Sharifi, Kasra, Zare, Rasoul, Zamanizadeh, Hamid Reza, Mirabolfathy, Mansoureh, Rezaee, Saeed. (1395). Identification of Fusarium species associated with Fusarium head blight of wheat in the North of Iran and phylogenetic analysis of the dominant species. سامانه مدیریت نشریات علمی, 17(2), 173-187. doi: 10.22092/botany.2017.109430
Kasra Sharifi; Rasoul Zare; Hamid Reza Zamanizadeh; Mansoureh Mirabolfathy; Saeed Rezaee. "Identification of Fusarium species associated with Fusarium head blight of wheat in the North of Iran and phylogenetic analysis of the dominant species". سامانه مدیریت نشریات علمی, 17, 2, 1395, 173-187. doi: 10.22092/botany.2017.109430
Sharifi, Kasra, Zare, Rasoul, Zamanizadeh, Hamid Reza, Mirabolfathy, Mansoureh, Rezaee, Saeed. (1395). 'Identification of Fusarium species associated with Fusarium head blight of wheat in the North of Iran and phylogenetic analysis of the dominant species', سامانه مدیریت نشریات علمی, 17(2), pp. 173-187. doi: 10.22092/botany.2017.109430
Sharifi, Kasra, Zare, Rasoul, Zamanizadeh, Hamid Reza, Mirabolfathy, Mansoureh, Rezaee, Saeed. Identification of Fusarium species associated with Fusarium head blight of wheat in the North of Iran and phylogenetic analysis of the dominant species. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1395; 17(2): 173-187. doi: 10.22092/botany.2017.109430
Identification of Fusarium species associated with Fusarium head blight of wheat in the North of Iran and phylogenetic analysis of the dominant species
1PhD Student, Department of Plant Pathology, College of Agriculture and Natural Resources, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
2Research Prof., Iranian Research Institute of Plant Protection, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Tehran, Iran
3Prof., Department of Plant Pathology, College of Agriculture and Natural Resources, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran (hzamani@srbiau.ac.ir)
4Assistant Prof., Department of Plant Pathology, College of Agriculture and Natural Resources, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
چکیده
In order to determine the causal agents of Fusarium head blight, during 2015–16, wheat heads with disease symptom were collected from 10 and six main wheat production areas of Golestan and Mazandaran provinces (N Iran), respectively. A total of 431 Fusarium isolates were obtained belonging to nine Fusarium species based on their morphological characteristics. Fusarium graminearum species complex had the highest frequency among the species in both provinces, Golestan (52.0%) and Mazandaran (55.8%). Fusarium culmorum, F. equiseti, F. Acuminatum, and F. compactum had the highest mean of frequency in both provinces with 13.5, 9.7, 6.0 and 3.7%, respectively after F. graminearum. Also, F. cerealis, F. Avenaceum, and F. proliferatum and some unidentified isolates a total of 14% of the isolates were calculated. The lowest frequency was related to F. subglutinans (1%) that was isolated only from Golestan province. In order to determine the phylogeny of F. graminearum species complex in the North Iran, 53 out of 229 isolates were selected based on their distribution in the sampled areas. Partial genes of translation elongation factor 1-alpha (TEF) and putative reductase (RED) were amplified using specific primers. A commercial sequencing facility was used to generate fungal sequences. Almost all strains of F. graminearum species complex belonged to F. graminearum sensu stricto. The results indicated a homogeniety within F. graminearum species complex, however, there was a minor morphologically differences between some strains.
شناسایی گونههای فوزاریوم مرتبط با بلایت خوشه گندم و تجزیه فیلوژنتیکی گونه غالب در شمال ایران
نویسندگان [English]
کسری شریفی1؛ رسول زارع2؛ حمیدرضا زمانیزاده3؛ منصوره میرابوالفتحی2؛ سعید رضائی4
1دانشجوی دکتری بیماریشناسی گیاهی، گروه بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران
2استاد پژوهش، مؤسسه تحقیقات گیاهپزشکی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران
3استاد گروه بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران (hzamani@srbiau.ac.ir)
4استادیار گروه بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران
چکیده [English]
به منظور تعیین عوامل بیماری بلایت فوزاریومی، خوشههای گندم با علایم بیماری از 10 و شش منطقه مهم کشت گندم به ترتیب از استانهای گلستان و مازندران در سال زراعی 95-1394 نمونهبرداری شد. براساس خصوصیات ریختشناسی، 431 جدایه منسوب به فوزاریوم تشخیص داده شد که به نه گونه مختلف تعلق داشتند. گونه مرکب Fusarium graminearum بیشترین فراوانی را در استانهای گلستان (52%) و مازندران (8/55%) داشت. قارچهای F. culmorum،F. equiseti،F. acuminatumوF. compactumپس از F. graminearum به ترتیب با میانگینهای 5/13، 7/9، 6 و 7/3% در دو استان مذکور بیشترین فراوانی را داشتند. میانگین فراوانی F. cerealis، F. avenaceum،F. proliferatum و جدایههای شناسایی نشده در مجموع 14% در شمال ایران برآورد شد. کمترین فراوانی (1%) مربوط به قارچ F. subglutinans بود که فقط از نمونههای استان گلستان جدا شد. برای تعیین خصوصیات ریختشناسی و فیلوژنتیکی گونه مرکب F. graminearum، 53 جدایه از بین 229 جدایه به دست آمده از استانهای مذکور براساس مناطق انتشار انتخاب شد. بخشی از ژنهای translation elongation factor 1-alpha (TEF) وreductase (RED) با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر و تعیین توالی شد. همه سویههای گونه مرکب F. graminearum متعلق به F. graminearum sensu stricto بودند. دادههای فیلوژنتیکی نشاندهنده وجود همگنی ژنتیکی در بین جمعیت مربوط به گونه مرکب F. graminearum بود، اگرچه بین بعضی از سویههای این گونه اختلافات کوچک ریختشناسی وجود داشت.