| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 2,873 |
| تعداد مقالات | 32,555 |
| تعداد مشاهده مقاله | 42,418,913 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 19,194,539 |
A taxonomic study of cyanobacteria in wheat fields adjacent to industrial areas in Yazd province (Iran) | ||
| Rostaniha | ||
| مقاله 1، دوره 18، شماره 2 - شماره پیاپی 54، اسفند 2017، صفحه 107-121 اصل مقاله (589.86 K) | ||
| نوع مقاله: Research Paper | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/botany.2018.115930 | ||
| نویسندگان | ||
| Maryam Ahlesaadat1؛ Hossein Riahi* 2؛ Zeinab Shariatmadari3؛ Mohammad Hossein Hakimi Meybodi4 | ||
| 1MSc Student, Faculty of Life Sciences and Biotechnology, Shahid Beheshti University, G.C. Tehran, Iran | ||
| 2Prof., Faculty of Life Sciences and Biotechnology, Shahid Beheshti University, G.C. Tehran, Iran | ||
| 3Assistant Prof., Faculty of Life Sciences and Biotechnology, Shahid Beheshti University, G.C. Tehran, Iran | ||
| 4Assistant Prof., Faculty of Natural Resource, Yazd University, Yazd, Iran | ||
| چکیده | ||
| Culturing, isolation, purification, and identification of cyanobacteria collected from wheat field soil, in five stations around the industrial areas in Yazd province (Iran) were conducted in this study. Identification of taxa was based on morphology and molecular methods. Cluster analysis and principal component analyses performed using SPSS software and rate of resemblance among the taxa were investigated. The phylogenetic analyses carried out according to 16S rRNA gene sequences data, and the phylogenetic relationships were assessed by Maximum Parsimony, Maximum Likelihood and Bayesian Inference. The results of this study indicated presence of 32 species included in four orders of cyanobacteria. Among these orders, Oscillatoriales with three families, eight genera and 13 species showed the highest species diversity, whereas Chroococcales with two families, three genera and four species, exhibited the lowest diversity. Among isolated taxa, Oscillatoria ornata, O. engelmanniana, Jaaginema pallidum, Pseudanabaena minima,Stenomitos frigidus, Nostoc edaphicum, and Gloeothece tepidariorum, are reported as new records for algal flora in Iran. Distributions and descriptions of the new taxa were also presented. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| cyanobacteria؛ Heavy metals؛ morphological diversity؛ new record؛ phylogenetic analyses؛ 16S rRNA | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| مطالعه تاکسونومیک سیانوباکتری‌های مزارع گندم مجاور مناطق صنعتی استان یزد | ||
| نویسندگان [English] | ||
| مریم اهل سعادت1؛ حسین ریاحی2؛ زینب شریعتمداری3؛ ﻣﺤﻤﺪ ﺣﺴﯿﻦ ﺣﮑﯿﻤﯽ ﻣﯿﺒﺪی4 | ||
| 1کارشناسی ارشد داﻧﺸﮑﺪه ﻋﻠﻮم و فناوری زﯾﺴﺘﯽ، دانشگاه شهید بهشتی، تهران | ||
| 2استاد داﻧﺸﮑﺪه ﻋﻠﻮم و فناوری زیستی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران | ||
| 3استادیار داﻧﺸﮑﺪه ﻋﻠﻮم و فناوری زﯾﺴﺘﯽ، دانشگاه شهید بهشتی، تهران | ||
| 4اﺳﺘﺎدﯾﺎر داﻧﺸﮑﺪه ﻣﻨﺎﺑﻊ ﻃﺒﯿﻌﯽ، داﻧﺸﮕﺎه ﯾﺰد، ﯾﺰد | ||
| چکیده [English] | ||
| در این مطالعه، سیانوباکتری‌های موجود در خاک مزارع گندم در پنج ایستگاه در مجاورت مناطق صنعتی استان یزد پس از طی مراحل کشت و خالص‌سازی مورد شناسایی قرار گرفتند. شناسایی نمونه‌ها براساس ویژگی‌های مورفولوژیک و نیز به روش مولکولی صورت گرفت. همچنین تجزیه خوشه‌ای و تجزیه مولفه‌های اصلی با استفاده از نرم‌افزار SPSS صورت گرفت و قرابت میان آرایه‌ها براساس صفات ریختی بررسی گردید. همچنین آنالیزهای فیلوژنتیک با استفاده از مارکر مولکولی 16S rRNA انجام و روابط فیلوژنتیک آرایه‌ها براساس روش‌های Maximum Parsimony، Maximum Likelihood و Bayesian ارزیابی گردید. حاصل این مطالعه، شناسایی 32 گونه از سیانوباکتری‌ها بود که در چهار راسته مختلف قرار گرفت. راسته Oscillatoriales با سه تیره، هشت جنس و 13 گونه و راسته Chroococcales با دو تیره، سه جنس و چهار گونه به ترتیب از بیشترین و کمترین سطح تنوع برخوردار بودند. همچنین نتایج حاصل از این تحقیق، نشانگر کارآیی نسبی مارکر فیلوژنتیک (سکانس ژنی 16S rRNA) به کارگرفته شده و نیز کارایی مطالعات تاکسونومی عددی (آنالیز تجزیه خوشه‌ای) در جداسازی آرایه‌های مورد مطالعه بود. ارزیابی چگونگی پراکنش گونه‌های شناسایی شده در ایستگاه‌های مطالعاتی و ارایه شرح آرایه‌های جدید برای فلور جلبکی ایران از دیگر یافته‌های این مطالعه است. از میان آرایه‌های شناسایی شده، هفت گونه به اسامیO. ornata, Oscillatoria engelmanniana, Jaaginema pallidum, Pseudanabaena minima, Nostoc edaphicum, Gloeothece tepidariorum و Stenomitos frigidus برای نخستین بار از ایران گزارش می‌شوند. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| آنالیز فیلوژنتیک, تنوع مورفولوژیکی, سیانوباکتری, فلزات سنگین, گونه جدید, 16S rRNA | ||
| مراجع | ||
|
Allaway, B.J. 1990. Heavy metals in soils, Blackie and Son Ltd. Glasgow, London, pp. 177–196. Bhatnagar, S. & Kumari, R. 2013. Bioremediation: A sustainable tool for environmental management, a review. Annual Review & Research in Biology 3(4): 974–993. Compere, P. 1981. Algues des deserts d'Iran. Bulletin du Jardin Botanique National de Belgique 51: 3–40. Desikachary, T.V. 1959. Cyanophyta. Indian Council of Agricultural Research, New Delhi, 686 pp. Ehrenberg, C.G. 1854. Mikrogeologie, Texte. E. Kummer, Leipzig. Pp. 111–116. Hašler, P., Dvořák, P., Johansen, J.R., Kitner, M., Ondřej, V. & Poulíčková, A. 2012. Morphological and molecular study of epipelic filamentous genera Phormidium, Microcoleus and Geitlerinema (Oscillatoriales, Cyanophyta / Cyanobacteria). Fottea 12(2): 341–356. Heidari, F., Riahi, H., Yousefzadi, M. & Shariatmadari, Z. 2013. Morphological and phylogenetic diversity of cyanobacteria in four hot springs of Iran. The Iranian Journal of Botany 19(2): 162–172. Hoffmann, L. 1989. Algae of terrestrial habitats. Botany Review 55(2): 77–105. Hokmollahi, F., Riahi, H., Soltani, N., Shariatmadari, Z. & Hakimi, M.H. 2016. A taxonomic study of blue-green algae based on morphological, physiological and molecular characterization in Yazd province terrestrial ecosystems (Iran). The Iranian Journal of Botany 16(2): 152–163. Jafari, E., Shokravi, S. & Soltani, N. 2014. Microchaete goeppertiana Kirchner, a new morphospecies of nostocalean cyanophyta for algal flora of Iran. The Iranian Journal of Botany 20(1): 112–118. Kabata-Pendias, A. & Pendias, H. 1992. Trace elements in soils and plants. 4th Edition, CRC Press, Boca Raton, FL. Kaushik, B.D. 1987. Laboratory methods for blue-green algae, Associated Publishing Company, New Delhi, India. 171 pp. Komárek, J. & Anagnostidis, K. 2005. Cyanoprokaryota 2. Teil/2nd Part: Oscillatoriales. P. 759. Korelusová, J. 2005. Polyfázicky pristup k fylogenezi vybranych sinic [Polyphasic approach to the phylogeny of selected cyanobacteria]. BSc Thesis, Faculty of Biological Sciences, University of South Bohemia. Korelusová, J. 2008. Phylogeny of heterocytous cyanobacteria (Nostocales and Stigonematales), MSc Thesis, Faculty of Science, University of South Bohemia, České Budějovice, Czech Republic. Lamprinou, V., Hernández-Mariné, M., Pachiadaki, M.G., Kormas, K.A., Economou-Amilli, A. & Pantazidou, A. 2013. New findings on the true-branched monotypic genus Iphinoe (Cyanobacteria) from geographically isolated caves (Greece). Fottea 13(1): 15–23. Lopes, V.R., Ramos, V., Martins, A., Sousa, M., Welker, M., Antunes, A. & Vasconcelos, V.M. 2011. Phylogenetic, chemical and morphological diversity of cyanobacteria from Portuguese temperate estuaries. Marine Environmental Research (Elsivier) 1–10. Moghtaderi, A., Taghavi M. & Rezaei, R. 2009. Cyanobacteria in biological soil crust of Chadormalu area, Bafq region in central Iran. Pakistan Journal of Nutrition 8(7): 1083–1092. Nayak, S. & Prasanna, R. 2007. Influence of diverse rice soil ecologies on cyanobacterial diversity and abundance. Wetlands Ecology and Management 15(2): 127–134. Nübel, U., Garcia-pichel, F. & Muyzer, G. 1997. PCR primers to amplify 16rRNA genes from cyanobacterial. Applied and Environmental Microbiology 63: 3327–3332. Palinska, K.A., Deventer, B., Hariri, K. & Lotocka, M. 2011. A taxonomic study on Phormidium-group (cyanobacteria) based on morphology, pigments, RAPD molecular markers and RFLP analysis of the 16S rRNA gene fragment. Fottea 11(1): 41–55. Perkerson, R.B., Johansen, J.R., Kovacik, L., Brand, J., Kastovsky, J. & Casamatta, D.A. 2011. A unique pseudanabaenalean (Cyanobacteria) genus Nodosilinea gen. nov. based on morphological and molecular data. Journal of Phycology 47(6): 1397–1412. Podani, J. 2000. Simulation of random dendrograms and comparison tests: Some comments. Journal of Classification 17(1): 123. Premanandh, J., Priya, P., Prabaharan, D. & Uma, L. 2009. Genetic heterogeneity of the marine cyanobacterium Leptolyngbya valderiana (Pseudanabaenaceae) evidenced by RAPD molecular markers and 16S rDNA sequence data. Journal of Plankton Research 31(10): 1141–1150. Prescott, G.W. 1962. Algae of western great lakes area. W.M.C. Brown Company Publishing, Iowa, USA. P. 933. Rai, L., Tyagi, B., Rai, P.K. & Mallick, N. 1998. Interactive effects of UV-B and heavy metals (Cu and Pb) on nitrogen and phosphorus metabolism of a N2-fixing cyanobacterium Anabaena doliolum. Environmental and Experimental Botany 39(3): 221–231. Rangaswamy, G. 1966. Agricultural Microbiology, Asia Publishing House, Bombay, India. Rindi, F. 2007. Diversity, Distribution and Ecology of Green Algae and Cyanobacteria in Urban Habitats. Algae and Cyanobacteria in Extreme Environments. Springer 11(6): 619–638. Rippka, R., Deruelles, J., Waterbury, J.B., Herdman, M. & Stanier, R.Y. 1979. Generic assignments, strain histories and properties of pure culture of cyanobacteria. Journal of General Microbiology 111: 1–61. Saadatnia, H. & Riahi, H. 2009. Cyanobacteria from paddy fields in Iran as a biofertilizer in rice plants. Plant Soil and Environment 55(5): 207–212. Shamsuddoha, A.S.M., Mulbul, A. & Imamul Hug, S.M. 2006. Accumulation of arsenic in green algae and its subsequent transfer to the soil-plant system. Bangladesh Journal of Microbiology 22(2): 148–151. Shariatmadari, Z., Riahi, H., Seyed Hashtroudi, M., Ghassempour, A.R. & Aghashariatmadary, Z. 2015. Plant growth promoting cyanobacteria and their distribution in terrestrial habitats of Iran. Soil Science and Plant Nutrition 59: 535–547. Shariatmadari, Z., Riahi, H., Seyed Hashtroudi, M., Ghassempour, A.R. & Aghashariatmadary, Z. 2013. Plant growth promoting cyanobacteria and their distribution in terrestrial habitats of Iran. Soil Science and Plant Nutrition 59: 535–547. Shokravi, S. 2002. Applied research management of cyanobacteria in Iran: problems and solutions. The 1st Iranian Congress on Applied Biology, Islamic Azad University, Mashhad, Iran. Whitton, B.A. & Potts, M. 2000. The Ecology of Cyanobacteria. Their Diversity in Time and Space. Pp. 1–11. In: The Ecology of Cyanobacteria, Vol. I. Springer Netherlands. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 693 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 611 |
||