Mostowfizadeh-Ghalamfarsa, R., Jamali, S., Banihashemi, Z.. (1389). Molecular phylogeny of three desert truffles from Iran based on ribosomal genome. سامانه مدیریت نشریات علمی, 11(2), 151-162.
R. Mostowfizadeh-Ghalamfarsa; S. Jamali; Z. Banihashemi. "Molecular phylogeny of three desert truffles from Iran based on ribosomal genome". سامانه مدیریت نشریات علمی, 11, 2, 1389, 151-162.
Mostowfizadeh-Ghalamfarsa, R., Jamali, S., Banihashemi, Z.. (1389). 'Molecular phylogeny of three desert truffles from Iran based on ribosomal genome', سامانه مدیریت نشریات علمی, 11(2), pp. 151-162.
Mostowfizadeh-Ghalamfarsa, R., Jamali, S., Banihashemi, Z.. Molecular phylogeny of three desert truffles from Iran based on ribosomal genome. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1389; 11(2): 151-162.
Molecular phylogeny of three desert truffles from Iran based on ribosomal genome
1Assistant Prof., Department of Plant Protection, School of Agriculture, Shiraz University, Bajgah, Shiraz 7144133111, Iran (E-mail: rmostofi@shirazu.ac.ir)
2Ph.D. student,, Department of Plant Protection, School of Agriculture, Shiraz University, Bajgah, Shiraz 7144133111, Iran
3Prof., Department of Plant Protection, School of Agriculture, Shiraz University, Bajgah, Shiraz 7144133111, Iran
چکیده
The ITS region including the 5.8S gene of rDNA of three desert truffle species were amplified using ITS4 and ITS1 primers. The ITS sequences were compared to those of other related authentic sequences obtained from GenBank. Among 12 specimens studied, seven isolates corresponded to Terfezia claveryi reported by other authors. Iranian T. claveryi specimens had an average similarity of 99.4% (range 98.7–100%) among themselves, while all T. claveryi sequences analyzed had an average of 95.2% (range 87.2–100%) similarity. Four specimens corresponded to Trimania pinoyi, being a sister taxon to Tirmania nivea, of whichonly one specimen could be studied. Iranian T.pinoyi specimenshad an average of 99.9% similarity (range 99.8–100%) among themselves, and 97.2% (range 93.1– 100%) between all T. pinoyi sequences compared.
1استادیار بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، باجگاه، شیراز، کد پستی 7144133111. (E-mail: rmostofi@shirazu.ac.ir)
2دانشجوی دکتری بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، باجگاه، شیراز، کد پستی 7144133111.
3استاد بخش گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، باجگاه، شیراز، کد پستی 7144133111.
چکیده [English]
نمونههایی از سه گونه دنبلان کوهی از مناطق مختلف جغرافیایی ایران جمعآوری شد. منطقه ITS شامل ژنS 8/5 از rDNA با استفاده از آغازگرهای عمومی ITS4 وITS1 تکثیر و توالییابی شد. توالیهای به دست آمده با سایر آرایههای معتبرِ مستخرج از بانک ژن مقایسه شد. در میان 12 نمونه مطالعه شده، هفت جدایه با نمونههای Terfezia claveryi گزارش شده توسط سایر محققان، مطابقت داشت. نمونههای T. claveryi ایرانی به طور میانگین 4/99% (با دامنه 7/98-100%) با یکدیگر تشابه داشتند، در حالی که میانگین تشابه کلیه T. claveryi های مورد مطالعه2/95% (با دامنه 2/87-100%) بود. چهار نمونه مطابق با Trimania pinoyi، به صورت آرایه خواهری Tirmania nivea خود را نشان دادند که از گونه اخیر تنها یک نمونه یافت شد. نمونههای T. pinoyi ایران دارای 9/99% میانگین تشابه (با دامنه 8/99-100%) در بین خود و 2/97% (با دامنه 1/93-100%) میانگین تشابه در بین کلیه توالیهای مورد مقایسه بودند.
کلیدواژهها [English]
آسکومیکوتا, فیلوژنی, قارچریشههای برونی, توالیهای جداکننده نسخهبرداری شده داخلی