LPS- PCR تاپینگ ایزولههای ایرانی پاستورلامولتوسیدای گوسفندی، براساس ژنهای بیوسنتزکننده هسته خارجی (1L تا 8LPS (L | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| Article 3, Volume 72, Issue 3, September 1396, Pages 165-171 PDF (367.49 K) | ||
| Document Type: مقالات پژوهشی | ||
| DOI: 10.22092/ari.2017.111607 | ||
| Abstract | ||
| پاستورلا مولتوسیدا یک باکتری گرم منفی است که عامل ایجاد بیماریهای مختلفی در بسیاری از گونه های حیوانی و انسانی میباشد. آنچه که آشکار است LPS یک فاکتور بیماریزای مهم می باشد که هر تغییر کوچکی در ساختار LPS باعث اثرات اساسی در توانایی ایجاد بیماری توسط پاستورلا مولتوسیدا در میزبانش میشود و نیزLPS میتواند به عنوان یک فاکتور مهم در سیستم تایپینگ سوماتیک، برای شناسایی و طبقه بندی باکتری مورد استفاده قرار گیرد. ژنوتیپLPS جدایه های گوسفندی، با استفاده از 8 جفت پرایمر اختصاصی ژن های بیوسنتزهسته خارجی LPS تعیین شدند. سپس ژنهای LPS تکثیر یافته به وسیله واکنش زنجیرهای پلیمراز، تعیین توالی شده و با توالیهای موجود در بانک ژن مورد مقایسه قرار گرفتند. از 32 جدایه پاستورلا مولتوسیدای گوسفندی مورد آزمایش، 21 جدایه با فراوانی (62/65%) دارای ژنوتیپ 6L، 9 جدایه با فراوانی( 12/28%) دارای ژنوتیپ 3L، 1 جدایه با فراوانی( 12/3%) شامل هر دو ژنوتیپ 3L و 6L بودند. 1 جدایه با فراوانی (12/3%) غیر قابل تیپ بندی بود. روش LPS-PCR توانست ژنوتیپ 31 مورد از 32 جدایه فیلدی مورد مطالعه را تعیین نماید. بر اساس آنالیز فیلوژنتیکی، جدایههای ژنوتیپ L3 در دو زیر شاخه مجزا قرار گرفتند. درصد تشابه توالی ژن های LPS در بین جدایههای گوسفندی ژنوتیپ با توالیهای موجود در بانک ژن بطور قابل توجهی بالا (5/99%>) بود. LPS-PCR یک روش ژنوتایپینگ دقیق است که میتواند سویه های پاستورلا مولتوسیدا را در یکی از هشت ژنوتیپ LPS طبقه بندی نماید. | ||
| Keywords | ||
| پاستورلا مولتوسیدا; گوسفند; هسته خارجی LPS; تعیین تیپ با روش واکنش زنجیرهای پلیمراز | ||
| References | ||
|
Brogden, K.A., Rebers, P.A., 1978. Serologic examination of the Westphal-type lipopolysaccharides of Pasteurella multocida. Am J Vet Res 39, 1680-1682.
Christensen, J.P., Bisgaard, M., 2000. Fowel cholera. Rev Sci Tech OIE 19, 626-637.
Ewers, C., Lübke-Becker, A., Bethe, A., Kießling, S., Filter, M., Wieler, L.H., 2006. Virulence genotype of Pasteurella multocida strains isolated from different hosts with various disease status. Veterinary Microbiology 114, 304-317.
Harper, M., Boyce, J.D., Adler, B., 2006. Pasteurella multocida pathogenesis: 125 years after Pasteur. FEMS Microbiol Lett 265, 1-10.
Harper, M., Cox, A.D., Adler, B., Boyce, J.D., 2011a. Pasteurella multocida lipopolysaccharide: the long and the short of it. Vet Microbiol 153, 109-115.
Harper, M., Michael, F., Vinogradov, E., John, M., Steen, J.A., Van Dorsten, L., et al., 2013a. Structure and biosynthetic locus of the lipopolysaccharide produced by pasteurella multocida serovars 8 and 13 and the identification of a novel phosphor-glycero moiety. Glycobiology 23, 286-294.
Harper, M., St Michael, F., John, M., Steen, J., van Dorsten, L., Parnas, H., et al., 2014. Structural analysis of lipopolysaccharide produced by Heddleston serovars 10, 11, 12 and 15 and the identification of a new Pasteurella multocida lipopolysaccharide outer core biosynthesis locus, L6. Glycobiology 24, 649-659.
Harper, M., St Michael, F., John, M., Vinogradov, E., Adler, B., Boyce, J.D., et al., 2011b. Pasteurella multocida Heddleston serovars 1 and 14 express different lipopolysaccharide structures but share the same lipopolysaccharide biosynthesis outer core locus. Vet Microbiol 150, 289-296.
Harper, M., St Michael, F., John, M., Vinogradov, E., Steen, J.A., van Dorsten, L., et al., 2013b. Pasteurella multocida Heddleston serovar 3 and 4 strains share a common lipopolysaccharide biosynthesis locus but display both inter- and intrastrain lipopolysaccharide heterogeneity. J Bacteriol 195, 4854-4864.
Harper, M., St Michael, F., Vinogradov, E., John, M., Boyce, J.D., Adler, B., et al., 2012. Characterization of the lipopolysaccharide from Pasteurella multocida Heddleston serovar 9: identification of a proposed bi-functional dTDP-3-acetamido-3,6-dideoxy-alpha-D-glucose biosynthesis enzyme. Glycobiology 22, 332-344.
Heddleston, K.L., Gallagher, J.E., Rebers, P.A., 1972. Fowl cholera: gel diffusion precipitin test for serotyping Pasteruella multocida from avian species. Avian Dis 16, 925-936.
Raetz, C.R.H., Whitfield, C., 2002. Lipopolysaccharide Endotoxins. Annual Review of Biochemistry 71, 635-700.
Shayegh, J., Dolgari-Sharaf, J., Mikaili, P., Namvar, H., 2009. Pheno- and genotyping of Pasteurella multocida isolated from goat in Iran. Af J Biotechnol 8, 3707-3710.
Singh, R., Blackall, P.J., Remington, B., Turni, C., 2013. Studies on the presence and persistence of Pasteurella multocida serovars and genotypes in fowl cholera outbreaks. Avian Pathol 42, 581-585.
St Michael, F., Harper, M., Parnas, H., John, M., Stupak, J., Vinogradov, E., et al., 2009. Structural and genetic basis for the serological differentiation of Pasteurella multocida Heddleston serotypes 2 and 5. J Bacteriol 191, 6950-6959.
Townsend, K.M., Boyce, J.D., Chung, J.Y., Frost, A.J., Adler, B., 2001. Genetic organization of Pasteurella multocida cap Loci and development of a multiplex capsular PCR typing system. J Clin Microbiol 39, 924-929.
Townsend, K.M., Frost, A.J., Lee, C.W., Papadimitriou, J.M., Dawkins, H.J., 1998. Development of PCR assays for species- and type-specific identification of Pasteurella multocida isolates. J Clin Microbiol 36, 1096-1100.
Wilkie, I.W., Harper, M., Boyce, J.D., Adler, B., 2012. Pasteurella multocida: diseases and pathogenesis. Curr Top Microbiol Immunol 361, 1-22.
Wilson, M.A., Morgan, M.J., Barger, G.E., 1993. Comparison of DNA fingerprinting and serotyping for identification of avian Pasteurella multocida isolates. J Clin Microbiol 31, 255-259. | ||
|
Statistics Article View: 2,283 PDF Download: 2,783 |
||