- همه نشریات
- نشریات علمی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویچ کشاورزی
- مجلات ترویجی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- سایر نشریات سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- نشریات علمی انجمن ها
- علوم آب و خاک
- علوم اقتصاد و ترویج کشاورزی
- علوم جنگل, مرتع و آبخیزداری
- علوم دامی و شیلات
- علوم زراعی و باغی
- علوم گیاهپزشکی
- علوم مهندسی و مکانیزاسیون کشاورزی
- نشریات با زبان انگلیسی
- نشریات با زبان فارسی
- نشریات دانشگاه آزاد اسلامی
- نشریات علمی
پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 283 |
| تعداد نشریات سازمان | 81 |
| تعداد شماره‌ها | 2,728 |
| تعداد مقالات | 31,067 |
| تعداد مشاهده مقاله | 28,471,820 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 16,283,711 |
A reverse transcriptase-loop mediated isothermal amplification assay (RT-LAMP) for rapid detection of bovine viral diarrhea virus 1 and 2 | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقاله 1، دوره 72، شماره 2، مهر 2017، صفحه 73-81 اصل مقاله (512.3 K) | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2017.109836 | ||
| نویسندگان | ||
| Amir Tajbakhsh1؛ Elham Rezatofighi* 1؛ Khalil Mirzadeh2؛ Mahdi Pourmahdi3 | ||
| 1Department of Biology, Faculty of Science, Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran | ||
| 2Department of Animal Science and Food, Khouzastan Ramin Agriculture and Natural Resources University, Ahvaz, Iran | ||
| 3Faculty of Veterinary Medicine, Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz, Iran | ||
| چکیده | ||
| Bovine viral diarrhea virus (BVDV) is a pathogen that infects cattle, and is globally important. It causes substantial financial losses to the livestock industry. In the current study, a one-step reverse transcriptase-loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP) assay was set up for rapid and efficient detection of BVDV. For this purpose, four primers were designed to recognize six distinct regions on the target RNA based on a highly conserved sequence in the 5΄ UTR of the BVDV genome. Eighty blood specimens were collected from bovines suspected to suffer from BVDV infection, and were tested in parallel by RT-LAMP and RT-PCR. Twenty four of these samples were positive by RT-LAMP, while twenty were positive by RT-PCR. The RT-LAMP detection limit was estimated to be approximately 70PFU /mL of virus. Comparison of RT-PCR with RT-LAMP in this study revealed the recent developed RT-LAMP a highly sensitive and specific for BVD virus detection in the clinical samples. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Bovine viral diarrhea؛ Reverse Transcriptase-Loop mediated isothermal amplification assay؛ Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| طراحی و ارزیابی روش رونوشت برداری معکوس و واکنش تکثیری هم دما به واسطه لوپ برای شناسایی اسهال ویروسی گاو ویروس 1 و 2 | ||
| نویسندگان [English] | ||
| امیر تاجبخش1؛ الهام رضاتوفیقی1؛ خلیل میرزاده2؛ مهدی پور مهدی3 | ||
| 1گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران | ||
| 2گروه علوم دامی و صنایع غذایی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین، اهواز، ایران | ||
| 3دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران | ||
| چکیده [English] | ||
| ویروس اسهال ویروسی گاو یک عامل بیماریزا برای گاوها میباشد و دارای اهمیت اقتصادی در همه دنیا است. این عامل باعث تحمیل هزینههای فراوان به صنعت دامپروری میشود. روش تک مرحلهایی رونوشت برداری معکوس و تکثیر هم دما به واسطه لوپ (RT-LAMP) برای شناسایی سریع و موثر ویروس اسهال ویروسی گاو طراحی گردید. چهار پرایمر بر اساس ناحیه حفاظت شده غیر ترجمهایی انتهای΄5 (5΄UTR) ژنوم ویروس اسهال ویروسی گاو برای تشخیص شش محل مختلف روی RNA هدف طراحی گردید. هشتاد نمونه خون از دامهای مشکوک به اسهال ویروسی گاو جمع آوری و به طور همزمان با دو روش RT-PCR وRT-LAMP تست شدند. 24 نمونه از این تعداد با روشRT-LAMP مثبت شدند. درحالیکه با روش RT-PCR بیست نمونه مثبت شدند. حد شناسایی برای روش RT-LAMP تقریبا PFU/mL70 تخمین زده شد. مقایسه روش RT-PCR با RT-LAMP نشان داد که روش جدید طراحی شده به عنوان یک روش حساس و اختصاصی توانایی تشخیص این ویروس در نمونه های کلینیکی را دارد. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| اسهال ویروسی گاو, رونوشت برداری معکوس-تکثیر هم دما به واسطه لوپ, رونوشت برداری معکوس, واکنش زنجیره ایی پلیمراز | ||
| مراجع | ||
|
Baker, J.C., 1995. The Clinical Manifestations of Bovine Viral Diarrhea Infection. Veterinary Clinics of North America: Food Anim Prac 11, 425-445. Brownlie, J., 1985. Clinical aspects of the bovine virus diarrhoea / mucosal disease complex in cattle. In Practice 7, 195. Brownlie, J., Hooper, L.B., Thompson, I., Collins, M.E., 1998. Maternal recognition of foetal infection with bovine virus diarrhoea virus (BVDV)—the bovine pestivirus. Clin Diagn Virol 10, 141-150. Carman, S., van Dreumel, T., Ridpath, J., Hazlett, M., Alves, D., Dubovi, E., et al., 1998. Severe acute bovine viral diarrhea in Ontario, 1993-1995. J Vet Diagn Invest 10, 27-35. Chen, H.T., Zhang, J., Liu, Y.S., Liu, X.T., 2011. Detection of foot-and-mouth disease virus RNA by reverse transcription loop-mediated isothermal amplification. Virol J 8, 510. Edwards, S., 1990. The diagnosis of bovine virus diarrhoea-mucosal disease in cattle. Rev Sci Tech 9, 115-130. Fan, Q., Xie, Z., Xie, L., Liu, J., Pang, Y., Deng, X., et al., 2012. A reverse transcription loop-mediated isothermal amplification method for rapid detection of bovine viral diarrhea virus. J Virol Methods 186, 43-48. Fulton, R.W., d'Offay, J.M., Saliki, J.T., Burge, L.J., Helman, R.G., Confer, A.W., et al., 1999. Nested reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) for typing ruminant pestiviruses: bovine viral diarrhea viruses and border disease virus. Can J Vet Res 63, 276-281. Gamlen, T., Richards, K.H., Mankouri, J., Hudson, L., McCauley, J., Harris, M., et al., 2010. Expression of the NS3 protease of cytopathogenic bovine viral diarrhea virus results in the induction of apoptosis but does not block activation of the beta interferon promoter. J Gen Virol 91, 133-144. Hamel, A.L., Wasylyshen, M.D., Nayar, G.P., 1995. Rapid detection of bovine viral diarrhea virus by using RNA extracted directly from assorted specimens and a one-tube reverse transcription PCR assay. J Clin Microbiol 33, 287-291. Horner, G.W., Tham, K.-M., Orr, D., Ralston, J., Rowe, S., Houghton, T., 1995. Comparison of an antigen capture enzyme-linked assay with reverse transcription — polymerase chain reaction and cell culture immunoperoxidase tests for the diagnosis of ruminant pestivirus infections. Vet Microbiol 43, 75-84. Houe, H., 1999. Epidemiological features and economical importance of bovine virus diarrhoea virus (BVDV) infections. Vet Microbiol 64, 89-107. Jiang, T., Liu, J., Deng, Y.Q., Xu, L.J., Li, X.F., Han, J.F., et al., 2011. Development and evaluation of a reverse transcription-loop-mediated isothermal amplification assay for rapid detection of enterovirus 71. J Clin Microbiol 49, 870-874. Katz, J.B., Hanson, S.K., 1987. Competitive and blocking enzyme-linked immunoassay for detection of fetal bovine serum antibodies to bovine viral diarrhea virus. J Virol Method 15, 167-175. Lanyon, S.R., Hill, F.I., Reichel, M.P., Brownlie, J., 2014. Bovine viral diarrhoea: pathogenesis and diagnosis. Vet J 199, 201-209. Moennig, V., Liess, B., 1995. Pathogenesis of intrauterine infections with bovine viral diarrhea virus. Vet Clin N Am 11, 477–487. Notomi, T., Okayama, H., Masubuchi, H., Yonekawa, T., Watanabe, K., Amino, N., et al., 2000. Loop-mediated isothermal amplification of DNA. Nucleic Acids Res 28, E63. OIE, 2008. Bovine viral diarrhoea Terrestrial Manual, World Organization for Anim Health, Paris, France. Paton, D.J., Ibata, G., Edwards, S., Wensvoort, G., 1991. An ELISA detecting antibody to conserved pestivirus epitopes. J Virol Method 31, 315-324. Rovira, A., Abrahante, J., Murtaugh, M., Munoz-Zanzi, C., 2009. Reverse transcription loop-mediated isothermal amplification for the detection of Porcine reproductive and respiratory syndrome virus. J Vet Diagn Invest 21, 350-354. Saliki, J.T., Fulton, R.W., Hull, S.R., Dubovi, E.J., 1997. Microtiter virus isolation and enzyme immunoassays for detection of bovine viral diarrhea virus in cattle serum. J Clin Microbiol 35, 803-807. Schmitt, B.J., Lopez, O.J., Ridpath, J.F., Galeota-Wheeler, J., Osorio, F.A., 1994. Evaluation of PCR for diagnosis of bovine viral diarrhea virus in tissue homogenates. J Vet Diagn Invest 6, 44-47. Shi, W., Li, K., Ji, Y., Jiang, Q., Shi, M., Mi, Z., 2011. Development and evaluation of reverse transcription-loop-mediated isothermal amplification assay for rapid detection of enterovirus 71. BMC Infect Dis 11, 197. Shirvani, E., Lotfi, M., Kamalzadeh, M., Noaman, V., Bahriari, M., Morovati, H., et al., 2012. Seroepidemiological study of bovine respiratory viruses (BRSV, BoHV-1, PI-3V, BVDV, and BAV-3) in dairy cattle in central region of Iran (Esfahan province). Trop Anim Health Prod 44, 191-195. Talebkhan Garoussi, M., Haghparast, A., Hajenejad, M.R., 2009. Prevalence of Bovine Viral Diarrhoea Virus antibodies among the industrial dairy cattle herds in suburb of Mashhad-Iran. Trop Anim Health Prod 41, 663-667. Vilcek, S., Herri ng, A.J., Herring, J.A., Nettleton, P.F., Lowings, J.P., Paton, D.J., 1994. Pestiviruses isolated from pigs, cattle and sheep can be allocated into at least three genogroups using polymerase chain reaction and restriction endonuclease analysis. Arch Virol 136, 309-323. Vilcek, S., Paton, D.J., Durkovic, B., Strojny, L., Ibata, G., Moussa, A., et al., 2001. Bovine viral diarrhoea virus genotype 1 can be separated into at least eleven genetic groups. Arch Virol 146, 99-115. Yang, J.L., Zhang, S.H., Liu, Z.H., Yang, R., Huang, Y.,Wen, M., 2012. Development and evaluation of a loop-mediated isothermal amplification assay for the rapid detection of porcine cytomegalovirus under field conditions. Virol J 9, 321. Zhang, N., Liu, Z., Han, Q., Qiu, J., Chen, J., Zhang, G., et al., 2011. Development of one-step SYBR Green real-time RT-PCR for quantifying bovine viral diarrhea virus type-1 and its comparison with conventional RT-PCR. Virol J 8, 374. Zhang, S.Q., Tan, B., Li, P., Wang, F.X., Guo, L., Yang, Y., et al., 2014. Comparison of conventional RT-PCR, reverse-transcription loop-mediated isothermal amplification, and SYBR green I-based real-time RT-PCR in the rapid detection of bovine viral diarrhea virus nucleotide in contaminated commercial bovine sera batches. J Virol Methods 207, 204-209.
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 845 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 667 |
||
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب