| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 2,873 |
| تعداد مقالات | 32,558 |
| تعداد مشاهده مقاله | 42,482,693 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 19,247,730 |
بررسی تنوع ژنتیکی جمعیتهای مختلف سماق (Rhus coriaria L.) ایرانی با استفاده از نشانگر ISSR | ||
| تحقیقات ژنتیک و اصلاح گیاهان مرتعی و جنگلی ایران | ||
| مقاله 5، دوره 26، شماره 2 - شماره پیاپی 52، دی 1397، صفحه 196-206 اصل مقاله (313.31 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله علمی - پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ijrfpbgr.2018.117959 | ||
| نویسندگان | ||
| رسول محمدی آلاگوز1؛ رضا درویش زاده* 2؛ احمد علیجانپور3؛ حمید حاتمی ملکی4؛ رویا حیدری5 | ||
| 1دانش‌آموخته کارشناسی ارشد، بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه | ||
| 2نویسنده مسئول مکاتبات، استاد، گروه اصلاح و بیوتکنولوژی گیاهی دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه پست الکترونیک: r.darvishzadeh@urmia.ac.ir | ||
| 3دانشیار، گروه جنگل‌داری، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه ارومیه | ||
| 4استادیار، گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه مراغه | ||
| 5دانش‌آموخته کارشناسی ارشد، بیوتکنولوژی کشاورزی، پژوهشکده زیست‌فناوری، دانشگاه ارومیه | ||
| چکیده | ||
| DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.196.52.26.1576.82 سماق (Rhus coriaria L.) ازجمله درختچههای جنگلی است که در مناطق مدیترانه و آسیای شرقی بهویژه ایران پراکنش دارد و دارای کاربردهای مختلف دارویی و صنعتی میباشد. در این پژوهش، از نشانگرهای بین ریزماهواره بهمنظور مطالعه تنوع ژنتیکی ژنوتیپهای سماق جمعآوری شده از پنج رویشگاه طبیعی واقع در شمالغرب کشور (استانهای آذربایجان‌غربی و شرقی) استفاده شد. بدینمنظور از هر جمعیت 15 نمونه بهصورت تصادفی انتخاب و بعدDNA ژنومی آنها با استفاده از 18 آغازگر ISSR انگشتنگاری شد. نتایج نشان داد که تنوع ژنتیکی مطلوبی در میان ژنوتیپهای مورد مطالعه سماق وجود دارد، به‌طوری‌که سهم تنوع ژنتیکی بین جمعیتی (8/79%) بیشتر از سهم تنوع ژنتیکی داخل جمعیتی (2/20) بود. کمترین فاصله ژنتیکی (18/14) بین جمعیتهای آغبراز- هوراند (آ.ش.) و نیر- ارسباران و بیشترین فاصله ژنتیکی (08/31) بین جمعیتهای کچله- ارومیه و نیر- ارسبارن مشاهده شد. بر اساس نتایج حاصل از گروهبندی ژنوتیپهای مورد مطالعه، دو جمعیت آغبراز- هوراند و نیر- ارسباران در یک گروه و جمعیتهای رویشگاههای دیگر در گروههای مجزایی قرار گرفتند. نتایج این مطالعه نشان داد که گروهبندی افراد با استفاده از نشانگر ISSR، با توزیع جغرافیایی آنها مطابقت دارد. نشانگرهای ISSR میتوانند بهصورت مؤثری نه تنها در ارزیابی تنوع ژنتیکی ژرم‌پلاسم سماق بلکه در شناسایی ارتباط ژنتیکی میان نمونهها یا افراد شناخته شده و یا ناشناخته سماق بهکار روند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| تنوع ژنتیکی؛ تجزیه واریانس مولکولی؛ سماق؛ نشانگر مولکولی ISSR | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Genetic diversity of several Iranian sumac (Rhus coriaria) populations using genomic inter-microsatellites markers | ||
| نویسندگان [English] | ||
| R. Mohammadi Alaghoz1؛ R. Darvish zadeh2؛ A. Alijanpour3؛ H. Hatami Maleki4؛ R. Heidari5 | ||
| 1M.Sc., Plant Breeding, Department of Plant Breeding and Biotechnology, Urmia University, Urmia, I. R. Iran. | ||
| 2Corresponding author, Prof., Department of Plant Breeding and Biotechnology, Urmia University, Urmia, I.R. Iran. Email: r.darvishzadeh@urmia.ac.ir | ||
| 3Assoc. Prof., Department of Forestry, Faculty of Natural Resources, Urmia University, Urmia, I. R. Iran. | ||
| 4Assist. Prof., Department of Plant Production and Genetics, Faculty of Agriculture, University of Maragheh, Maragheh, I. R. Iran. | ||
| 5M.Sc., Agricultural Biotechnology, Institute of Biotechnology, Urmia University, Urmia, I. R. Iran. | ||
| چکیده [English] | ||
| DOR: 98.1000/1735-0891.1397.2.196.52.26.1576.82 Sumac (Rhus coriaria L.) as a forest shrub has been dispersed in Mediterranean and Eastern Asia specially Iran and has several medicinal and industrial applications. In this research, intermicrosatellites markers were used to study genetic diversity of sumac genotypes collected from five natural habitats located in North West of Iran (West and East Azerbaijan provinces). Fifteen samples were select randomly from each population and genomic DNA was fingerprinted by 18 ISSR markers. Results revealed existence of suitable genetic variation among the studied sumac genotypes and portion of inter population (79.8%) variation were higher than intra population (20.2%) variation. Minimum value of genetic distance (14.18) was observed between Aghberaz-Horand (East Azerbaijan province) and Nir-Arasbaran (East Azerbaijan province) populations and the maximum one (31.08) was observed between Kachelleh-Urmia (West Azerbaijan) and Nir-Arasbaran populations. According to classification of genotypes based on molecular data, Aghberaz-Horand and Nir-Arasbaran populations located in the same group and populations from other habits located in distinguished groups. Classification of genotypes via ISSR markers was in agreement with their geographical distributions. ISSR markers could be effectively applicable in genetic evaluation of sumac germplasm and also in identification of genetic relatedness among known and unknown sumac samples. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Genetic diversity, ISSR molecular markers, molecular analysis of variance, Sumac | ||
| مراجع | ||
|
− Abdi, N. and Maddah-Arefi, H., 2002. Study of variation and seed deterioration of Bromus tomentollus germplasm, in natural resources gene bank. Iranian Journal of Rangelands and Forests Plant Breeding and Genetic Research, 7: 1-25. − Ahmadian Atari, M.M., Amin, G.R., Fazeli, M.R. and Jamalifar, H., 2008. A review on antimicrobial activities of sumac fruit (Rhus coriaria L.). Journal of Medicinal Plants, 25: 1-9. − Avise, J.C., 1994. Molecular Markers, Natural History and Evolution. Chapman and Hall. New York. 528p. − Belletti, P., Monteleone, I. and Ferrazzini, D., 2008. A population genetic study in a scattered forest species, Wild service tree [Sorbus torminalis (L.) crantz], using RAPD markers. European Journal of Forest Research, 127: 103-114. − Bernath, J., 2002. Strategies and recent achievements in selection of medicinal and aromatic plants. Proc. Int. Conf. MAP. Acta Horticulturae, 576, 65– 68. − Ellstrand, N.C. and Elam, D.R., 1993. Population genetic consequences of small population size: implications for plant conservation. Annual Reviews of Ecological Systems, 24: 217–242. − Fabriki Ourang, S., Shamsbakhsh, M., Jalali Javaran, M. and Ahmadi, J., 2009. Assessment of genetic diversity of native populations of Iranian melon (Cucumis melo L.) using inter simple sequence repeats (ISSR) markers. Journal of Iranian Biology, 22: 271-278. − Fritsch, P. and Rieseberg, L.H., 1996. The use of random amplified polymorphic DNA (RAPD) in conservation genetics. In: T.B. Smith and R.K. Wayne, Editors, Molecular Genetic Approaches in Conservation, Oxford University Press. New York. USA. pp. 54-73. − Ghouth, K., Malekzadeh Shafaroodi, S., Rashed Mohassel, M.H., Akbari, M.R. and Razavi, S.H., 2014. Grouping jujubes of Iran based on quantitative characteristics and ISSR and RAPD Markers. Seed and Plant Improvement Journal, 30: 173-190. − Gonzalez-Astorga, J. and Castillo-Campos, G., 2004. Genetic variability of the narrow endemic tree Antirhea aromatica Castilo-Campos and Lorence, (Rubiaceae, Guettardeae) in a tropical forest of Mexico. Annals of Botany, 93: 521–528. − Hamrick, J.L. and Godt, M.J.W., 1996. Conservation genetics of endemic plant species. In: Avise, J.C., Hamrick, J. L. (Eds.), Conservation Genetics: Case Histories from Nature. Chapman and Hall, New York. − Hamrick, J.L., Linhart, Y.B. and Mitton, J.B., 1979. Relationships between life history characteristics and electrophoretically detectable genetic variance in plants. Annual Reviews of Ecological Systems, 10:173–200. − Hao, B., Li, W., Linchun, M., Li, Y., Rui, Z., Mingxia, T. and Weikai, B., 2006. A study of conservation genetics in Cupressus chengiana an endangered endemic of China, using ISSR markers. Biochemical Genetics, 44: 29-43. − Hartl, D.L. and Clark, G.C., 1994. Principles of Population Genetics. Sinauer, Sunderland. − Huang, Y., Ji, K., Jiang, Z. and Tang, G., 2008. Genetic structure of Buxus sinica var. parvifolia, a rare and endangered plant. Scientia Horticulturae, 116: 324-329. − Koohi Dehkordi, M.A., Rahim Malek, M., Seyyed Tabtabei, B.A., Bani Nasab, B. and Mobli, M., 2006. Assessment of genetic relationship of some Iranian and exotic olive cultivars using molecular markers. Journal of Horticultural Science and Technology, 7: 93-102. − Lu, Z., Wang, Y., Peng, Y., Korpelainen, H. and Li, C., 2006. Genetic diversity of Populus cathayana Rehd populations in southwestern China revealed by ISSR markers. Plant Science, 170: 407-412. − Nei, M., 1978. Estimation of average heterozygosity and genetic distance from a small number of individuals. Genetics, 89: 583-590. − Rawashdeh I.M., 2011. Genetic variability in a medicinal plant Artemisia judaica using random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. International Journal of Agriculture and Biology, 13: 279-282. − Rawashdeh I.M., Ghzawi A.L., Rawasgdeh, N.Q., Kheirallh, K., Al-Tawaha, A.R. and Salama, B., 2009. Genetic variation among sumac (Rhus Coriaria L.) samples collected from three locations in Jordan as revealed by AFLP markers. Advances in Environmental Biology, 3: 107-112. − Reddy, P.M., Sarla, N. and Siddiq, E.A., 2002. Inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism and its application in plant breeding. Euphytica, 128: 9–17. − Reed, D.H. and Frankham, R., 2003. Correlation between fitness and genetic diversity. Conservational Biology, 17: 230-237. − Rout, A. and Chrungoo, N.K., 2007. Genetic variation and species relationships in Himalayan buck wheats as revealed by SDS PAGE of endosperm proteins extracted from single seeds and RAPD based DNA fingerprints. Genetic Resources and Crop Evolution, 54: 767–777. − Shabanian, N., Havasi, A. and Mehrabi, A.A., 2016. Genetic differentiation in Persian oak (Quercus brantii) populations using genomic inter-microsatellite markers. Iranian Journal of Rangelands and Forests Plant Breeding and Genetic Research, 24: 66-78. − Tamura, K., Peterson, D., Peterson, N., Stecher, G., Nei, M. and Kumar, M., 2011. MEGA5: Molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods. Molecular Biology and Evolution, 28(10): 2731-2739. − Yeh, F.C., Yang, R. and Boyle, T., 1999. POPGENE Version 1.31. Microsoft windows based freeware for population genetic analysis. University of Alberta. Edmonton. AB. Canada. pp. 26. − Zietkiewicz, E., Rafalski, A. and Labuda, D., 1994. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR) - anchored polymerase chain reaction amplification. Genomics, 20: 176-183. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 481 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 417 |
||