| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 2,996 |
| تعداد مقالات | 33,553 |
| تعداد مشاهده مقاله | 44,160,441 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 20,533,933 |
Cloning and sequencing of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) interferon regulatory factor 7 | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقاله 3، دوره 62، شماره 4، اسفند 2007، صفحه 199-205 اصل مقاله (717 K) | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2007.103755 | ||
| نویسندگان | ||
| S. Bird؛ C. Wodstra؛ M. Akhlaghi* | ||
| چکیده | ||
| Interferon regulatory factor 7 (IRF7) gene was cloned from a subtractive cDNA library constructed with mRNAs obtained from rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) macrophage cell line (RTS-11). Using expressed sequence tag clones of submitted IRF7 amino acid sequences, specific primers were designed. Results showed that IRF7 cDNA contains an ORF of 1251 nucleotides that translates into a 416 residues putative peptide. The 5' untranslated region containing 102 nucleotides and the 3' UTR of the transcript consists of 645 nucleotides. The start codon of this ORF is located at nt 103 to 105 and lies in favorable sequence context for the initiation of translation. Alignment between the rainbow trout IRF7 and others IRF7s indicated that the predicted trout IRF7 association domain was located in residues 204-371 aa. The rainbow trout IRF7 nucleotide sequence is most similar to fish IRF7 with 41% identity for crucian carp, Carssius auratus, 45% for zebrafish, Danio rerio, and to mammalian IRF7 with 23% for human, Homo sapiens and 7% for mouse, Mus musculus identity overall. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Cloning؛ Sequencing؛ Interferon regulatory factor 7 (IRF7)؛ cDNA؛ Rainbow trout | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| کلونینگ و تعیین توالی ژن کد کننده فاکتور 7 تنظیم کننده اینترفرون در ماهی قزل آلای رنگین کمان | ||
| نویسندگان [English] | ||
| S. Bird؛ C. Wodstra؛ مصطفی اخلاقی | ||
| چکیده [English] | ||
| در این تحقیق ژن کد کننده فاکتور 7 تنظیم کننده اینترفرون بدست آمده از cDNA تیره سلولی ماکروفاژهای ماهی قزل آلای رنگین کمان کلون گردید. با استفاده از توالی آمینو اسیدهای فاکتور 7 تنظیم کننده اینترفرونIRF7 توصیف شده، پرایمرهای مربوطه طراحی شد. نتایج بدست آمده نشان داد IRF7cDNA دارای1251 نوکلئوتید قابل ترجمه به 416 پپتید در چارچوب خوانای باز خود است که در قسمت َ5 و َ3 منطقه غیر قابل ترجمه خود بترتیب حاوی 102 و 645 نوکلئوتید می باشد. شروع کدون چارچوب خوانای باز ژن IRF7 ماهی قزل آلای رنگین کمان برای ترجمه در نوکلئوتید 103 تا 105 قرار دارد. در ردیف نمودنIRF7 ماهی قزل آلای رنگین کمان و سایر IRFs توصیف شده نشان داده شد حوزه این ژن در فاصله 204 و 371 نوکلئوتیدی قرار دارد. توالی نوکلئوتیدی ژنIRF7 ماهی قزل آلای رنگین کمان بیشترین شباهت را بمیزان 41 درصد با همین ژن در ماهی کپور و 45 درصد با ماهی گورخری در ماهیها و 23 درصد شباهت با همین ژن در انسان و 7 در صد مشابهت با IRF7 موش دارد. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| کلونینگ, تعیین توالی, فاکتور7 تنظیم کننده اینترفرون, قزل آلای رنگین کمان | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 15,125 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,012 |
||