| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 3,005 |
| تعداد مقالات | 33,631 |
| تعداد مشاهده مقاله | 44,472,473 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 29,936,146 |
تنوع آللی نشانگرهای SSR درتوده‌های بومی و لاین‌های اصلاحی جو | ||
| نهال و بذر | ||
| مقاله 14، دوره 30، شماره 2، شهریور 1393، صفحه 475-490 اصل مقاله (364.86 K) | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/spij.2017.111224 | ||
| نویسندگان | ||
| سیدابوالقاسم محمدی؛ سیدسیامک علوی‌کیا؛ بهزاد صادق زاده؛ | ||
| چکیده | ||
| گام اول در بهره‌برداری از توده‌های بومی گیاهان در برنامه‌های به‌نژادی، تعیین سطح تنوع و روابط ژنتیکی آن‌ها است. در این مطالعه، تنوع و روابط ژنتیکی 144 ژنوتیپ جو شامل 119 توده بومی و 25 لاین اصلاحی با استفاده از 32 جفت آغازگر SSR چند شکل بررسی شد. در مجموع 143 آلل در محدوده 2 تا 12 آلل در ژنوتیپ‌های مورد مطالعه تکثیر شد.میانگین تعداد آلل به ازای هرجایگاه، برای لاین‌های اصلاحی 45/3، توده‌های بومی 41/4 و در مجموع ژنوتیپ‌ها 47/4 بود . متوسط میزان اطلاعات چند شکلی برای لاین‌های اصلاحی، توده‌های بومی و مجموع ژنوتیپ‌ها، به ترتیب 44/0، 53/0 و 53/0 برآورد شد. شاخص تنوع ژنی نای (Nei)یا تنوع هتروزیگوتی مورد انتظار دارای میانگین 59/0 و دامنه تغییرات بین 22/0 تا 87/0 بود. گروه‌بندی ژنوتیپ‌ها با استفاده از الگوریتم خوشه‌ای Minimum evolution method و ضریب فاصله Kimura 2-parameter model آن‌ها را به هشت گروه منتسب کرد. در تجزیه به بردارهای اصلی، سه بردار اول در مجموع 77/71% از تغییرات مولکولی کل بین ژنوتیپ‌ها را تبیین کردند. آرایش ژنوتیپ‌ها براساس دو بردار اصلی اول، مطابقت بالایی با گروه‌بندی حاصل از تجزیه خوشه‌ای داشت. نتایج نشان داد که نشانگرهای SSR برای بررسی تنوع ژنتیکی در ژرم‌پلاسم جو و نیز انجام برنامه‌های به نژادی شامل جمع‌آوری و حفاظت مجموعه‌های بانک ژن ابزاری کارا هستند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| جو؛ توده‌های بومی؛ روابط ژنتیکی؛ نشانگرهای ریزماهواره؛ تجزیه خوشه‌ای | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Allelic Diversity of SSR Markers in Barley Landraces and Lines | ||
| نویسندگان [English] | ||
| S. A. Mohammadi؛ S. S. Alavi Kia؛ B. Sadeghzadeh؛ | ||
| چکیده [English] | ||
| Determination of genetic diversity level and relationships is the first step in exploration of crop landraces in breeding programs. In the present study, genetic diversity and relationships of 144 barley genotypes consisted of 119 landraces and 25 breeding lines were analyzed using 32 polymorphic SSR primer pairs. In total, 143 alleles with range of 2 to 12 alleles were amplified in the studied genotypes. The mean number of alleles per locus was 3.45 for breeding lines, 4.41 for landraces, and 4.47 for all the genotypes and the mean polymorphic information content (PIC) scores were 0.44, 0.53 and 0.53 for breeding lines, landraces, and all the genotypes, respectively. Nei gene diversity or expected heterozygosity ranged from 0.22 to 0.87, with an average of 0.59. Grouping of genotypes using Minimum Evolution method algorithm and Kimura 2-parameter model assigned the genotypes into eight clusters. The first three vectors in principal component analysis explained 71.77% of total molecular changes among genotypes. Grouping of genotypes using the first two vectors were consistent cluster analysis. The results revealed that SSR markers are efficient tools for genetic diversity analysis in barley germplasm collections as well as for collection and preservation strategies in gene bank. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Barley landraces, cluster analysis, genetic relationships, Microsatellite markers | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 302 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 178 |
||