| تعداد نشریات | 284 |
| تعداد نشریات سازمان | 82 |
| تعداد شماره‌ها | 3,044 |
| تعداد مقالات | 34,047 |
| تعداد مشاهده مقاله | 46,439,661 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 77,507,437 |
تنوع ژنتیکی کلروپلاستی و جریانات ژنی در گونههای گلابی با استفاده از نشانگر CAPS | ||
| نهال و بذر | ||
| مقاله 6، دوره 31، شماره 1، اردیبهشت 1394، صفحه 117-134 اصل مقاله (848.91 K) | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/spij.2017.111251 | ||
| نویسندگان | ||
| اعظم نیک‌زاد قره‌آغاجی* ؛ حمید عبداللهی؛ کاظم ارزانی؛ عبدالعلی شجاعیان؛ پاولود فرانچسکی؛ لوکا دوندینی | ||
| گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران | ||
| چکیده | ||
| مناطق غیرکدکننده برای ارزیابی گروهبندیهای فیلوژن در جنس Pyrus بسیار قابل استفاده است زیرا این مناطق کمتر عملکردی بوده و بنابراین تنوع آنها تحت تأثیر انتخاب خنثی است. در این پژوهش، روش توالیهای چندشکل تکثیر شدۀ شکسته شده (Cleaved Amplified Polymorphic Sequence: CAPS) برای تجزیۀ سه ناحیۀ بسیار متغیر در نواحی بینژنی DNA کلروپلاست در 73 رقم بومی و ژنوتیپ وحشی گلابی ایرانی و اروپایی (Pyrus communis)، نه رقم ژاپنی P. pyrifolia, syn. P. serotina و یک ژنوتیپ چینی P. × bretscheideri مورد بررسی قرار گرفت. مطالعۀ ژنوم کلروپلاست 83 رقم و ژنوتیپ با استفاده از سه جفت آغازگر کلروپلاستی و سه آنزیم برشی Tru1I، BsuRI و RsaI، پانزده هاپلوتیپ را شناسایی کرد. هاپلوتیپ H1 بالاترین فراوانی را در بین ارقام اروپایی نشان داد و هاپلوتیپهای H10، H7 و H4 منحصراً در ارقام و ژنوتیپهای ایرانی مشاهده شد. در کل، نشانگر CAPS ارقام و ژنوتیپهای وحشی مورد بررسی در این مطالعه را به پنج گروه جداگانه تقسیم کرد و ارقام ژاپنی در این دندروگرام با ژنوتیپهای ایرانی همگروه بودند. این نتایج فرضیۀ ردپای ژنتیکی روی ژرمپلاسم گلابی ایرانی را توسط دورگگیری گلابیهای کشت شدۀ آسیای شرقی و اروپایی و جریانهای ژنی از گونههای وحشی به اهلی، تأیید کرد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Pyrus sp؛ DNA کلروپلاست؛ توالیهای چندشکل تکثیر شدۀ شکسته شده؛ جمعیت گلابی | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Chloroplastic Genetic Diversity and Gene Flow in Pear Species Revealed by the CAPS Marker | ||
| نویسندگان [English] | ||
| A. Nikzad Gharehaghaj؛ H. Abdollahi؛ K. Arzani؛ A. Shojaeiyan؛ P. De Franceschi؛ L. Dondini | ||
| چکیده [English] | ||
| The non-coding chloroplast regions are likely provide the greatest number of characters for molecular phylogenetic studies, because they are less functional and highly conserved and so their variation is affected by neutral selection. In order to investigate phylogenetic relationship in 73 Iranian and European pear (Pyrus communis L.) local cultivars and wild genotypes, plus 9 Japanese pear genotypes (Pyrus pyrifolia, syn. P. serotina) and one Chinese pear (P. × bretschneideri), we recognized three hyper variable regions in intergenic spacers of cpDNA by CAPS (Cleaved amplified polymorphic sequence) method. Using three chloroplast primer pairs and three restriction enzymes (Tru1I, BsuRI and Rsa1) 15 haplotypes were detected. The most-abundant and widely distributed haplotype in European cultivars was H1 and three haplotypes (H10, H7 and H4) were exclusive haplotypes of Iranian population. The CAPS markers were divided Iranian and European pear cultivars into five groups, whereas Japanese pear cultivars were grouped together with Iranian pear genotypes. This evidence supports the hypothesis of a significant genetic contribution in the Iranian wild genotypes from Japanese and European pear. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Pyrus sp. chloroplast DNA, CAPS, pear population | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 441 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 287 |
||