Amirdehi, Elham, Fotouhifar, Khalil-Berdi, Javan-Nikkhah, Mohammad. (1396). Morphological and molecular study on some species of Phoma and related taxa in Iran. سامانه مدیریت نشریات علمی, 18(1), 59-76. doi: 10.22092/botany.2017.113235
Elham Amirdehi; Khalil-Berdi Fotouhifar; Mohammad Javan-Nikkhah. "Morphological and molecular study on some species of Phoma and related taxa in Iran". سامانه مدیریت نشریات علمی, 18, 1, 1396, 59-76. doi: 10.22092/botany.2017.113235
Amirdehi, Elham, Fotouhifar, Khalil-Berdi, Javan-Nikkhah, Mohammad. (1396). 'Morphological and molecular study on some species of Phoma and related taxa in Iran', سامانه مدیریت نشریات علمی, 18(1), pp. 59-76. doi: 10.22092/botany.2017.113235
Amirdehi, Elham, Fotouhifar, Khalil-Berdi, Javan-Nikkhah, Mohammad. Morphological and molecular study on some species of Phoma and related taxa in Iran. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1396; 18(1): 59-76. doi: 10.22092/botany.2017.113235
Morphological and molecular study on some species of Phoma and related taxa in Iran
1PhD Student of Plant Pathology, Department of Plant Protection, Faculty of Agricultural Science and Engineering, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran
2Associate Prof. of Mycology, Department of Plant Protection, Faculty of Agricultural Science and Engineering, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj 31587-77871, Iran (fotowhi@ut.ac.ir)
3Prof. of Mycology, Department of Plant Protection, Faculty of Agricultural Science and Engineering, College of Agriculture and Natural Resources, University of Tehran, Karaj, Iran
چکیده
The genus Phoma Sacc. consists of important fungal plant pathogenic species occurring on economically important cultivated crops in spite of many other saprobic species. Thus, the aim of this study was to identify 35 isolates of Phoma species and related taxa collected from different hosts by means of morphological and molecular characters. Multi-locus phylogenetic analyses based on ITS1-5.8S-ITS2, actin and β-tubulin gene regions were conducted. Therefore, seven species including Boeremia exigua, Didymella acetosellae, D. bellidis, D. pinodella, Neocamarosporium betae, Phoma destructiva var. destructive, and P. medicaginis were identified and described, and among them, three species including D. bellidis, D. acetosellae, and P. destructiva var. destructiva are new records for the mycobiota of Iran. Also, B. exigua,and D. pinodella are reported for the first time from new host plants including Paliurus spina-christi, and Trigonella-foenum graecum, respectively. The morphological features and phylogenetic analyses were able to clarify the generic and species delimitation very clearly.
مطالعه ریختشناختی و مولکولی برخی گونههای جنس Phoma و آرایههای وابسته در ایران
نویسندگان [English]
الهام امیردهی1؛ خلیل بردی فتوحی فر2؛ محمد جوان نیکخواه3
1دانشجوی دکتری گروه گیاهپزشکی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران
2دانشیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران 77871-31587 (fotowhi@ut.ac.ir)
3استاد گروه گیاهپزشکی، دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران
چکیده [English]
جنس Phoma علاوه بر گونههای ساپروفیت، گونههای بیمارگر فراوانی نیز دارد که سبب خسارت در محصولات زراعی مهم اقتصادی میشوند. بنابراین، هدف از این تحقیق شناسایی ریختشناختی و مولکولی 35 جدایه از گونههای متعلق به جنس Phoma و آرایههای وابسته و جمعآوری شده از میزبانهای مختلف بود. مطالعه فیلوژنتیکی چندژنی براساس توالییابی نوکلئوتیدی سه ناحیه ژنومی ITS1-5.8S-ITS2، اکتین و بتا توبولین انجام شد. در نتیجه، هفت گونه به اسامی Boeremia exigua،Didymella acetosellae ،D. bellidis، D. pinodella ،Neocamarosporium betae ،Phoma destructiva var. destructiva و P. medicaginis شناسایی و توصیف شدند که از این میان، سه گونه D. bellidis، D. acetosellae وvar. destructivaP. destructiva برای نخستین بار برای میکوبیوتای ایران و دو گونه B. exigua و D. pinodella نیز به ترتیب از میزبانهای گیاهی جدید Paliurus spina-christi و Trigonella-foenum graecum گزارش میشوند. ویژگیهای ریختشناختی و تجزیه و تحلیلهای فیلوژنتیکی به خوبی قادر بود حدود و ثغور جنسها و گونهها را تعیین نماید.
کلیدواژهها [English]
آرایه, اکتین و بتا توبولین, فیلوژنی, ITS1-5.8S-ITS2, Phoma