) گیاهی مرتعی است که شیرابه آن دارای خواص دارویی فراوان میباشد. این پژوهش اولین مطالعه در ایران بهمنظور بررسی روابط ژنتیکی این گونه در رویشگاههایش در استان یزد با استفاده از برخی صفات مورفولوژیک و نشانگرهای مولکولی ISSR انجام شد. از میان 9 صفت تنها صفات تاجپوشش، قطر یقه و وزن هزاردانه دارای اختلاف معنیداری بین دو رویشگاه بود. تجزیه خوشهای صفات مورفولوژیک براساس روش Ward گیاهان را در 3 گروه اصلی قرار داد. از میان 22 آغازگر مورد مطالعه، 8 آغازگر DNA الگو را بهخوبی تکثیر و در مجموع 224 نوار قابل امتیازدهی ایجاد کردند. براساس تعداد باند، PIC و شاخص نشانگر، پرایمرهای ISSR-16 و ISSR-55 عملکرد بهتری داشتند. تجزیه خوشهای با استفاده از ضریب تشابه جاکارد و الگوریتم UPGMA، دو جمعیت مورد مطالعه را در 10 خوشه گروهبندی کرد. در تجزیه به مختصات اصلی 94/57% از واریانس کل توسط سه مؤلفه بیان شد و جمعیتها را بهطور کامل از یکدیگر جدا کرد. نتایج این آنالیز با تجزیه خوشهای همخوانی داشت. این گروهبندیها با محدوده پراکندگی جغرافیایی نمونهها تاحدی انطباق داشت. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که تنوع ژنتیکی درون جمعیتها (92%) بیشتر از تنوع بین جمعیتها (8%) بود. تطابق دندروگرامهای مورفولوژیکی و مولکولی نشان داد که تشابه چندانی بین این دو گروهبندی وجود ندارد. نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که استفاده از نشانگر ISSR برای ارزیابی تنوع ژنتیکی بین جمعیتهای این گونه مناسب بود. | ||
| کلیدواژهها | ||
| تنوع ژنتیکی؛ Ferula pseudalliacea؛ صفات مورفولوژیک؛ نشانگر ISSR؛ استان یزد | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Investigating morphological characteristics and genetic relationships between two populations of Ferula pseudalliacea in Yazd Province | ||
| نویسندگان [English] | ||
| S. Hossein Jafari1؛ A. Sepehry2؛ H. Soltanloo3؛ A. A. Karimian4 | ||
| 1Corresponding author, PhD Student, Rangeland Science, Department of Natural Resources, Agricultural Science and Natural Resources University of Gorgan, Gorgan, I.R. Iran. Email: Samirahosseinjafari@yahoo.com | ||
| 2Prof., Department of Range Management, Faculty of Natural Resources, Agricultural Science and Natural Resources University of Gorgan, Gorgan, I.R. Iran. | ||
| 3Associ. Prof., Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Plant Production, Agricultural Science and Natural Resources University of Gorgan, Gorgan, I.R. Iran. | ||
| 4Associ. Prof., Department of Range and Water Management, Faculty of Natural Resources and Desert Study, Yazd University, Yazd, I. R. Iran. | ||
| چکیده [English] | ||
| DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.221.52.26.1576.32 Ferula pseudalliacea (bitter assafoetida) is a rangeland plant which its gum has a lot of medicinal properties. Since there is no report about evaluating genetic diversity of the valuable species in Iran, this is the first study to investigate genetic diversity of the species in its habitats in Yazd province using several morphological traits and ISSR markers. Among 9 traits, there was significant differences between habitats in terms of canopy cover, stem diameter and weight of 1000 seed. Cluster analysis by morphological traits on the basis of Ward's method classified the samples into three main groups. Among 22 primers, 8 primers reproduced the pattern DNA well and revealed 224 sharp bands. ISSR-16 and ISSR-55 primers had better performance according to the number of bands, PIC and Marker Index. Cluster analysis using Jacquard's coefficient and UPGMA method, grouped two populations into 10 clusters. Principal coordinates analysis showed three components explained 57.94 percent of total variance and separated the populations from each other. These grouping matched relatively with the geographical regions. AMOVA showed that within group genetic diversity (92%) was more than between group diversity (8%). Comparing morphological and molecular dendrograms revealed that there was no similarity between them. The results showed that ISSR marker was suitable to investigate genetic diversity among the studied populations of the species. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| Ferula pseudallicea, Genetic diversity, ISSR marker, morphological traits, Yazd province | ||
| مراجع | ||
|
- Ahmadi, M., Modarres-Sanavy, S.A.M., Kafi, M., Sefidkon, F. and Malekzadeh Shaaroudi, S., 2015. Evaluation of genetic diversity in several populations of medicinal plant Nowruzak (Salvia leriifolia) using ISSR markers. Iranian Journal of Rangelands and Forests Plant Breeding and Genetic Research, 23 (1): 1-12. - Akbarian, A., Rahimmalek, M. and Sabzalian, M.R., 2017. Variation in fruit morphological traits and bioactive compounds in different populations of Ferula assa-foetida, F. gummosa and F. ovina Collected from Iran. Journal of Agricultural Science and Technology, 19: 425-438. - Amiri, M.S. and Joharchi, M.R., 2016. Ethnobotanical knowledge of Apiaceae family in Iran: a review. Avicenna Journal of Phytomedicine, 6 (6): 621-635. - Araujo, F.S., Pacheco, M.V., Vieira, F.A., Ferrari, C.S., Felix, F.C. and Chagas, K.P.T., 2016. ISSR molecular markers for the study of the genetic diversity of Mimosa caesalpiniaefolia Benth. Indesia (Chile) Volumen, 34 (3): 47-52. - Ashraf, J., Malik, W., Iqbal, M.Z., Ali Khan, A., Qayyum, A., Noor, E., Abid, M.A., Naseer Cheema, H.M. and Ahmad, M.Q., 2016. Comparative Analysis of Genetic Diversity among Bt Cotton Genotypes using EST-SSR, ISSR and Morphological Markers. Journal of Agricultural Science and Technology, 18: 517-531. - Baldemir, A., Topcu, H., Paksoy, M.Y., Motalebipour, E.Z. and Kafkas, S., 2017. First microsatellite markers for Scaligeria lazica Boiss. (Apiaceae) by next generation sequencing: population structure and genetic diversity analysis. Biotechnology and Biotechnological Equipment, 1-10. - Baranski, R., Barsnska, M., Schulz, H., Simon, P.W. and Nothnagel, T., 2006. Single Seed Raman Measurements Allow Taxonomical Discrimination of Apiaceae Accessions Collected in Gene Bank. Biopolymers, 81: 497-505. - Barrandeguy, M.E. and Garcia, M.V., 2014. Quantifying genetic diversity: the starting point for population genetic studies using molecular markers. Journal of Genetics, 93 (2): 587-589. - Brito, F.A., Nizio, D.A.C., Silva, A.V.C., Diniz, L.E.C., Rabbani, A.R.C., Arrigoni-Blank, M.F., Alvares-Carvalho, S.V., Figueira, G.M., Montanari Junior, I. and Blank, A.F., 2016. Genetic diversity analysis of Varronia curassavica Jacq. Accessions using ISSR markers. Genetic and Molecular Research, 15 (3): 1-10. - DK, S., Tewari, R., NK, S. and Singh, Sh.S., 2016. Genetic Diversity Cucumber using Inter Simple Sequence Repeats (ISSR). Transcriptomics, 4 (1): 1-4. - Farshadfar, M., Moradzade, N., Farshadfar, E. and Shirvani, H., 2017. Genetic diversity among fennel (Fueniculum vulgare Mill.) accessions using morphological and SCoT markers. Iranian Journal of Rangelands and Forests Plant Breeding and Genetic Research, 25 (2): 212-231. - Haji, K., Naghavi, M.R., Taleii, A.R. and Aghaii, M.J., 2011. Evaluation of genetic diversity of Aegilops tauschii from Northern area of Iran using SSR markers. Iranian Journal of Biology, 24: 390-399. - Khederzadeh, S., Samiei, M., Mobaraki, A., Ezeddinloo, L. and Haghi, H.A., 2017. Genetic Comparison of Iranian Asafetida (Ferula assa-foetida L.) Populations Based on cpDNA Ribosomal Protein L16 Intron. International Journal of Agriculture Innovations and Research, 5 (4): 577-583. - Khoonani, Z., Naghavi, M.R., OMidi, M., Sabokdast, M., Talebi Kooyakhi, E., 2012. Investigating genetic diversity of Ferula gummosa ecotypes in different regions of Iran using AFLP Marker. Journal of Medicinal Plants, 38 (2): 117-126. - Legave, J.M., Segura, V., Fournier, D. and Costes, E., 2006. The effect of genotype, location and their interaction on early growth and branching in apricot trees. Journal of Horticultural Science and Biotechnology, 81 (2): 189-198. - Messmer, M.M., Melchinger, A.A., Boppenmair, J., Hermann, R.G. and Brunklaus-Jung, E., 1992. AFLP analysis of genetic relationships in the tribe Datureae (solanaceae). Theoretical and Applied Genetic, 99: 634-41. - Mohseni, Z., Bernousi, I., Mandoulakani, B.A. and Darvishzadeh, R., 2015. Genetic Diversity in Papaver Bracteatum and Papaver Somniferum Populations Revealed by ISSR Markers. Bulgarian Journal of Agricultural Science, 21 (3): 485-493. - Nagy, S., Poczai, P., Cernak, I., Mousapour Gorji, A., Hegedus, G. and Taller, J., 2012. PICcalc: an online program to calculate polymorphic information content for molecular genetic studies. Biochemical Genetics, 50: 670-672. - Nei, M., 1978. Estimation of average heterozigosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics, 89: 583-590. - Ng, W.L. and Tan, S.G., 2015. Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) Markers: Are We Doing It Right?. ASM Science Journal, 9 (1): 30-39. - Modareskia, M., Darvishzadeh, R., Hassani, A. and Kholghi, M., 2012. Molecular diversity within and between Ajowan (Carum copticum L.) populations based on inter simple sequence repeat (ISSR) markers. Journal of Plant Molecular Breeding, 1 (1): 51-62. - Parashar, M., Jakhar, M.L. and Malik, C.P., 2014. A Review on Biotechnology, Genetic Diversity in Cumin (Cuminum cyminum). International Journal of Life Science and Pharma Research, 4 (4): 17-34. - Pirmoradi, M.R., 2012. Morphological, physiological, phytochemical and genetical evaluation of Asafoetida in Kerman province. Ph.D. thesis, Department of Horticultural Science, Tarbiat Modares University. - Salami, M., Rahimmalek, M. and Ehtemam, M.H., 2017. Genetic variability of outcross and selfed fennel based on morphological and ISSR markers. Journal of Agricultural Science and Technology, 19: 157-172. - Semagn, K., 2002. Genetic relationships among 10 endod types as revealed by a combination of morphological, RAPD and AFLP markers. Hereditas, 137: 149-156. - Smith, W.B., Frye, Ch.T., Veliz, E., Hiebler, Sh., Taylor, R.C. and Hunter, K.L., 2015. Genetic variability of Maryland and West Virginia population of the federally endangered plant Harperella nodosa (Rose) (Apiaceae). Northeastern Naturalist, 22 (1): 106-119. - Stevens, M.I., Clarke, A.C., Clarkson, F.M., Goshorn, M. and Gemmill, Ch.E.C., 2015. Are current ecological restoration practices capturing natural levels of genetic diversity? A New Zealand case study using AFLP and ISSR data from mahoe (Melicytus ramiflorus). New Zealand Journal of Ecology, 39 (2): 190-197. - Torabi-Giglou, M., Panahandeh, J., Mohammadi, S.A., Zaree Nahandi, F., Motallebi Azar, A. and Sliwka, J., 2015. DNA and morphological diversity and relationship analysis of selected cultivated, wild potatoes and some promising hybrids. Journal of Biodiversity and Environmental Sciences (JBES), 6 (2): 175-186. - Zhang, H.Y., Tian, K., Yu, Y., Li, L.Y. and Yang, Y.M., 2009. Genetic diversity among natural populations of Ottelia acuminate (Gaghep.) Dandy revealed by ISSR. African Journal of Biotechnology, 8 (22): 6089-6093. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 714 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 554 |
||