کدخدایی, سعید, طبائی عقدانی, سید رضا. (1381). بهینه سازی روش استخراج DNA در Amygdalus spp. سامانه مدیریت نشریات علمی, 10(1), 15-27. doi: 10.22092/ijrfpbgr.2002.115682
سعید کدخدایی; سید رضا طبائی عقدانی. "بهینه سازی روش استخراج DNA در Amygdalus spp". سامانه مدیریت نشریات علمی, 10, 1, 1381, 15-27. doi: 10.22092/ijrfpbgr.2002.115682
کدخدایی, سعید, طبائی عقدانی, سید رضا. (1381). 'بهینه سازی روش استخراج DNA در Amygdalus spp', سامانه مدیریت نشریات علمی, 10(1), pp. 15-27. doi: 10.22092/ijrfpbgr.2002.115682
کدخدایی, سعید, طبائی عقدانی, سید رضا. بهینه سازی روش استخراج DNA در Amygdalus spp. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1381; 10(1): 15-27. doi: 10.22092/ijrfpbgr.2002.115682
مقاله حاضر به ارائه روشی ساده جهت استخراج DNA ژنومی از گیاهان دارای متابولیتهای ثانویه زیاد می پردازد. در این روش برگهای جوان و برگهای نسبتاً مسن از گونه های مختلف بادام وحشی و نیز ارقام اهلی، به عنوان مواد گیاهی، مورد بررسی قرار گرفتند. دراین روش ازSDS به جای CTAB که عمدتاً برای استخراج DNAگیاهان حاوی پلی ساکارید زیاد بکارمیرود و نیز سارکوسیل که دارای هزینه نسبتاً بالایی می باشند، نمک NaCI با غلظت نسبتاً زیادی جهت حذف پلی ساکاریدها،PVPبه منظور حذف موادپلی فنلی، RNase برای از بین بردن RNAو دوتا سه مرتبه استخراج به وسیله کلروفرم: ایزوآمیل الکل،استفاده گردید.میانگین عملکرد DNA بدست آمده ازاین روش به صورت PG/G50 بافت برگی PG/G70 بافت برگی جوان و 30 میکروگرم بر گرم بافت برگی نسبتاً مسن)بوده. DNAاستخراج شده بدین روش ازتقریباًMG100 برگ گیاه، با استفاده از دستگاه اسپکتروفتومتر ونیز ژل آگارز آزمایش (ارزیابی) گردیدوکیفیت و کمیت مناسب ومقابل قبولی را نشان داد. تمامی این DNAها به طور کاملاً موفقیت آمیزی درواکنشهای PCR(به میزانng/pl5/. محلول واکنش) قابل تکثیربودند بنابراین به دلیل سادگی،کمیت وکفیت مناسبDNAبدست آمده وهزینه نسبتاً کمتر، استفاده ازاین روش برای سایرگیاهان خانوادهRosaceaeواحتمالاً خانواده دیگری که استخراج DNAآنها با مشکل همراه است مفید خواهد بود.
Optimizing DNA extraction procedure in case of Amygdalus spp.
نویسندگان [English]
s. Kadkhodaie1؛ S.R. Tabaie-Aghduie22
11 - Postgraduate student, Tabriz University
2 - Research Institute of Fortests and Rangelands, P.O.Box 13185-l16, Tehran
2Research Institute of Fortests and Rangelands, P.O.Box 13185-l16, Tehran
چکیده [English]
A simple method was developed to extract sufficient amount of genomic DNA, from plant species containing high amount of secondary metabolites. Leaves of different Amygdalus species including A. scoparia, A. haussknechtii, A. lyciodes, A. elaegnifolia and A. commonis were used for DNA extraction. SDS (instead of CTAB or Sarkosile), NaCl (to remove polysaccharides), PVP (to remove polyphenolic compounds) were used in extracting buffer. Sodium chloride was used again for more polysaccharide removal and RNase to remove RNA. Also, extraction was repeated several times, using chloform: isoamyl-alchohol to abtain more purified DNA. Average yield of DNA, extracted with this procedure was 50 pg per I g leaf tissue (70pglg and 30pg/g in young and old leaf tissues, respectively). Extracted DNAs showed successful reproducibility through PCR amplification. This method which is relativerly inexpensive, could be efficiently applied for other species of rosaceae or different plant families from which DNA extraction is cumbersome.
کلیدواژهها [English]
DNA extraction, Amygdalus spp, Polysaccharides, Polyphenoles
مراجع
clarck M. s., lggT. Plant molecular biology-A laboratory manual. Bio Techniques, 13: 52-56.50' porebski, s., L. G. Bailey and B. R. Baum, 1997. Modification fo a cTAB DNA extraction protocol for plants containing high polysaccharide and polyphenol components. Plant. Mol. Bio. Rep' l5: 8-15' Tabaei-Aghdaei. S. R., 1997. Studies of stress responses in Gramineae (Foaceae) Using biotechnological methods. PhD thesis, Newcastle University, UK. Wang, X. D., Z.P.Wangand Y. P. Zou,. 1996. An improved procedure for the isolation of nuclear DNA from leaves of wild grapevine dried with Silica gel. Plant Mol. Bio. Rep., 14: 369-373- weir B. J., R. G. St. Piene and R. N. chibbar, 1996. Isolation of DNA for RAPD analysis from leaves of saskatoon (Amelanchier alnifolia