| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 2,846 |
| تعداد مقالات | 32,300 |
| تعداد مشاهده مقاله | 41,387,033 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 18,562,149 |
LPS-PCR typing of ovine Pasteurella multocida isolates from Iran based on (L1 to L8) outer core biosynthesis loci | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقاله 3، دوره 72، شماره 3، آذر 2017، صفحه 165-171 اصل مقاله (367.49 K) | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2017.111607 | ||
| نویسندگان | ||
| S. F. Mirhaghgoye Jalali1؛ A.R. Jabbari* ؛ M. Esmael Zad2 | ||
| 1Pasteurella National Research Laboratory, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education, and Extension Organization, Karaj, Iran | ||
| 2assistant professor razi institute | ||
| چکیده | ||
| Pasteurella multocida isa gram-negative bacterial pathogen that is causative agent of a wide range of diseases in many animal species and humans. Lipopolysaccharides (LPS) are an important virulence factor, minor changes to structure of which can exert dramatic effects on pathogenicity of P. multocida in its host. LPS can be used for the identification and classification of strains with somatic typing systems.The aim of this study was to identify the LPS genotypes of the ovine P. multocida isolates obtained from pneumonia cases in Iran. The LPS genotype of the isolates was determined using eight specific primers for LPS outer core biosynthesis loci. The LPS genes were amplified by polymerase chain reaction (PCR), then they were sequenced and compared to the sequences registered in the GenBank. Of the 32 ovine P. multocida isolates tested, 21 (65.62%) isolates belonged to genotype L6, 9 (28.12%) isolates contained genotype L3, 1 (3.12%) isolate had both L3 and L6 loci, and 1 (3.12%) isolate remained untypeable. The LPS-PCR was able to type 31 of 32 field ovine isolates from Iran. According to the phylogenetic analysis, L3 genotype isolates were grouped into two distinct lineages. LPS gene sequences among L6 genotypes of ovine P. multocida isolates from Iran and the related sequences in the GenBank were highly similar (>99.5%). LPS-PCR is an accurate genotyping method that was able to classify P. multocida strains into one of the eight distinct LPS genotypes. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| P. multocida؛ Sheep؛ LPS outer core؛ PCR-typing | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| LPS- PCR تاپینگ ایزوله‌های ایرانی پاستورلامولتوسیدای گوسفندی، براساس ژنهای بیوسنتزکننده هسته خارجی (1L تا 8LPS (L | ||
| چکیده [English] | ||
| پاستورلا مولتوسیدا یک باکتری گرم منفی است که عامل ایجاد بیماریهای مختلفی در بسیاری از گونه های حیوانی و انسانی میباشد. آنچه که آشکار است LPS یک فاکتور بیماریزای مهم می باشد که هر تغییر کوچکی در ساختار LPS باعث اثرات اساسی در توانایی ایجاد بیماری توسط پاستورلا مولتوسیدا در میزبانش میشود و نیزLPS میتواند به عنوان یک فاکتور مهم در سیستم تایپینگ سوماتیک، برای شناسایی و طبقه بندی باکتری مورد استفاده قرار گیرد. ژنوتیپLPS جدایه های گوسفندی، با استفاده از 8 جفت پرایمر اختصاصی ژن های بیوسنتزهسته خارجی LPS تعیین شدند. سپس ژنهای LPS تکثیر یافته به وسیله واکنش زنجیرهای پلیمراز، تعیین توالی شده و با توالیهای موجود در بانک ژن مورد مقایسه قرار گرفتند. از 32 جدایه پاستورلا مولتوسیدای گوسفندی مورد آزمایش، 21 جدایه با فراوانی (62/65%) دارای ژنوتیپ 6L، 9 جدایه با فراوانی( 12/28%) دارای ژنوتیپ 3L، 1 جدایه با فراوانی( 12/3%) شامل هر دو ژنوتیپ 3L و 6L بودند. 1 جدایه با فراوانی (12/3%) غیر قابل تیپ بندی بود. روش LPS-PCR توانست ژنوتیپ 31 مورد از 32 جدایه فیلدی مورد مطالعه را تعیین نماید. بر اساس آنالیز فیلوژنتیکی، جدایههای ژنوتیپ L3 در دو زیر شاخه مجزا قرار گرفتند. درصد تشابه توالی ژن های LPS در بین جدایههای گوسفندی ژنوتیپ با توالیهای موجود در بانک ژن بطور قابل توجهی بالا (5/99%>) بود. LPS-PCR یک روش ژنوتایپینگ دقیق است که میتواند سویه های پاستورلا مولتوسیدا را در یکی از هشت ژنوتیپ LPS طبقه بندی نماید. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| پاستورلا مولتوسیدا, گوسفند, هسته خارجی LPS, تعیین تیپ با روش واکنش زنجیرهای پلیمراز | ||
| مراجع | ||
|
Brogden, K.A., Rebers, P.A., 1978. Serologic examination of the Westphal-type lipopolysaccharides of Pasteurella multocida. Am J Vet Res 39, 1680-1682.
Christensen, J.P., Bisgaard, M., 2000. Fowel cholera. Rev Sci Tech OIE 19, 626-637.
Ewers, C., Lübke-Becker, A., Bethe, A., Kießling, S., Filter, M., Wieler, L.H., 2006. Virulence genotype of Pasteurella multocida strains isolated from different hosts with various disease status. Veterinary Microbiology 114, 304-317.
Harper, M., Boyce, J.D., Adler, B., 2006. Pasteurella multocida pathogenesis: 125 years after Pasteur. FEMS Microbiol Lett 265, 1-10.
Harper, M., Cox, A.D., Adler, B., Boyce, J.D., 2011a. Pasteurella multocida lipopolysaccharide: the long and the short of it. Vet Microbiol 153, 109-115.
Harper, M., Michael, F., Vinogradov, E., John, M., Steen, J.A., Van Dorsten, L., et al., 2013a. Structure and biosynthetic locus of the lipopolysaccharide produced by pasteurella multocida serovars 8 and 13 and the identification of a novel phosphor-glycero moiety. Glycobiology 23, 286-294.
Harper, M., St Michael, F., John, M., Steen, J., van Dorsten, L., Parnas, H., et al., 2014. Structural analysis of lipopolysaccharide produced by Heddleston serovars 10, 11, 12 and 15 and the identification of a new Pasteurella multocida lipopolysaccharide outer core biosynthesis locus, L6. Glycobiology 24, 649-659.
Harper, M., St Michael, F., John, M., Vinogradov, E., Adler, B., Boyce, J.D., et al., 2011b. Pasteurella multocida Heddleston serovars 1 and 14 express different lipopolysaccharide structures but share the same lipopolysaccharide biosynthesis outer core locus. Vet Microbiol 150, 289-296.
Harper, M., St Michael, F., John, M., Vinogradov, E., Steen, J.A., van Dorsten, L., et al., 2013b. Pasteurella multocida Heddleston serovar 3 and 4 strains share a common lipopolysaccharide biosynthesis locus but display both inter- and intrastrain lipopolysaccharide heterogeneity. J Bacteriol 195, 4854-4864.
Harper, M., St Michael, F., Vinogradov, E., John, M., Boyce, J.D., Adler, B., et al., 2012. Characterization of the lipopolysaccharide from Pasteurella multocida Heddleston serovar 9: identification of a proposed bi-functional dTDP-3-acetamido-3,6-dideoxy-alpha-D-glucose biosynthesis enzyme. Glycobiology 22, 332-344.
Heddleston, K.L., Gallagher, J.E., Rebers, P.A., 1972. Fowl cholera: gel diffusion precipitin test for serotyping Pasteruella multocida from avian species. Avian Dis 16, 925-936.
Raetz, C.R.H., Whitfield, C., 2002. Lipopolysaccharide Endotoxins. Annual Review of Biochemistry 71, 635-700.
Shayegh, J., Dolgari-Sharaf, J., Mikaili, P., Namvar, H., 2009. Pheno- and genotyping of Pasteurella multocida isolated from goat in Iran. Af J Biotechnol 8, 3707-3710.
Singh, R., Blackall, P.J., Remington, B., Turni, C., 2013. Studies on the presence and persistence of Pasteurella multocida serovars and genotypes in fowl cholera outbreaks. Avian Pathol 42, 581-585.
St Michael, F., Harper, M., Parnas, H., John, M., Stupak, J., Vinogradov, E., et al., 2009. Structural and genetic basis for the serological differentiation of Pasteurella multocida Heddleston serotypes 2 and 5. J Bacteriol 191, 6950-6959.
Townsend, K.M., Boyce, J.D., Chung, J.Y., Frost, A.J., Adler, B., 2001. Genetic organization of Pasteurella multocida cap Loci and development of a multiplex capsular PCR typing system. J Clin Microbiol 39, 924-929.
Townsend, K.M., Frost, A.J., Lee, C.W., Papadimitriou, J.M., Dawkins, H.J., 1998. Development of PCR assays for species- and type-specific identification of Pasteurella multocida isolates. J Clin Microbiol 36, 1096-1100.
Wilkie, I.W., Harper, M., Boyce, J.D., Adler, B., 2012. Pasteurella multocida: diseases and pathogenesis. Curr Top Microbiol Immunol 361, 1-22.
Wilson, M.A., Morgan, M.J., Barger, G.E., 1993. Comparison of DNA fingerprinting and serotyping for identification of avian Pasteurella multocida isolates. J Clin Microbiol 31, 255-259. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,896 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 775 |
||