گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه خلیج فارس
چکیده
در این مطالعه سعی شده که جایگاه اتصال فاکتورهای رونویسی موجود در ناحیه پروموتور ژن CSN1S1 در شتر مورد مطالعه قرار گیرند و با دیگر گونههای اهلی مقایسه شوند. پس از اخذ توالی ناحیه پروموتور از پایگاه داده NCBI، شناسایی جایگاههای اتصال فاکتورهای رونویسی با استفاده از نرمافزار بر خط PROMO صورت گرفت و نتایج با استفاده از Excel و Visual Bacis برای یافتن شباهت ها و تفاوتها مورد ارزیابی قرار گرفته شدند. نتایج نشان دادند که در ناحیه پروموتور ژن CSN1S1 جایگاه اتصال برای انواع مختلفی از فاکتورهای رونویسی وجود دارد. هر چند جایگاههای اتصال مشترک زیادی بین گونهها مشاهده شد اما تعدادی جایگاه خاص برای شتر مشاهده شد که در دیگر گونهها ملاحظه نشدهاند. بهطورکلی، نتایج این تحقیق نشان داده که شرایط رونوشتبرداری از این ژن در اکثر شرایط بین گونهها مشترک بوده اما در حالتهای خاص از یک گونه تا گونه دیگر متفاوت میباشند.
Comparison of Transcription Factor Binding Sites of Camel CSN1S1 Gene with other Domestic Animal
نویسندگان [English]
Salim Morammazi
Department of Animal Science, Faculty of Agricultural and Natural Resources, University of Persian Gulf, Boushehr
چکیده [English]
In this study we tried to investigate the transcription factor binding sites in the promoter region of camel CSN1S1 gene and compared them with those located in domestic animal. After obtaining the promoter region sequences from NCBI database, identifying transcription binding site was done with PROMO online software, and their results were assessed for similarities and differences by using Excel and Visual Basic softwares. The results showed that the promoter region of the CSN1S1 gene have various types of binding sites for transcription factors. Although, a lot of common binding sites was observed between species, but some special binding sites were observed in camel. Overall, the present results show that the transcription conditions of this gene are often similar between species, but in special conditions are different from one species to another species.
کلیدواژهها [English]
CSN1S1 gene, One hump camel, Transcription factors binding sites