| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 2,828 |
| تعداد مقالات | 32,031 |
| تعداد مشاهده مقاله | 40,821,152 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 18,073,792 |
انگشت‌نگاری DNA ارقام تجاری فندق (Corylus avellana L.) بومی ایران برای تهیه شناسه ژنتیکی | ||
| نهال و بذر | ||
| مقاله 9، دوره 29، شماره 3، آبان 1392، صفحه 551-565 اصل مقاله (1.14 M) | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/spij.2017.111175 | ||
| نویسندگان | ||
| مهرزاد احمدی؛ جواد مظفری* ؛ سونا حسین‌آوا؛ عبداله محمدی | ||
| چکیده | ||
| به منظور تهیه شناسه یا بارکد ژنتیکی ارقام تجاری فندق ایران، بیست و هشت اصله درخت از ده رقم کلکسیون فندق با استفاده از ده جفت آغازگرهای ریز ماهواره‌ای (SSR) انگشت‌نگاری DNA شدند. در مجموع 63 آلل با میانگین 3/6 آلل در هر مکان ژنی تکثیر شد. تعداد آلل‌ها در هر مکانSSR مورد آزمون بین 5 تا 10 متغیر بود. بیشترین آلل مشاهده شده مربوط به مکان ژنی CAT-B107 با 10 آلل بود. میانگین محتوای اطلاعات چند شکلی 70/0 محاسبه شد که نشان از وجود تنوع ژنتیکی قابل ملاحظه‌ای بین ارقام فندق کشور بود. در تجزیه خوشه‌ای که بر مبنای الگوی چند شکلی DNA آلل‌های SSR انجام شد، رقم شیروانی به طور جداگانه در یک شاخه مستقل و سایر ارقام در شاخه دیگر شامل پنج گروه قرار گرفتند. بر این اساس کلیه ارقام مورد بررسی به جز دو رقم پشمینه و گرچه از هم متمایز شدند. اگرچه برای تمایز این ارقام تنها چهار جفت آغازگر SSR کافی بود ولی افزایش آن تا 14 جفت آغازگر نیز نتوانست این دو رقم را از هم متمایز کند. با توجه به تکثیر غیر جنسی فندق و محل جمع‌آوری دو رقم پشمینه و گرچه، احتمال این‌که این دو رقم در واقع یک ژنوتیپ باشند زیاد است. براساس بارکد ژنتیکی به دست آمده، اصالت ژنتیکی همه درختان مربوط به ارقام مورد بررسی به جز یک درخت از هر یک از ارقام تابستانه، شصتک، محلی کرج و رسمی تایید شد. توصیه می‌شود نتایج این تحقیق در تولید و گواهی نهال فندق و ثبت ارقام آن مد نظر قرار گیرد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| فندق؛ نشانگر‌های SSR؛ بار کد ژنتیکی؛ تجزیه خوشه‌ای؛ شناسائی ژنتیکی | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| DNA Fingerprinting of Commercial Cultivars of Iranian Hazelnut (Corylus avellana L.) for Developing Genetic Barcode | ||
| نویسندگان [English] | ||
| M. Ahmadi؛ J. Mozafari؛ S. Hosseinava؛ A. Mohammadi | ||
| چکیده [English] | ||
| The simple sequence repeat (SSR) markers were used for developing genetic identification barcode for of 28 trees of 10 Iranian commercial cultivars of hazelnut. A total of 63 alleles with an average of 6.3 alleles at each locus were amplified. The number of alleles per SSR locus ranged between five to 10 alleles. The highest member of alleles was observed for SSR locus CAT-B107 with 10 alleles. The average polymorphic information content (PIC) was estimated as 0.70, which indicated a high degree of genetic variation in Iranian hazelnut cultivars. Cluster analysis based on the profile of SSR alleles, separated cv Shirvani from all other cultivars, whereas the other cultivars were placed into five different groups under one clade. Based on DNA polymorphism of these alleles all cultivars were distinct from each other, except cultivars Pashmineh and Gercheh. Although only four primer pairs were sufficient to distinguish cultivars examined in this study from each other, the two cultivars Pashmine and Gercheh showed no genetic difference even with the use of 14 primers. Therefore considering the asexual multiplication of hazelnut and similarity of origin of these two cultivars, the probability of having one genotype for these two is high. Based on these results genetic identity and true to typness of clones belonging to all cultivars, except for one tree of each cultivars Tabestsneh, Shastak, Mahali Karaj and Rasmi were confirmed and their genetic identification barcode was developed. This will facilitate not only for the plant certification but also for the protection of hazelnut cultivars registered in Iran. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| hazelnut, SSR markers, genetic characterization, genetic barcode, cluster analysis | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 279 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 200 |
||